NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
604277 | 5jyn | 30090 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_5jyn save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 546 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 3908 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 14962.084 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 1.214 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.1944 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.1218 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.2552 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 2 TRP 1.444 0.266 13 0 "[ . 1 .]" 1 3 LEU 17.000 0.869 14 13 "[****.-****** +*]" 1 4 TRP 24.502 0.805 3 10 "[**+ ****-* *.]" 1 5 TYR 18.054 0.568 1 4 "[+ * -1 *.]" 1 6 ILE 20.719 0.869 14 13 "[****.-****** +*]" 1 7 ARG 24.317 0.748 8 11 "[** *** + ** ***]" 1 8 ILE 46.935 0.914 12 14 "[*-******** +***]" 1 9 PHE 17.369 0.688 13 10 "[ ***-****1 +*.]" 1 10 ILE 11.094 0.474 10 0 "[ . 1 .]" 1 11 ILE 17.164 0.965 12 11 "[****.* - 1*+***]" 1 12 ILE 11.414 0.914 12 12 "[*-* *** ** +***]" 1 13 VAL 5.892 0.467 15 0 "[ . 1 .]" 1 14 GLY 1.704 0.325 5 0 "[ . 1 .]" 1 15 SER 11.039 0.965 12 2 "[ - . 1 + .]" 1 16 LEU 11.807 0.384 5 0 "[ . 1 .]" 1 17 ILE 10.781 0.675 14 3 "[ * 1 +-]" 1 18 GLY 15.727 0.675 14 3 "[ * 1 +-]" 1 19 LEU 12.602 0.758 15 3 "[ . 1 * -+]" 1 20 ARG 10.646 0.544 5 1 "[ + 1 .]" 1 21 ILE 4.737 0.412 13 0 "[ . 1 .]" 1 22 VAL 18.919 0.758 15 6 "[-* * 1 * *+]" 1 23 PHE 16.236 0.956 8 7 "[ - . *+ **** .]" 1 24 ALA 13.925 0.451 1 0 "[ . 1 .]" 1 25 VAL 12.195 0.727 2 3 "[-+ * 1 .]" 1 26 LEU 33.155 0.956 8 11 "[ -* .**+***** *]" 1 27 SER 23.518 0.907 1 15 [+*************-] 1 28 LEU 29.192 0.589 8 5 "[ * . + 1* *-]" 1 29 VAL 19.746 0.580 1 4 "[+- *. * .]" 1 30 ASN 19.583 0.821 15 8 "[*- *.* *** +]" 1 31 ARG 47.202 0.907 1 15 [+*************-] 1 32 VAL 17.848 0.699 4 9 "[ **+. - 1*****]" 1 33 ARG 15.350 0.791 5 5 "[*- + *1 *.]" 1 34 GLN 6.129 0.598 3 4 "[ + .* * 1 - .]" 1 35 GLY 3.331 0.470 11 0 "[ . 1 .]" 1 36 TYR 21.632 0.726 15 9 "[*-**. **1 **+]" 1 37 SER 17.331 1.016 11 15 [***-******+****] 1 38 PRO 8.889 0.716 14 10 "[ * *****-* *+.]" 1 39 LEU 13.936 1.016 11 15 [**-*******+****] 2 2 TRP 1.672 0.332 9 0 "[ . 1 .]" 2 3 LEU 16.435 0.868 1 9 "[+*-*.* **** .]" 2 4 TRP 24.532 0.871 3 12 "[ *+*.** **-****]" 2 5 TYR 19.256 0.573 10 4 "[ . +*-* .]" 2 6 ILE 22.421 0.868 1 10 "[+***.- ***** .]" 2 7 ARG 22.118 0.871 3 11 "[ *+*.****- ***]" 2 8 ILE 45.227 0.796 10 15 [*********+-****] 2 9 PHE 19.035 0.791 8 10 "[- **.**+** ** .]" 2 10 ILE 12.825 0.613 15 1 "[ . 1 +]" 2 11 ILE 15.223 0.819 4 10 "[ *+.****- ***]" 2 12 ILE 10.571 0.796 10 9 "[ * *.-** + ***.]" 2 13 VAL 4.420 0.408 8 0 "[ . 1 .]" 2 14 GLY 1.193 0.225 2 0 "[ . 1 .]" 2 15 SER 11.183 0.510 13 1 "[ . 1 + .]" 2 16 LEU 12.318 0.481 14 0 "[ . 1 .]" 2 17 ILE 11.277 0.681 12 6 "[ * .** 1 + *-]" 2 18 GLY 13.980 0.681 12 5 "[ * . * 1 + *-]" 2 19 LEU 13.005 0.730 1 1 "[+ . 1 .]" 2 20 ARG 12.213 0.568 13 2 "[ .- 1 + .]" 2 21 ILE 5.352 1.156 10 1 "[ . + .]" 2 22 VAL 18.081 1.156 10 5 "[* . * + * -.]" 2 23 PHE 18.874 1.072 10 9 "[ **** * +-* *.]" 2 24 ALA 14.166 0.499 13 0 "[ . 1 .]" 2 25 VAL 11.246 0.527 12 2 "[ . - 1 + .]" 2 26 LEU 38.055 1.072 10 14 "[*********+** -*]" 2 27 SER 24.132 1.005 2 14 "[ +*****-*******]" 2 28 LEU 32.794 0.665 13 8 "[* *.* * 1 -+**]" 2 29 VAL 18.951 0.578 8 3 "[ . *+ 1 - .]" 2 30 ASN 21.959 0.940 6 14 [****.+*******-*] 2 31 ARG 48.335 1.005 2 14 "[ +*****-*******]" 2 32 VAL 17.383 0.715 4 7 "[ +. -* ** * *]" 2 33 ARG 14.241 0.834 14 5 "[ *. 1*-*+.]" 2 34 GLN 7.841 0.725 8 4 "[ - . + * *]" 2 35 GLY 3.365 0.588 6 1 "[ .+ 1 .]" 2 36 TYR 18.073 0.619 15 7 "[ * *.*- * * +]" 2 37 SER 17.138 0.987 5 15 [****+****-*****] 2 38 PRO 8.618 0.699 4 9 "[ **+. - 1*****]" 2 39 LEU 14.074 0.987 5 15 [****+****-*****] 3 2 TRP 1.363 0.302 1 0 "[ . 1 .]" 3 3 LEU 16.457 0.872 10 10 "[-* *.* * +****.]" 3 4 TRP 24.371 0.902 8 9 "[ ****+ 1- ***]" 3 5 TYR 20.278 0.595 7 4 "[ - + 1 **]" 3 6 ILE 28.888 0.873 3 14 "[**+***** ****-*]" 3 7 ARG 23.563 0.902 8 12 "[** *.**+ **-***]" 3 8 ILE 43.684 0.829 9 12 "[ * *****+** *-*]" 3 9 PHE 19.764 0.873 3 10 "[**+***** 1 -*]" 3 10 ILE 8.918 0.474 10 0 "[ . 1 .]" 3 11 ILE 17.227 0.765 9 12 "[** ****+* -***]" 3 12 ILE 11.032 0.829 9 8 "[ *** +-* * *]" 3 13 VAL 3.232 0.324 7 0 "[ . 1 .]" 3 14 GLY 2.399 0.358 11 0 "[ . 1 .]" 3 15 SER 12.313 0.765 9 2 "[ . - +1 .]" 3 16 LEU 12.749 0.438 14 0 "[ . 1 .]" 3 17 ILE 10.561 0.692 11 5 "[- *. ** 1+ .]" 3 18 GLY 15.306 0.692 11 5 "[- *. ** 1+ .]" 3 19 LEU 12.789 0.731 15 2 "[ . - 1 +]" 3 20 ARG 10.496 0.398 7 0 "[ . 1 .]" 3 21 ILE 6.733 1.177 13 2 "[ . - 1 + .]" 3 22 VAL 20.248 1.177 13 6 "[ * .** 1 -+ *]" 3 23 PHE 20.915 1.045 10 13 "[ ********+**-*.]" 3 24 ALA 14.048 0.463 1 0 "[ . 1 .]" 3 25 VAL 11.777 0.532 3 1 "[ + . 1 .]" 3 26 LEU 41.208 1.045 10 15 [-********+*****] 3 27 SER 24.568 1.214 12 14 "[**- *******+***]" 3 28 LEU 32.506 0.763 14 8 "[ *.-* ** * +*]" 3 29 VAL 20.405 0.592 12 3 "[ .- 1 +* .]" 3 30 ASN 20.984 0.830 4 11 "[ +*-******* *]" 3 31 ARG 47.844 1.214 12 15 [-**********+***] 3 32 VAL 19.134 0.716 14 9 "[ * -****1* *+.]" 3 33 ARG 17.290 0.768 1 9 "[+ * .**- ** **.]" 3 34 GLN 8.058 0.745 1 4 "[+- . *1 *]" 3 35 GLY 2.656 0.302 2 0 "[ . 1 .]" 3 36 TYR 23.929 0.768 1 10 "[+ ******1** *]" 3 37 SER 17.159 0.988 14 15 [************-+*] 3 38 PRO 7.133 0.715 4 7 "[ +. -* ** * *]" 3 39 LEU 13.871 0.988 14 15 [************-+*] stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 2 TRP HD1 1 3 LEU QD 3.000 . 4.000 4.078 3.869 4.266 0.266 13 0 "[ . 1 .]" 1 2 1 3 LEU H 1 6 ILE MG 4.500 3.500 5.000 5.645 5.392 5.869 0.869 14 13 "[****.-****** +*]" 1 3 1 3 LEU QD 1 4 TRP HE3 3.000 . 4.000 3.811 3.075 4.517 0.517 2 1 "[ + . 1 .]" 1 4 1 3 LEU QD 1 4 TRP HZ3 3.500 2.500 4.500 4.599 3.735 4.827 0.327 7 0 "[ . 1 .]" 1 5 1 3 LEU MD2 3 7 ARG QD 4.000 3.000 5.000 4.849 3.532 5.329 0.329 14 0 "[ . 1 .]" 1 6 1 4 TRP QB 1 8 ILE MG 4.000 3.500 4.500 4.976 4.699 5.305 0.805 3 6 "[- + .** *1 *.]" 1 7 1 4 TRP HE3 1 7 ARG HE 3.000 . 4.000 4.442 4.168 4.748 0.748 8 4 "[ * * + - .]" 1 8 1 4 TRP HE3 1 5 TYR H 4.000 3.000 5.000 5.449 5.335 5.568 0.568 1 4 "[+ * -1 *.]" 1 9 1 5 TYR H 1 6 ILE MD 4.500 3.500 5.000 4.438 3.480 5.188 0.188 1 0 "[ . 1 .]" 1 10 1 5 TYR HA 1 8 ILE MD 4.000 3.000 5.000 4.886 4.628 5.076 0.076 13 0 "[ . 1 .]" 1 11 1 5 TYR HA 1 8 ILE MG 4.000 3.000 5.000 2.591 2.462 2.714 0.538 14 2 "[ . -1 +.]" 1 12 1 5 TYR QE 1 8 ILE MD 4.000 3.500 4.500 4.811 4.745 4.926 0.426 2 0 "[ . 1 .]" 1 13 1 6 ILE HA 1 8 ILE MG 4.000 3.500 4.500 4.331 4.222 4.444 . 0 0 "[ . 1 .]" 1 14 1 6 ILE MD 1 9 PHE QB 4.000 3.000 4.500 4.016 3.553 5.143 0.643 7 2 "[ - . + 1 .]" 1 15 1 6 ILE MG 1 9 PHE QB 3.500 3.000 4.000 3.585 3.303 4.016 0.016 4 0 "[ . 1 .]" 1 16 1 6 ILE MG 1 9 PHE QD 3.200 2.700 3.700 4.037 3.935 4.146 0.446 9 0 "[ . 1 .]" 1 17 1 6 ILE MG 3 7 ARG QD 4.000 3.000 5.000 3.595 2.796 4.819 0.204 2 0 "[ . 1 .]" 1 18 1 6 ILE MG 3 8 ILE HA 4.500 3.500 5.500 5.749 5.347 5.974 0.474 5 0 "[ . 1 .]" 1 19 1 7 ARG H 1 8 ILE H 2.500 . 3.000 2.804 2.731 2.876 . 0 0 "[ . 1 .]" 1 20 1 7 ARG HA 1 10 ILE MD 3.500 3.000 4.000 3.652 2.736 4.202 0.264 13 0 "[ . 1 .]" 1 21 1 7 ARG QD 1 8 ILE MD 5.000 4.000 5.500 5.505 4.684 5.802 0.302 6 0 "[ . 1 .]" 1 22 1 7 ARG QD 1 8 ILE MG 4.000 3.000 4.500 4.768 4.071 4.983 0.483 5 0 "[ . 1 .]" 1 23 1 7 ARG QD 2 3 LEU MD2 4.000 3.000 5.000 5.020 3.941 5.294 0.294 14 0 "[ . 1 .]" 1 24 1 7 ARG QD 2 6 ILE MG 4.000 3.000 5.000 3.457 2.798 4.366 0.202 11 0 "[ . 1 .]" 1 25 1 7 ARG HE 1 11 ILE MG 4.000 3.000 5.000 5.506 5.339 5.708 0.708 6 9 "[** *.+ - 1* ***]" 1 26 1 8 ILE HA 2 6 ILE MG 4.500 3.500 5.500 5.781 5.573 5.968 0.468 8 0 "[ . 1 .]" 1 27 1 8 ILE MD 1 11 ILE MD 4.000 3.000 5.000 4.226 2.914 5.474 0.474 13 0 "[ . 1 .]" 1 28 1 8 ILE MD 1 12 ILE MD 4.000 3.000 5.000 3.809 3.283 5.038 0.038 12 0 "[ . 1 .]" 1 29 1 8 ILE MG 1 9 PHE H 3.000 . 3.500 2.213 1.973 2.323 0.027 4 0 "[ . 1 .]" 1 30 1 8 ILE MG 1 9 PHE HA 3.500 3.000 4.000 3.161 2.969 3.337 0.031 12 0 "[ . 1 .]" 1 31 1 8 ILE MG 1 9 PHE QB 3.800 2.800 4.300 3.103 2.867 3.232 . 0 0 "[ . 1 .]" 1 32 1 8 ILE MG 1 9 PHE QD 3.000 . 3.500 4.044 3.863 4.188 0.688 13 8 "[ * *-* **1 +*.]" 1 33 1 8 ILE MG 1 12 ILE H 4.000 3.000 4.500 5.118 4.895 5.414 0.914 12 12 "[*-* *** ** +***]" 1 34 1 9 PHE H 1 10 ILE MD 4.000 3.000 4.500 4.437 3.587 4.795 0.295 2 0 "[ . 1 .]" 1 35 1 9 PHE HA 1 13 VAL MG2 4.000 3.500 4.500 4.508 4.175 4.692 0.192 12 0 "[ . 1 .]" 1 36 1 9 PHE QD 1 10 ILE MD 4.000 3.000 4.500 3.420 2.896 4.731 0.231 14 0 "[ . 1 .]" 1 37 1 9 PHE QD 1 13 VAL MG2 3.500 3.000 4.000 3.669 2.982 4.065 0.065 9 0 "[ . 1 .]" 1 38 1 9 PHE QE 1 13 VAL MG2 3.500 3.000 4.000 3.708 2.947 4.039 0.053 15 0 "[ . 1 .]" 1 39 1 10 ILE H 1 10 ILE MD 2.500 . 3.000 2.762 2.021 3.295 0.295 2 0 "[ . 1 .]" 1 40 1 10 ILE H 3 10 ILE MG 4.000 3.000 5.000 5.219 5.095 5.474 0.474 10 0 "[ . 1 .]" 1 41 1 10 ILE MD 3 11 ILE H 4.000 3.000 5.000 4.842 4.367 5.347 0.347 12 0 "[ . 1 .]" 1 42 1 10 ILE MG 2 10 ILE H 4.000 3.000 5.000 5.159 4.586 5.351 0.351 1 0 "[ . 1 .]" 1 43 1 11 ILE H 2 10 ILE MD 4.000 3.000 5.000 5.011 4.460 5.613 0.613 15 1 "[ . 1 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