NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
614390 |
5jyv   |
30093 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 3235 |
data_5jyv_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_5jyv
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_5jyv 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_5jyv
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 5jyv "Master copy" parsed_5jyv
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_5jyv
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 5jyv.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5jyv 1
1 5jyv.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE ambi 737 parsed_5jyv 1
1 5jyv.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 376 parsed_5jyv 1
1 5jyv.mr . . XPLOR/CNS 4 distance NOE ambi 879 parsed_5jyv 1
1 5jyv.mr . . XPLOR/CNS 5 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 96 parsed_5jyv 1
1 5jyv.mr . . XPLOR/CNS 6 distance NOE ambi 1055 parsed_5jyv 1
1 5jyv.mr . . XPLOR/CNS 7 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 92 parsed_5jyv 1
1 5jyv.mr . . "MR format" 8 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5jyv 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_5jyv
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER SIGALING PROTEIN 15-MAY-16 5JYV
*TITLE NMR STRUCTURE OF FOLDSWITCH-STABLIZED KAIB IN COMPLEX WITH PSEUDO
*TITLE 2 RECEIVER DOMAIN OF CIKA FROM THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: TWO-COMPONENT SENSOR HISTIDINE KINASE;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES;
*COMPND 5 MOL_ID: 2;
*COMPND 6 MOLECULE: CIRCADIAN CLOCK PROTEIN KAIB;
*COMPND 7 CHAIN: B;
*COMPND 8 ENGINEERED: YES;
*COMPND 9 MUTATION: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS (STRAIN BP-1);
*SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 197221;
*SOURCE 4 STRAIN: BP-1;
*SOURCE 5 GENE: TLL0899;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI 'BL21-GOLD(DE3)PLYSS AG';
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 866768;
*SOURCE 8 MOL_ID: 2;
*SOURCE 9 ORGANISM_SCIENTIFIC: THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS;
*SOURCE 10 ORGANISM_TAXID: 197221;
*SOURCE 11 STRAIN: BP-1;
*SOURCE 12 GENE: KAIB, TLR0482;
*SOURCE 13 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI 'BL21-GOLD(DE3)PLYSS AG';
*SOURCE 14 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 866768
*KEYWDS CIRCADIAN CLOCK, SIGNALING PROTEIN COMPLEX, SIGALING PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR R.D.TSENG,A.L.LIWANG
*REVDAT 1 29-MAR-17 5JYV 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5jyv
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_5jyv 1
2 1 . . . parsed_5jyv 1
3 1 . . . parsed_5jyv 1
4 1 . . . parsed_5jyv 1
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15 1 . . . parsed_5jyv 1
16 1 . . . parsed_5jyv 1
17 1 . . . parsed_5jyv 1
18 1 . . . parsed_5jyv 1
19 1 . . . parsed_5jyv 1
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23 1 . . . parsed_5jyv 1
24 1 . . . parsed_5jyv 1
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337 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -95.6 -45.0 . . 279 . C . 280 . N . 280 . CA . 280 . C parsed_5jyv 1
338 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -29.9 10.1 . . 280 . N . 280 . CA . 280 . C . 281 . N parsed_5jyv 1
339 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -104.1 -64.1 . . 280 . C . 281 . N . 281 . CA . 281 . C parsed_5jyv 1
340 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -30.2 9.8 . . 281 . N . 281 . CA . 281 . C . 282 . N parsed_5jyv 1
341 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -135.2 -80.4 . . 281 . C . 282 . N . 282 . CA . 282 . C parsed_5jyv 1
342 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76.2 137.0 . . 282 . N . 282 . CA . 282 . C . 283 . N parsed_5jyv 1
343 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -80.2 -40.2 . . 282 . C . 283 . N . 283 . CA . 283 . C parsed_5jyv 1
344 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -60.1 -20.1 . . 283 . N . 283 . CA . 283 . C . 284 . N parsed_5jyv 1
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353 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.0 -45.0 . . 287 . C . 288 . N . 288 . CA . 288 . C parsed_5jyv 1
354 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -63.5 -23.5 . . 288 . N . 288 . CA . 288 . C . 289 . N parsed_5jyv 1
355 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -84.1 -44.1 . . 288 . C . 289 . N . 289 . CA . 289 . C parsed_5jyv 1
356 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -61.7 -21.7 . . 289 . N . 289 . CA . 289 . C . 290 . N parsed_5jyv 1
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362 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -58.2 -18.2 . . 292 . N . 292 . CA . 292 . C . 293 . N parsed_5jyv 1
363 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -88.1 -48.1 . . 292 . C . 293 . N . 293 . CA . 293 . C parsed_5jyv 1
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365 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -84.9 -44.9 . . 293 . C . 294 . N . 294 . CA . 294 . C parsed_5jyv 1
366 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -56.8 -16.8 . . 294 . N . 294 . CA . 294 . C . 295 . N parsed_5jyv 1
367 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -89.0 -49.0 . . 294 . C . 295 . N . 295 . CA . 295 . C parsed_5jyv 1
368 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -56.1 -16.1 . . 295 . N . 295 . CA . 295 . C . 296 . N parsed_5jyv 1
369 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -87.4 -47.4 . . 295 . C . 296 . N . 296 . CA . 296 . C parsed_5jyv 1
370 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -56.9 -16.9 . . 296 . N . 296 . CA . 296 . C . 297 . N parsed_5jyv 1
371 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -89.5 -49.5 . . 296 . C . 297 . N . 297 . CA . 297 . C parsed_5jyv 1
372 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -47.8 -7.8 . . 297 . N . 297 . CA . 297 . C . 298 . N parsed_5jyv 1
373 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -89.9 -49.9 . . 297 . C . 298 . N . 298 . CA . 298 . C parsed_5jyv 1
374 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -36.2 3.8 . . 298 . N . 298 . CA . 298 . C . 299 . N parsed_5jyv 1
375 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58.9 118.9 . . 237 . C . 238 . N . 238 . CA . 238 . C parsed_5jyv 1
376 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -42.7 27.1 . . 238 . N . 238 . CA . 238 . C . 239 . N parsed_5jyv 1
stop_
loop_
_TA_constraint_comment_org.ID
_TA_constraint_comment_org.Comment_text
_TA_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_TA_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_TA_constraint_comment_org.Comment_end_line
_TA_constraint_comment_org.Comment_end_column
_TA_constraint_comment_org.Entry_ID
_TA_constraint_comment_org.Torsion_angle_constraint_list_ID
1
;
Phi/Psi Angles From 'Strong' TALOS-N Predictions:
error margins are set to conservative default values of double the
standard deviation observed in TALOS-N capped at a minimum of +/-20 degree.
;
2 1 4 81 parsed_5jyv 1
2 "increased 20" 119 1 119 21 parsed_5jyv 1
3 "increased 20" 158 1 158 21 parsed_5jyv 1
4 "increased 20" 161 1 161 21 parsed_5jyv 1
5 "increased 20" 168 1 168 21 parsed_5jyv 1
6
;
Phi/Psi Angles From 'Generous' TALOS-N Predictions:
error margins are set to default values of triple the standard
deviation observed in TALOS-N capped at a minimum of +/-20 degree.
;
394 1 396 72 parsed_5jyv 1
7
;
Phi/Psi Angles From 'Strong' TALOS-N Predictions:
error margins are set to conservative default values of double the
standard deviation observed in TALOS-N capped at a minimum of +/-20 degree.
;
418 1 420 81 parsed_5jyv 1
8
;
Phi/Psi Angles From 'Generous' TALOS-N Predictions:
error margins are set to default values of triple the standard
deviation observed in TALOS-N capped at a minimum of +/-20 degree.
;
766 1 768 72 parsed_5jyv 1
stop_
loop_
_TA_constraint_parse_err.ID
_TA_constraint_parse_err.Content
_TA_constraint_parse_err.Begin_line
_TA_constraint_parse_err.Begin_column
_TA_constraint_parse_err.End_line
_TA_constraint_parse_err.End_column
_TA_constraint_parse_err.Entry_ID
_TA_constraint_parse_err.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 2: complex_dihedral.tbl" 1 1 1 41 parsed_5jyv 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5jyv
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_5jyv 2
2 1 . . . parsed_5jyv 2
3 1 . . . parsed_5jyv 2
4 1 . . . parsed_5jyv 2
5 1 . . . parsed_5jyv 2
6 1 . . . parsed_5jyv 2
7 1 . . . parsed_5jyv 2
8 1 . . . parsed_5jyv 2
9 1 . . . parsed_5jyv 2
10 1 . . . parsed_5jyv 2
11 1 . . . parsed_5jyv 2
12 1 . . . parsed_5jyv 2
13 1 . . . parsed_5jyv 2
14 1 . . . parsed_5jyv 2
15 1 . . . parsed_5jyv 2
16 1 . . . parsed_5jyv 2
17 1 . . . parsed_5jyv 2
18 1 . . . parsed_5jyv 2
19 1 . . . parsed_5jyv 2
20 1 . . . parsed_5jyv 2
21 1 . . . parsed_5jyv 2
22 1 . . . parsed_5jyv 2
23 1 . . . parsed_5jyv 2
24 1 . . . parsed_5jyv 2
25 1 . . . parsed_5jyv 2
26 1 . . . parsed_5jyv 2
27 1 . . . parsed_5jyv 2
28 1 . . . parsed_5jyv 2
29 1 . . . parsed_5jyv 2
30 1 . . . parsed_5jyv 2
31 1 . . . parsed_5jyv 2
32 1 . . . parsed_5jyv 2
33 1 . . . parsed_5jyv 2
34 1 . . . parsed_5jyv 2
35 1 . . . parsed_5jyv 2
36 1 . . . parsed_5jyv 2
37 1 . . . parsed_5jyv 2
38 1 . . . parsed_5jyv 2
39 1 . . . parsed_5jyv 2
40 1 . . . parsed_5jyv 2
41 1 . . . parsed_5jyv 2
42 1 . . . parsed_5jyv 2
43 1 . . . parsed_5jyv 2
44 1 . . . parsed_5jyv 2
45 1 . . . parsed_5jyv 2
46 1 . . . parsed_5jyv 2
47 1 . . . parsed_5jyv 2
48 1 . . . parsed_5jyv 2
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50 1 . . . parsed_5jyv 2
51 1 . . . parsed_5jyv 2
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55 1 . . . parsed_5jyv 2
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58 1 . . . parsed_5jyv 2
59 1 . . . parsed_5jyv 2
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61 1 . . . parsed_5jyv 2
62 1 . . . parsed_5jyv 2
63 1 . . . parsed_5jyv 2
64 1 . . . parsed_5jyv 2
65 1 . . . parsed_5jyv 2
66 1 . . . parsed_5jyv 2
67 1 . . . parsed_5jyv 2
68 1 . . . parsed_5jyv 2
69 1 . . . parsed_5jyv 2
70 1 . . . parsed_5jyv 2
71 1 . . . parsed_5jyv 2
72 1 . . . parsed_5jyv 2
73 1 . . . parsed_5jyv 2
74 1 . . . parsed_5jyv 2
75 1 . . . parsed_5jyv 2
76 1 . . . parsed_5jyv 2
77 1 . . . parsed_5jyv 2
78 1 . . . parsed_5jyv 2
79 1 . . . parsed_5jyv 2
80 1 . . . parsed_5jyv 2
81 1 . . . parsed_5jyv 2
82 1 . . . parsed_5jyv 2
83 1 . . . parsed_5jyv 2
84 1 . . . parsed_5jyv 2
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87 1 . . . parsed_5jyv 2
88 1 . . . parsed_5jyv 2
89 1 . . . parsed_5jyv 2
90 1 . . . parsed_5jyv 2
91 1 . . . parsed_5jyv 2
92 1 . . . parsed_5jyv 2
93 1 . . . parsed_5jyv 2
94 1 . . . parsed_5jyv 2
95 1 . . . parsed_5jyv 2
96 1 . . . parsed_5jyv 2
97 1 . . . parsed_5jyv 2
98 1 . . . parsed_5jyv 2
99 1 . . . parsed_5jyv 2
100 1 . . . parsed_5jyv 2
101 1 . . . parsed_5jyv 2
102 1 . . . parsed_5jyv 2
103 1 . . . parsed_5jyv 2
104 1 . . . parsed_5jyv 2
105 1 . . . parsed_5jyv 2
106 1 . . . parsed_5jyv 2
107 1 . . . parsed_5jyv 2
108 1 . . . parsed_5jyv 2
109 1 . . . parsed_5jyv 2
110 1 . . . parsed_5jyv 2
111 1 . . . parsed_5jyv 2
112 1 . . . parsed_5jyv 2
113 1 . . . parsed_5jyv 2
114 1 . . . parsed_5jyv 2
115 1 . . . parsed_5jyv 2
116 1 . . . parsed_5jyv 2
117 1 . . . parsed_5jyv 2
118 1 . . . parsed_5jyv 2
119 1 . . . parsed_5jyv 2
120 1 . . . parsed_5jyv 2
121 1 . . . parsed_5jyv 2
122 1 . . . parsed_5jyv 2
123 1 . . . parsed_5jyv 2
124 1 . . . parsed_5jyv 2
125 1 . . . parsed_5jyv 2
126 1 . . . parsed_5jyv 2
127 1 . . . parsed_5jyv 2
128 1 . . . parsed_5jyv 2
129 1 . . . parsed_5jyv 2
130 1 . . . parsed_5jyv 2
131 1 . . . parsed_5jyv 2
132 1 . . . parsed_5jyv 2
133 1 . . . parsed_5jyv 2
134 1 . . . parsed_5jyv 2
135 1 . . . parsed_5jyv 2
136 1 . . . parsed_5jyv 2
137 1 . . . parsed_5jyv 2
138 1 . . . parsed_5jyv 2
139 1 . . . parsed_5jyv 2
140 1 . . . parsed_5jyv 2
141 1 . . . parsed_5jyv 2
142 1 . . . parsed_5jyv 2
143 1 . . . parsed_5jyv 2
144 1 . . . parsed_5jyv 2
145 1 . . . parsed_5jyv 2
146 1 . . . parsed_5jyv 2
147 1 . . . parsed_5jyv 2
148 1 . . . parsed_5jyv 2
149 1 . . . parsed_5jyv 2
150 1 . . . parsed_5jyv 2
151 1 . . . parsed_5jyv 2
152 1 . . . parsed_5jyv 2
153 1 . . . parsed_5jyv 2
154 1 . . . parsed_5jyv 2
155 1 . . . parsed_5jyv 2
156 1 . . . parsed_5jyv 2
157 1 . . . parsed_5jyv 2
158 1 . . . parsed_5jyv 2
159 1 . . . parsed_5jyv 2
160 1 . . . parsed_5jyv 2
161 1 . . . parsed_5jyv 2
162 1 . . . parsed_5jyv 2
163 1 . . . parsed_5jyv 2
164 1 . . . parsed_5jyv 2
165 1 . . . parsed_5jyv 2
166 1 . . . parsed_5jyv 2
167 1 . . . parsed_5jyv 2
168 1 . . . parsed_5jyv 2
169 1 . . . parsed_5jyv 2
170 1 . . . parsed_5jyv 2
171 1 . . . parsed_5jyv 2
172 1 . . . parsed_5jyv 2
173 1 . . . parsed_5jyv 2
174 1 . . . parsed_5jyv 2
175 1 . . . parsed_5jyv 2
176 1 . . . parsed_5jyv 2
177 1 . . . parsed_5jyv 2
178 1 . . . parsed_5jyv 2
179 1 . . . parsed_5jyv 2
180 1 . . . parsed_5jyv 2
181 1 . . . parsed_5jyv 2
182 1 . . . parsed_5jyv 2
183 1 . . . parsed_5jyv 2
184 1 . . . parsed_5jyv 2
185 1 . . . parsed_5jyv 2
186 1 . . . parsed_5jyv 2
187 1 . . . parsed_5jyv 2
188 1 . . . parsed_5jyv 2
189 1 . . . parsed_5jyv 2
190 1 . . . parsed_5jyv 2
191 1 . . . parsed_5jyv 2
192 1 . . . parsed_5jyv 2
193 1 . . . parsed_5jyv 2
194 1 . . . parsed_5jyv 2
195 1 . . . parsed_5jyv 2
196 1 . . . parsed_5jyv 2
197 1 . . . parsed_5jyv 2
198 1 . . . parsed_5jyv 2
199 1 . . . parsed_5jyv 2
200 1 . . . parsed_5jyv 2
201 1 . . . parsed_5jyv 2
202 1 . . . parsed_5jyv 2
203 1 . . . parsed_5jyv 2
204 1 . . . parsed_5jyv 2
205 1 . . . parsed_5jyv 2
206 1 . . . parsed_5jyv 2
207 1 . . . parsed_5jyv 2
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stop_
loop_
_RDC_constraint_parse_err.ID
_RDC_constraint_parse_err.Content
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2 "# Restraints file 6: DCA-C_ThCikA_gel_complex_complete.tbl" 142 1 142 58 parsed_5jyv 1
3 "# Restraints file 7: DH-CA_ThCikA_gel_complex_complete.tbl" 346 1 346 58 parsed_5jyv 1
4 "# Restraints file 8: DNH_gel_cika_2D_RDC.tbl" 396 1 396 44 parsed_5jyv 1
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_Distance_constraint_list.Block_ID 6
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
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2 "# Restraints file 12: DNH_gel_TB_2D_RDC.tbl" 198 1 198 43 parsed_5jyv 2
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Contact the webmaster for help, if required. Friday, May 3, 2024 10:08:47 AM GMT (wattos1)