NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
595287 |
2n29   |
25592 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 537 |
data_2n29_MR_file_constraints
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_Study_list.Entry_ID parsed_2n29
_Study_list.ID 1
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1 "Conversion project" NMR . parsed_2n29 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
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_Entry.Accession_date .
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_Entry.Origination .
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_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2n29 "Master copy" parsed_2n29
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2n29
_Constraint_stat_list.ID 1
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2n29.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2n29 1
1 2n29.mr . . XPLOR/CNS 2 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 62 parsed_2n29 1
1 2n29.mr . . XPLOR/CNS 3 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 39 parsed_2n29 1
1 2n29.mr . . XPLOR/CNS 4 distance NOE ambi 350 parsed_2n29 1
1 2n29.mr . . XPLOR/CNS 5 distance "general distance" simple 86 parsed_2n29 1
1 2n29.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2n29 1
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_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER VIRAL PROTEIN 01-MAY-15 2N29
*TITLE SOLUTION-STATE NMR STRUCTURE OF VPU CYTOPLASMIC DOMAIN
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: PROTEIN VPU;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: CYTOPLASMIC DOMAIN (UNP RESIDUES 28-81);
*COMPND 5 SYNONYM: U ORF PROTEIN, VIRAL PROTEIN U;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HIV-1;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 11676;
*SOURCE 5 GENE: VPU;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: C41;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 10 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PET31B+
*KEYWDS ALPHA HELIX, VIRAL PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 1
*AUTHOR H.ZHANG, E.C.LIN, Y.TIAN, B.B.DAS, S.J.OPELLA
*REVDAT 1 30-SEP-15 2N29 0
ATOM 878 PA1 ANI B5000 -71.228 -48.251 7.466 1.00 0.00
ATOM 879 PA2 ANI B5000 -70.044 -47.283 7.824 1.00 0.00
ATOM 880 OO ANI B5000 -70.978 -47.283 7.466 1.00 0.00
ATOM 881 OO2 ANI B5000 -70.978 -47.283 7.466 1.00 0.00
ATOM 882 X ANI B5000 -69.978 -47.283 7.466 1.00 0.00
ATOM 883 Y ANI B5000 -70.978 -46.283 7.466 1.00 0.00
ATOM 884 Z ANI B5000 -70.978 -47.283 8.466 1.00 0.00
;
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save_CNS/XPLOR_dihedral_2
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2n29
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
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loop_
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1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -94.4 -34.4 . . 7 . C . 8 . N . 8 . CA . 8 . C parsed_2n29 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -66.3 -6.3 . . 8 . N . 8 . CA . 8 . C . 9 . N parsed_2n29 1
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4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -68.0 -8.0 . . 9 . N . 9 . CA . 9 . C . 10 . N parsed_2n29 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -92.9 -32.9 . . 9 . C . 10 . N . 10 . CA . 10 . C parsed_2n29 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -65.3 -5.3 . . 10 . N . 10 . CA . 10 . C . 11 . N parsed_2n29 1
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9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -75.1 -55.1 . . 11 . C . 12 . N . 12 . CA . 12 . C parsed_2n29 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -46.5 -26.5 . . 12 . N . 12 . CA . 12 . C . 13 . N parsed_2n29 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -76.0 -56.0 . . 12 . C . 13 . N . 13 . CA . 13 . C parsed_2n29 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -49.9 -29.9 . . 13 . N . 13 . CA . 13 . C . 14 . N parsed_2n29 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -74.2 -54.2 . . 13 . C . 14 . N . 14 . CA . 14 . C parsed_2n29 1
14 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -54.9 -34.9 . . 14 . N . 14 . CA . 14 . C . 15 . N parsed_2n29 1
15 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -71.7 -51.7 . . 14 . C . 15 . N . 15 . CA . 15 . C parsed_2n29 1
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stop_
save_
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_RDC_constraint_list.Block_ID 3
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loop_
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197 ambiguity 455 52 455 63 parsed_2n29 1
198 ambiguity 457 52 457 63 parsed_2n29 1
199 ambiguity 460 52 460 63 parsed_2n29 1
200 ambiguity 462 52 462 63 parsed_2n29 1
201 ambiguity 466 52 466 63 parsed_2n29 1
202 ambiguity 469 50 469 61 parsed_2n29 1
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210 ambiguity 488 52 488 63 parsed_2n29 1
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231 ambiguity 541 51 541 62 parsed_2n29 1
232 "assign (resid 35 and name HN) (resid 36 and name "HD1,2 or HD1/HG2) 5.0 1.0 1.0" 544 1 544 82 parsed_2n29 1
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234 ambiguity 548 51 548 62 parsed_2n29 1
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247 ambiguity 579 51 579 62 parsed_2n29 1
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250 ambiguity 588 51 588 62 parsed_2n29 1
251 ambiguity 590 52 590 63 parsed_2n29 1
252 ambiguity 592 52 592 63 parsed_2n29 1
253 ambiguity 594 51 594 62 parsed_2n29 1
254 ambiguity 599 52 599 63 parsed_2n29 1
255 ambiguity 607 52 607 63 parsed_2n29 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "5.0 1.0 1.0" 400 49 400 59 parsed_2n29 1
2 "5.0 1.0 1.0" 409 49 409 59 parsed_2n29 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2n29
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "general distance"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 5
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2n29 2
2 1 . . . parsed_2n29 2
3 1 . . . parsed_2n29 2
4 1 . . . parsed_2n29 2
5 1 . . . parsed_2n29 2
6 1 . . . parsed_2n29 2
7 1 . . . parsed_2n29 2
8 1 . . . parsed_2n29 2
9 1 . . . parsed_2n29 2
10 1 . . . parsed_2n29 2
11 1 . . . parsed_2n29 2
12 1 . . . parsed_2n29 2
13 1 . . . parsed_2n29 2
14 1 . . . parsed_2n29 2
15 1 . . . parsed_2n29 2
16 1 . . . parsed_2n29 2
17 1 . . . parsed_2n29 2
18 1 . . . parsed_2n29 2
19 1 . . . parsed_2n29 2
20 1 . . . parsed_2n29 2
21 1 . . . parsed_2n29 2
22 1 . . . parsed_2n29 2
23 1 . . . parsed_2n29 2
24 1 . . . parsed_2n29 2
25 1 . . . parsed_2n29 2
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27 1 . . . parsed_2n29 2
28 1 . . . parsed_2n29 2
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30 1 . . . parsed_2n29 2
31 1 . . . parsed_2n29 2
32 1 . . . parsed_2n29 2
33 1 . . . parsed_2n29 2
34 1 . . . parsed_2n29 2
35 1 . . . parsed_2n29 2
36 1 . . . parsed_2n29 2
37 1 . . . parsed_2n29 2
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47 1 . . . parsed_2n29 2
48 1 . . . parsed_2n29 2
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51 1 . . . parsed_2n29 2
52 1 . . . parsed_2n29 2
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57 1 . . . parsed_2n29 2
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61 1 . . . parsed_2n29 2
62 1 . . . parsed_2n29 2
63 1 . . . parsed_2n29 2
64 1 . . . parsed_2n29 2
65 1 . . . parsed_2n29 2
66 1 . . . parsed_2n29 2
67 1 . . . parsed_2n29 2
68 1 . . . parsed_2n29 2
69 1 . . . parsed_2n29 2
70 1 . . . parsed_2n29 2
71 1 . . . parsed_2n29 2
72 1 . . . parsed_2n29 2
73 1 . . . parsed_2n29 2
74 1 . . . parsed_2n29 2
75 1 . . . parsed_2n29 2
76 1 . . . parsed_2n29 2
77 1 . . . parsed_2n29 2
78 1 . . . parsed_2n29 2
79 1 . . . parsed_2n29 2
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81 1 . . . parsed_2n29 2
82 1 . . . parsed_2n29 2
83 1 . . . parsed_2n29 2
84 1 . . . parsed_2n29 2
85 1 . . . parsed_2n29 2
86 1 . . . parsed_2n29 2
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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3 1 1 . . . . . . . . . 14 . OS1 parsed_2n29 2
3 1 2 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_2n29 2
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7 1 2 . . . . . . . . . 9 . HN parsed_2n29 2
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9 1 1 . . . . . . . . . 14 . OS1 parsed_2n29 2
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11 1 2 . . . . . . . . . 15 . HN parsed_2n29 2
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15 1 2 . . . . . . . . . 20 . HN parsed_2n29 2
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16 1 2 . . . . . . . . . 21 . HN parsed_2n29 2
17 1 1 . . . . . . . . . 14 . OS1 parsed_2n29 2
17 1 2 . . . . . . . . . 22 . HN parsed_2n29 2
18 1 1 . . . . . . . . . 14 . OS1 parsed_2n29 2
18 1 2 . . . . . . . . . 23 . HN parsed_2n29 2
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19 1 2 . . . . . . . . . 24 . HN parsed_2n29 2
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20 1 2 . . . . . . . . . 25 . HN parsed_2n29 2
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24 1 2 . . . . . . . . . 30 . HN parsed_2n29 2
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