NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
44988 |
2dmb   |
10325 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1860 |
data_2dmb_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2dmb
_Study_list.ID 1
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_Study.ID
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2dmb 1
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_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2dmb
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2dmb "Master copy" parsed_2dmb
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2dmb
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2dmb.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2dmb 1
1 2dmb.mr . . DYANA/DIANA 2 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 88 parsed_2dmb 1
1 2dmb.mr . . DYANA/DIANA 3 distance NOE simple 1772 parsed_2dmb 1
1 2dmb.mr . . "MR format" 4 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2dmb 1
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_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
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_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER STRUCTURAL PROTEIN 20-APR-06 2DMB
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF THE 15TH FILAMIN DOMAIN FROM HUMAN
*TITLE 2 FILAMIN-B
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: FILAMIN-B;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: FILAMIN DOMAIN;
*COMPND 5 SYNONYM: FLN-B, BETA-FILAMIN, ACTIN-BINDING-LIKE PROTEIN,
*COMPND 6 THYROID AUTOANTIGEN, TRUNCATED ACTIN-BINDING PROTEIN,
*COMPND 7 TRUNCATED ABP, ABP- 280 HOMOLOG, ABP-278, FILAMIN 3,
*COMPND 8 FILAMIN HOMOLOG 1, FH1;
*COMPND 9 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606;
*SOURCE 5 GENE: FLNB;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: CELL FREE SYNTHESIS;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: P051205-15;
*SOURCE 9 OTHER_DETAILS: CELL-FREE PROTEIN SYNTHESIS
*KEYWDS BETA-SANDWICH, IMMUNOGLOBULIN-LIKE FOLD, FILAMIN DOMAIN,
*KEYWDS 2 STRUCTURAL GENOMICS, NPPSFA, NATIONAL PROJECT ON PROTEIN
*KEYWDS 3 STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES, RIKEN STRUCTURAL
*KEYWDS 4 GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE, RSGI, STRUCTURAL PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 20
*AUTHOR T.TOMIZAWA, N.TOCHIO, S.KOSHIBA, S.WATANABE, T.HARADA,
*AUTHOR 2 T.KIGAWA, S.YOKOYAMA, RIKEN STRUCTURAL GENOMICS/PROTEOMICS
*AUTHOR 3 INITIATIVE (RSGI)
*REVDAT 1 12-MAY-09 2DMB 0
**************************************************************
During the CYANA calculations automatic implicit swapping of restraints
involving diastereotopic substitutents was applied for prochrial groups
without stereospecific assignment. Diastereotopic substitents were
swapped individually in each conformer to calculate the minimal target
function and restraint violations.
The optimal swapping for a given prochiral group may differ among
the 20 conformers that represent the solution structure. The swapping
is therefore performed implicitly in the program and is not reflected
in the distance restraint file deposited in the PDB.
**************************************************************
;
save_
save_DYANA/DIANA_dihedral_2
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2dmb
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 2
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_1
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_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_2
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_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_2
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_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_2
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_3
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_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_3
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entity_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Comp_index_ID_4
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_Torsion_angle_constraint.Comp_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Angle_lower_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Angle_upper_bound_val
_Torsion_angle_constraint.Source_experiment_ID
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_Torsion_angle_constraint.Auth_asym_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Auth_seq_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Auth_comp_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Auth_atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -162.2 -102.2 . . 15 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
2 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111.7 171.7 . . 15 LEU . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
3 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.1 -89.1 . . 16 ALA . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
4 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110.2 170.2 . . 16 ALA . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
5 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -151.0 -91.0 . . 17 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
6 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118.7 178.7 . . 17 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
7 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -141.5 -81.5 . . 31 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
8 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113.5 173.5 . . 31 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
9 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -164.2 -104.2 . . 33 PHE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
10 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118.6 178.6 . . 33 PHE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
11 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -155.7 -95.7 . . 34 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
12 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115.3 175.3 . . 34 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
13 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -128.1 -68.1 . . 36 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
14 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85.2 145.2 . . 36 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
15 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -130.2 -70.2 . . 37 ALA . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
16 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126.3 186.3 . . 37 ALA . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
17 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -133.1 -73.1 . . 39 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
18 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -26.2 33.8 . . 39 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
19 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -153.0 -93.0 . . 44 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
20 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115.5 175.5 . . 44 LYS . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
21 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -129.0 -69.0 . . 45 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
22 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100.7 160.7 . . 45 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
23 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -161.3 -101.3 . . 46 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
24 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119.9 179.9 . . 46 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
25 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -123.2 -63.2 . . 47 CYS . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
26 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88.4 148.4 . . 47 CYS . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
27 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -147.9 -87.9 . . 48 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
28 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100.8 160.8 . . 48 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
29 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -138.1 -78.1 . . 49 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
30 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100.3 160.3 . . 49 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
31 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -133.8 -73.8 . . 55 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
32 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123.0 183.0 . . 55 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
33 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -137.7 -77.7 . . 56 GLU . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
34 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102.4 162.4 . . 56 GLU . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
35 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -129.1 -69.1 . . 60 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
36 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97.8 157.8 . . 60 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
37 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -132.4 -72.4 . . 61 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
38 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100.9 160.9 . . 61 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
39 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -137.9 -78.0 . . 62 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
40 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91.9 151.9 . . 62 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
41 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -116.1 -56.1 . . 63 GLU . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
42 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105.6 165.6 . . 63 GLU . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
43 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -134.6 -74.6 . . 64 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
44 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105.1 165.1 . . 64 ASN . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
45 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -128.2 -68.2 . . 66 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
46 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -23.7 36.3 . . 66 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
47 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -150.4 -90.4 . . 68 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
48 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124.0 184.0 . . 68 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
49 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -147.5 -87.5 . . 69 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
50 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108.6 168.6 . . 69 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
51 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -149.5 -89.5 . . 70 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
52 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105.4 165.4 . . 70 ASP . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
53 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -131.0 -71.0 . . 71 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
54 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105.4 165.4 . . 71 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
55 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -155.8 -95.8 . . 72 PHE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
56 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120.1 180.1 . . 72 PHE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
57 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -163.2 -103.2 . . 73 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
58 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119.9 179.9 . . 73 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
59 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -121.4 -61.4 . . 75 ALA . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
60 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86.9 146.9 . . 75 ALA . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
61 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -135.0 -75.0 . . 80 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
62 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89.9 149.9 . . 80 THR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
63 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -135.7 -75.7 . . 81 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
64 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105.9 165.9 . . 81 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
65 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -134.4 -74.4 . . 82 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
66 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109.9 169.9 . . 82 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
67 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -135.3 -75.3 . . 84 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
68 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100.5 160.5 . . 84 TYR . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
69 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -138.2 -78.2 . . 85 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
70 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100.0 160.0 . . 85 VAL . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
71 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -148.9 -89.0 . . 86 ARG . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
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73 PHI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -136.5 -76.5 . . 87 PHE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
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84 PSI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95.5 155.5 . . 100 MET . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
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88 CHI21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150.0 210.0 . . 71 ILE . . . . . . . . . . . . . parsed_2dmb 1
stop_
save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2dmb
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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1362 1 1 . . . . . . . . . 83 ILE HB parsed_2dmb 1
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1483 1 1 . . . . . . . . . 99 VAL HA parsed_2dmb 1
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1484 1 2 . . . . . . . . . 100 MET HB3 parsed_2dmb 1
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