NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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651680 |
6u79   |
30665 | cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 263 |
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1 "Conversion project" NMR . parsed_6u79 1
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_Related_entries.Entry_ID
PDB 6u79 "Master copy" parsed_6u79
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1 6u79.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6u79 1
1 6u79.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 609 parsed_6u79 1
1 6u79.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 74 parsed_6u79 1
1 6u79.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 263 parsed_6u79 1
1 6u79.mr . . XPLOR/CNS 5 planarity "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6u79 1
1 6u79.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6u79 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_6u79
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_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
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1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -30.0 -10.0 . . 1 . O4' . 1 . C1' . 1 . C2' . 1 . C3' parsed_6u79 1
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8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -240.0 -60.0 . . 2 . O4' . 2 . C1' . 2 . N9 . 2 . C4 parsed_6u79 1
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1
;
Torsion angle restraints for sugar pucker in the
- WNV
Pucker is defined with ribose torsion angles nu1 and nu2.
nu1 = O4'-C1'-C2'-C3'
nu2 = C1'-C2'-C3'-C4'
"N" C3' endo:
nu1 = -20 +/- 10
nu2 = +35 +/- 5
"S" C2' endo:
nu1 = +35 +/- 10
nu2 = -35 +/- 5
See Saenger page 20.
C2' endo nucleotides (Judging from TOCSY): only if both H1'-H2'' and
H1'-H3' couplings both are strong (intensity of H1'-H3' even larger)
Xhi is defined as follows...
Purines = O4'-C1'-N9-C4
pyrimidine = O4'-C1'-N1-C2
Anti:
Xhi = 180.0 +/- 90.0
including high-anti and excluding high-syn :
Xhi = =-150 +/- 90.0
Syn: Xhi = 0.0 +/- 90.0
See Saenger page 22.
3' endo!
G1
;
1 1 37 11 parsed_6u79 1
2 G2 53 1 53 7 parsed_6u79 1
3 "backbone beta" 67 1 67 15 parsed_6u79 1
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