NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
473373 |
2ju3   |
15429 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 329 |
data_2ju3_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2ju3
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2ju3 1
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save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2ju3
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2ju3 "Master copy" parsed_2ju3
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save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2ju3
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2ju3.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ju3 1
1 2ju3.mr . . XML 2 peak "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ju3 1
1 2ju3.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 90 parsed_2ju3 1
1 2ju3.mr . . XPLOR/CNS 4 "coupling constant" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ju3 1
1 2ju3.mr . . XPLOR/CNS 5 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 182 parsed_2ju3 1
1 2ju3.mr . . XPLOR/CNS 6 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 57 parsed_2ju3 1
1 2ju3.mr . . "MR format" 7 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ju3 1
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_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2ju3
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER LIPID BINDING PROTEIN 14-AUG-07 2JU3
*TITLE SOLUTION-STATE NMR STRUCTURES OF APO-LFABP (LIVER FATTY
*TITLE 2 ACID-BINDING PROTEIN)
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: FATTY ACID-BINDING PROTEIN, LIVER;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 SYNONYM: L-FABP, Z-PROTEIN, SQUALENE- AND STEROL-CARRIER
*COMPND 5 PROTEIN, SCP, P14;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: RATTUS NORVEGICUS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: RAT;
*SOURCE 4 GENE: FABP1;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: BL21(DE3);
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_VARIANT: PLYS;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: VECTOR;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR: PET-11A
*KEYWDS PROTEIN, APO, LFABP, ILBP, FABP, ACETYLATION, CYTOPLASM,
*KEYWDS 2 LIPID-BINDING, PHOSPHORYLATION, TRANSPORT, LIPID BINDING
*KEYWDS 3 PROTEIN
*EXPDTA NMR, 10 STRUCTURES
*AUTHOR Y.HE, X.YANG, H.WANG, R.ESTEPHAN, F.FRANCIS, S.KODUKULA,
*AUTHOR 2 J.STORCH, R.E.STARK
*REVDAT 1 20-NOV-07 2JU3 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2ju3
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2ju3 1
2 1 . . . parsed_2ju3 1
3 1 . . . parsed_2ju3 1
4 1 . . . parsed_2ju3 1
5 1 . . . parsed_2ju3 1
6 1 . . . parsed_2ju3 1
7 1 . . . parsed_2ju3 1
8 1 . . . parsed_2ju3 1
9 1 . . . parsed_2ju3 1
10 1 . . . parsed_2ju3 1
11 1 . . . parsed_2ju3 1
12 1 . . . parsed_2ju3 1
13 1 . . . parsed_2ju3 1
14 1 . . . parsed_2ju3 1
15 1 . . . parsed_2ju3 1
16 1 . . . parsed_2ju3 1
17 1 . . . parsed_2ju3 1
18 1 . . . parsed_2ju3 1
19 1 . . . parsed_2ju3 1
20 1 . . . parsed_2ju3 1
21 1 . . . parsed_2ju3 1
22 1 . . . parsed_2ju3 1
23 1 . . . parsed_2ju3 1
24 1 . . . parsed_2ju3 1
25 1 . . . parsed_2ju3 1
26 1 . . . parsed_2ju3 1
27 1 . . . parsed_2ju3 1
28 1 . . . parsed_2ju3 1
29 1 . . . parsed_2ju3 1
30 1 . . . parsed_2ju3 1
31 1 . . . parsed_2ju3 1
32 1 . . . parsed_2ju3 1
33 1 . . . parsed_2ju3 1
34 1 . . . parsed_2ju3 1
35 1 . . . parsed_2ju3 1
36 1 . . . parsed_2ju3 1
37 1 . . . parsed_2ju3 1
38 1 . . . parsed_2ju3 1
39 1 . . . parsed_2ju3 1
40 1 . . . parsed_2ju3 1
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43 1 . . . parsed_2ju3 1
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45 1 . . . parsed_2ju3 1
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47 1 . . . parsed_2ju3 1
48 1 . . . parsed_2ju3 1
49 1 . . . parsed_2ju3 1
50 1 . . . parsed_2ju3 1
51 1 . . . parsed_2ju3 1
52 1 . . . parsed_2ju3 1
53 1 . . . parsed_2ju3 1
54 1 . . . parsed_2ju3 1
55 1 . . . parsed_2ju3 1
56 1 . . . parsed_2ju3 1
57 1 . . . parsed_2ju3 1
58 1 . . . parsed_2ju3 1
59 1 . . . parsed_2ju3 1
60 1 . . . parsed_2ju3 1
61 1 . . . parsed_2ju3 1
62 1 . . . parsed_2ju3 1
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64 1 . . . parsed_2ju3 1
65 1 . . . parsed_2ju3 1
66 1 . . . parsed_2ju3 1
67 1 . . . parsed_2ju3 1
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69 1 . . . parsed_2ju3 1
70 1 . . . parsed_2ju3 1
71 1 . . . parsed_2ju3 1
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73 1 . . . parsed_2ju3 1
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75 1 . . . parsed_2ju3 1
76 1 . . . parsed_2ju3 1
77 1 . . . parsed_2ju3 1
78 1 . . . parsed_2ju3 1
79 1 . . . parsed_2ju3 1
80 1 . . . parsed_2ju3 1
81 1 . . . parsed_2ju3 1
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84 1 . . . parsed_2ju3 1
85 1 . . . parsed_2ju3 1
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87 1 . . . parsed_2ju3 1
88 1 . . . parsed_2ju3 1
89 1 . . . parsed_2ju3 1
90 1 . . . parsed_2ju3 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
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_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
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_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 17 . O parsed_2ju3 1
1 1 2 . . . . . . . . . 21 . HN parsed_2ju3 1
2 1 1 . . . . . . . . . 17 . O parsed_2ju3 1
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3 1 1 . . . . . . . . . 18 . O parsed_2ju3 1
3 1 2 . . . . . . . . . 22 . HN parsed_2ju3 1
4 1 1 . . . . . . . . . 18 . O parsed_2ju3 1
4 1 2 . . . . . . . . . 22 . N parsed_2ju3 1
5 1 1 . . . . . . . . . 19 . O parsed_2ju3 1
5 1 2 . . . . . . . . . 23 . HN parsed_2ju3 1
6 1 1 . . . . . . . . . 19 . O parsed_2ju3 1
6 1 2 . . . . . . . . . 23 . N parsed_2ju3 1
7 1 1 . . . . . . . . . 20 . O parsed_2ju3 1
7 1 2 . . . . . . . . . 24 . HN parsed_2ju3 1
8 1 1 . . . . . . . . . 20 . O parsed_2ju3 1
8 1 2 . . . . . . . . . 24 . N parsed_2ju3 1
9 1 1 . . . . . . . . . 5 . O parsed_2ju3 1
9 1 2 . . . . . . . . . 41 . HN parsed_2ju3 1
10 1 1 . . . . . . . . . 5 . O parsed_2ju3 1
10 1 2 . . . . . . . . . 41 . N parsed_2ju3 1
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11 1 2 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_2ju3 1
12 1 1 . . . . . . . . . 41 . O parsed_2ju3 1
12 1 2 . . . . . . . . . 5 . N parsed_2ju3 1
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17 1 2 . . . . . . . . . 8 . HN parsed_2ju3 1
18 1 1 . . . . . . . . . 125 . O parsed_2ju3 1
18 1 2 . . . . . . . . . 8 . N parsed_2ju3 1
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20 1 2 . . . . . . . . . 123 . N parsed_2ju3 1
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21 1 2 . . . . . . . . . 10 . HN parsed_2ju3 1
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30 1 2 . . . . . . . . . 42 . N parsed_2ju3 1
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32 1 2 . . . . . . . . . 47 . N parsed_2ju3 1
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42 1 2 . . . . . . . . . 61 . N parsed_2ju3 1
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51 1 2 . . . . . . . . . 71 . HN parsed_2ju3 1
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54 1 2 . . . . . . . . . 92 . N parsed_2ju3 1
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55 1 2 . . . . . . . . . 84 . HN parsed_2ju3 1
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56 1 2 . . . . . . . . . 84 . N parsed_2ju3 1
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57 1 2 . . . . . . . . . 104 . HN parsed_2ju3 1
58 1 1 . . . . . . . . . 89 . O parsed_2ju3 1
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59 1 2 . . . . . . . . . 102 . HN parsed_2ju3 1
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60 1 2 . . . . . . . . . 102 . N parsed_2ju3 1
61 1 1 . . . . . . . . . 102 . O parsed_2ju3 1
61 1 2 . . . . . . . . . 91 . HN parsed_2ju3 1
62 1 1 . . . . . . . . . 102 . O parsed_2ju3 1
62 1 2 . . . . . . . . . 91 . N parsed_2ju3 1
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63 1 2 . . . . . . . . . 100 . HN parsed_2ju3 1
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65 1 2 . . . . . . . . . 93 . HN parsed_2ju3 1
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76 1 2 . . . . . . . . . 110 . N parsed_2ju3 1
77 1 1 . . . . . . . . . 110 . O parsed_2ju3 1
77 1 2 . . . . . . . . . 103 . HN parsed_2ju3 1
78 1 1 . . . . . . . . . 110 . O parsed_2ju3 1
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stop_
loop_
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loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
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126 1 127 69 parsed_2ju3 1
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save_CNS/XPLOR_dihedral_5
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_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2ju3
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_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 5
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103.0 133.0 . . 8 . N . 8 . CA . 8 . C . 9 . N parsed_2ju3 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -95.0 -61.0 . . 8 . C . 9 . N . 9 . CA . 9 . C parsed_2ju3 1
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11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -163.0 -85.0 . . 10 . C . 11 . N . 11 . CA . 11 . C parsed_2ju3 1
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13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -150.0 -104.0 . . 11 . C . 12 . N . 12 . CA . 12 . C parsed_2ju3 1
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stop_
loop_
_TA_constraint_comment_org.ID
_TA_constraint_comment_org.Comment_text
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_TA_constraint_comment_org.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 "! Dihedral angle from TALOS" 1 1 1 29 parsed_2ju3 1
2
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3
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4
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5
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6
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128 1 132 93 parsed_2ju3 1
7
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(resid 25 and name CA) (resid 25 and name C) 1.0 -80.110 30.970 2
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(resid 25 and name C) (resid 26 and name N) 1.0 136.040 21.36 2
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8
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(resid 31 and name CA) (resid 31 and name C) 1.0 -68.520 13.840 2
assign (resid 31 and name N) (resid 31 and name CA)
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assign (resid 37 and name N) (resid 37 and name CA)
(resid 37 and name C) (resid 38 and name N) 1.0 -180.0 165.0 2
;
206 1 216 93 parsed_2ju3 1
10
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(resid 45 and name CA) (resid 45 and name C) 1.0 -180.0 165.0 2
assign (resid 45 and name N) (resid 45 and name CA)
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assign (resid 45 and name C) (resid 46 and name N)
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assign (resid 46 and name N) (resid 46 and name CA)
(resid 46 and name C) (resid 47 and name N) 1.0 -125.0 130.0 2
;
260 1 270 93 parsed_2ju3 1
11
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loop_
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1
;
! RDC table
resid 500 contains the four atoms which define the tensor
the coordinates of resid 500 are appended to the pdb
use our pdf file for the tensor
the data are in the format:
assign (atomselection) value error
;
1 1 7 37 parsed_2ju3 1
stop_
save_
Contact the webmaster for help, if required. Friday, June 7, 2024 5:19:02 PM GMT (wattos1)