NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
43306 |
2ajj   |
6757 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 245 |
data_2ajj_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2ajj
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2ajj 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2ajj
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2ajj "Master copy" parsed_2ajj
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2ajj
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2ajj.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ajj 1
1 2ajj.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 245 parsed_2ajj 1
1 2ajj.mr . . "MR format" 3 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ajj 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2ajj
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER MEMBRANE PROTEIN 02-AUG-05 2AJJ
*TITLE NMR STRUCTURE OF THE IN-PLANE MEMBRANE ANCHOR DOMAIN [1-28]
*TITLE 2 OF THE MONOTOPIC NON STRUCTURAL PROTEIN 5A (NS5A) OF
*TITLE 3 BOVINE VIRAL DIARRHEA VIRUS (BVDV)
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: NONSTRUCTURAL PROTEIN 5A;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: BVDV NS5A;
*COMPND 5 SYNONYM: NS5A;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 3 OTHER_DETAILS: THE PEPTIDE WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED. THE
*SOURCE 4 SEQUENCE IS NATURALLY FOUND IN BOVINE VIRAL DIARRHEA VIRUS
*SOURCE 5 1, STRAIN CP7.
*KEYWDS IN-PLANE MEMBRANE ANCHOR DOMAIN, AMPHIPATHIC ALPHA-HELIX
*EXPDTA NMR, 31 STRUCTURES
*AUTHOR N.SAPAY, R.MONTSERRET, C.CHIPOT, V.BRASS, D.MORADPOUR,
*AUTHOR 2 G.DELEAGE, F.PENIN
*REVDAT 1 23-AUG-05 2AJJ 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2ajj
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2ajj 1
2 1 . . . parsed_2ajj 1
3 1 . . . parsed_2ajj 1
4 1 . . . parsed_2ajj 1
5 1 . . . parsed_2ajj 1
6 1 . . . parsed_2ajj 1
7 1 . . . parsed_2ajj 1
8 1 . . . parsed_2ajj 1
9 1 . . . parsed_2ajj 1
10 1 . . . parsed_2ajj 1
11 1 . . . parsed_2ajj 1
12 1 . . . parsed_2ajj 1
13 1 . . . parsed_2ajj 1
14 1 . . . parsed_2ajj 1
15 1 . . . parsed_2ajj 1
16 1 . . . parsed_2ajj 1
17 1 . . . parsed_2ajj 1
18 1 . . . parsed_2ajj 1
19 1 . . . parsed_2ajj 1
20 1 . . . parsed_2ajj 1
21 1 . . . parsed_2ajj 1
22 1 . . . parsed_2ajj 1
23 1 . . . parsed_2ajj 1
24 1 . . . parsed_2ajj 1
25 1 . . . parsed_2ajj 1
26 1 . . . parsed_2ajj 1
27 1 . . . parsed_2ajj 1
28 1 . . . parsed_2ajj 1
29 1 . . . parsed_2ajj 1
30 1 . . . parsed_2ajj 1
31 1 . . . parsed_2ajj 1
32 1 . . . parsed_2ajj 1
33 1 . . . parsed_2ajj 1
34 1 . . . parsed_2ajj 1
35 1 . . . parsed_2ajj 1
36 1 . . . parsed_2ajj 1
37 1 . . . parsed_2ajj 1
38 1 . . . parsed_2ajj 1
39 1 . . . parsed_2ajj 1
40 1 . . . parsed_2ajj 1
41 1 . . . parsed_2ajj 1
42 1 . . . parsed_2ajj 1
43 1 . . . parsed_2ajj 1
44 1 . . . parsed_2ajj 1
45 1 . . . parsed_2ajj 1
46 1 . . . parsed_2ajj 1
47 1 . . . parsed_2ajj 1
48 1 . . . parsed_2ajj 1
49 1 . . . parsed_2ajj 1
50 1 . . . parsed_2ajj 1
51 1 . . . parsed_2ajj 1
52 1 . . . parsed_2ajj 1
53 1 . . . parsed_2ajj 1
54 1 . . . parsed_2ajj 1
55 1 . . . parsed_2ajj 1
56 1 . . . parsed_2ajj 1
57 1 . . . parsed_2ajj 1
58 1 . . . parsed_2ajj 1
59 1 . . . parsed_2ajj 1
60 1 . . . parsed_2ajj 1
61 1 . . . parsed_2ajj 1
62 1 . . . parsed_2ajj 1
63 1 . . . parsed_2ajj 1
64 1 . . . parsed_2ajj 1
65 1 . . . parsed_2ajj 1
66 1 . . . parsed_2ajj 1
67 1 . . . parsed_2ajj 1
68 1 . . . parsed_2ajj 1
69 1 . . . parsed_2ajj 1
70 1 . . . parsed_2ajj 1
71 1 . . . parsed_2ajj 1
72 1 . . . parsed_2ajj 1
73 1 . . . parsed_2ajj 1
74 1 . . . parsed_2ajj 1
75 1 . . . parsed_2ajj 1
76 1 . . . parsed_2ajj 1
77 1 . . . parsed_2ajj 1
78 1 . . . parsed_2ajj 1
79 1 . . . parsed_2ajj 1
80 1 . . . parsed_2ajj 1
81 1 . . . parsed_2ajj 1
82 1 . . . parsed_2ajj 1
83 1 . . . parsed_2ajj 1
84 1 . . . parsed_2ajj 1
85 1 . . . parsed_2ajj 1
86 1 . . . parsed_2ajj 1
87 1 . . . parsed_2ajj 1
88 1 . . . parsed_2ajj 1
89 1 . . . parsed_2ajj 1
90 1 . . . parsed_2ajj 1
91 1 . . . parsed_2ajj 1
92 1 . . . parsed_2ajj 1
93 1 . . . parsed_2ajj 1
94 1 . . . parsed_2ajj 1
95 1 . . . parsed_2ajj 1
96 1 . . . parsed_2ajj 1
97 1 . . . parsed_2ajj 1
98 1 . . . parsed_2ajj 1
99 1 . . . parsed_2ajj 1
100 1 . . . parsed_2ajj 1
101 1 . . . parsed_2ajj 1
102 1 . . . parsed_2ajj 1
103 1 . . . parsed_2ajj 1
104 1 . . . parsed_2ajj 1
105 1 . . . parsed_2ajj 1
106 1 . . . parsed_2ajj 1
107 1 . . . parsed_2ajj 1
108 1 . . . parsed_2ajj 1
109 1 . . . parsed_2ajj 1
110 1 . . . parsed_2ajj 1
111 1 . . . parsed_2ajj 1
112 1 . . . parsed_2ajj 1
113 1 . . . parsed_2ajj 1
114 1 . . . parsed_2ajj 1
115 1 . . . parsed_2ajj 1
116 1 . . . parsed_2ajj 1
117 1 . . . parsed_2ajj 1
118 1 . . . parsed_2ajj 1
119 1 . . . parsed_2ajj 1
120 1 . . . parsed_2ajj 1
121 1 . . . parsed_2ajj 1
122 1 . . . parsed_2ajj 1
123 1 . . . parsed_2ajj 1
124 1 . . . parsed_2ajj 1
125 1 . . . parsed_2ajj 1
126 1 . . . parsed_2ajj 1
127 1 . . . parsed_2ajj 1
128 1 . . . parsed_2ajj 1
129 1 . . . parsed_2ajj 1
130 1 . . . parsed_2ajj 1
131 1 . . . parsed_2ajj 1
132 1 . . . parsed_2ajj 1
133 1 . . . parsed_2ajj 1
134 1 . . . parsed_2ajj 1
135 1 . . . parsed_2ajj 1
136 1 . . . parsed_2ajj 1
137 1 . . . parsed_2ajj 1
138 1 . . . parsed_2ajj 1
139 1 . . . parsed_2ajj 1
140 1 . . . parsed_2ajj 1
141 1 . . . parsed_2ajj 1
142 1 . . . parsed_2ajj 1
143 1 . . . parsed_2ajj 1
144 1 . . . parsed_2ajj 1
145 1 . . . parsed_2ajj 1
146 1 . . . parsed_2ajj 1
147 1 . . . parsed_2ajj 1
148 1 . . . parsed_2ajj 1
149 1 . . . parsed_2ajj 1
150 1 . . . parsed_2ajj 1
151 1 . . . parsed_2ajj 1
152 1 . . . parsed_2ajj 1
153 1 . . . parsed_2ajj 1
154 1 . . . parsed_2ajj 1
155 1 . . . parsed_2ajj 1
156 1 . . . parsed_2ajj 1
157 1 . . . parsed_2ajj 1
158 1 . . . parsed_2ajj 1
159 1 . . . parsed_2ajj 1
160 1 . . . parsed_2ajj 1
161 1 . . . parsed_2ajj 1
162 1 . . . parsed_2ajj 1
163 1 . . . parsed_2ajj 1
164 1 . . . parsed_2ajj 1
165 1 . . . parsed_2ajj 1
166 1 . . . parsed_2ajj 1
167 1 . . . parsed_2ajj 1
168 1 . . . parsed_2ajj 1
169 1 . . . parsed_2ajj 1
170 1 . . . parsed_2ajj 1
171 1 . . . parsed_2ajj 1
172 1 . . . parsed_2ajj 1
173 1 . . . parsed_2ajj 1
174 1 . . . parsed_2ajj 1
175 1 . . . parsed_2ajj 1
176 1 . . . parsed_2ajj 1
177 1 . . . parsed_2ajj 1
178 1 . . . parsed_2ajj 1
179 1 . . . parsed_2ajj 1
180 1 . . . parsed_2ajj 1
181 1 . . . parsed_2ajj 1
182 1 . . . parsed_2ajj 1
183 1 . . . parsed_2ajj 1
184 1 . . . parsed_2ajj 1
185 1 . . . parsed_2ajj 1
186 1 . . . parsed_2ajj 1
187 1 . . . parsed_2ajj 1
188 1 . . . parsed_2ajj 1
189 1 . . . parsed_2ajj 1
190 1 . . . parsed_2ajj 1
191 1 . . . parsed_2ajj 1
192 1 . . . parsed_2ajj 1
193 1 . . . parsed_2ajj 1
194 1 . . . parsed_2ajj 1
195 1 . . . parsed_2ajj 1
196 1 . . . parsed_2ajj 1
197 1 . . . parsed_2ajj 1
198 1 . . . parsed_2ajj 1
199 1 . . . parsed_2ajj 1
200 1 . . . parsed_2ajj 1
201 1 . . . parsed_2ajj 1
202 1 . . . parsed_2ajj 1
203 1 . . . parsed_2ajj 1
204 1 . . . parsed_2ajj 1
205 1 . . . parsed_2ajj 1
206 1 . . . parsed_2ajj 1
207 1 . . . parsed_2ajj 1
208 1 . . . parsed_2ajj 1
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211 1 . . . parsed_2ajj 1
212 1 . . . parsed_2ajj 1
213 1 . . . parsed_2ajj 1
214 1 . . . parsed_2ajj 1
215 1 . . . parsed_2ajj 1
216 1 . . . parsed_2ajj 1
217 1 . . . parsed_2ajj 1
218 1 . . . parsed_2ajj 1
219 1 . . . parsed_2ajj 1
220 1 . . . parsed_2ajj 1
221 1 . . . parsed_2ajj 1
222 1 . . . parsed_2ajj 1
223 1 . . . parsed_2ajj 1
224 1 . . . parsed_2ajj 1
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234 1 . . . parsed_2ajj 1
235 1 . . . parsed_2ajj 1
236 1 . . . parsed_2ajj 1
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238 1 . . . parsed_2ajj 1
239 1 . . . parsed_2ajj 1
240 1 . . . parsed_2ajj 1
241 1 . . . parsed_2ajj 1
242 1 . . . parsed_2ajj 1
243 1 . . . parsed_2ajj 1
244 1 . . . parsed_2ajj 1
245 1 . . . parsed_2ajj 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 1 . HA parsed_2ajj 1
1 1 2 . . . . . . . . . 2 . HN parsed_2ajj 1
2 1 1 . . . . . . . . . 1 . HB# parsed_2ajj 1
2 1 2 . . . . . . . . . 2 . HN parsed_2ajj 1
3 1 1 . . . . . . . . . 2 . HN parsed_2ajj 1
3 1 2 . . . . . . . . . 3 . HN parsed_2ajj 1
4 1 1 . . . . . . . . . 2 . HA# parsed_2ajj 1
4 1 2 . . . . . . . . . 3 . HN parsed_2ajj 1
5 1 1 . . . . . . . . . 3 . HA parsed_2ajj 1
5 1 2 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_2ajj 1
6 1 1 . . . . . . . . . 3 . HB2 parsed_2ajj 1
6 1 2 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_2ajj 1
7 1 1 . . . . . . . . . 3 . HB1 parsed_2ajj 1
7 1 2 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_2ajj 1
8 1 1 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_2ajj 1
8 1 2 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_2ajj 1
9 1 1 . . . . . . . . . 4 . HA parsed_2ajj 1
9 1 2 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_2ajj 1
10 1 1 . . . . . . . . . 4 . HB# parsed_2ajj 1
10 1 2 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_2ajj 1
11 1 1 . . . . . . . . . 4 . HB# parsed_2ajj 1
11 1 2 . . . . . . . . . 5 . HG1# parsed_2ajj 1
12 1 1 . . . . . . . . . 4 . HD* parsed_2ajj 1
12 1 2 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
13 1 1 . . . . . . . . . 4 . HD* parsed_2ajj 1
13 1 2 . . . . . . . . . 5 . HG1# parsed_2ajj 1
14 1 1 . . . . . . . . . 4 . HE* parsed_2ajj 1
14 1 2 . . . . . . . . . 5 . HG1# parsed_2ajj 1
15 1 1 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_2ajj 1
15 1 2 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_2ajj 1
16 1 1 . . . . . . . . . 4 . HA parsed_2ajj 1
16 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_2ajj 1
17 1 1 . . . . . . . . . 4 . HA parsed_2ajj 1
17 1 2 . . . . . . . . . 7 . HB2 parsed_2ajj 1
18 1 1 . . . . . . . . . 4 . HA parsed_2ajj 1
18 1 2 . . . . . . . . . 7 . HB1 parsed_2ajj 1
19 1 1 . . . . . . . . . 4 . HD* parsed_2ajj 1
19 1 2 . . . . . . . . . 8 . HD* parsed_2ajj 1
20 1 1 . . . . . . . . . 4 . HE* parsed_2ajj 1
20 1 2 . . . . . . . . . 8 . HD* parsed_2ajj 1
21 1 1 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_2ajj 1
21 1 2 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_2ajj 1
22 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
22 1 2 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_2ajj 1
23 1 1 . . . . . . . . . 5 . HB parsed_2ajj 1
23 1 2 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_2ajj 1
24 1 1 . . . . . . . . . 5 . HG1# parsed_2ajj 1
24 1 2 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_2ajj 1
25 1 1 . . . . . . . . . 5 . HG2# parsed_2ajj 1
25 1 2 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_2ajj 1
26 1 1 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_2ajj 1
26 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_2ajj 1
27 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
27 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_2ajj 1
28 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
28 1 2 . . . . . . . . . 8 . HN parsed_2ajj 1
29 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
29 1 2 . . . . . . . . . 8 . HB1 parsed_2ajj 1
30 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
30 1 2 . . . . . . . . . 8 . HB2 parsed_2ajj 1
31 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
31 1 2 . . . . . . . . . 8 . HG parsed_2ajj 1
32 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
32 1 2 . . . . . . . . . 8 . HD* parsed_2ajj 1
33 1 1 . . . . . . . . . 5 . HA parsed_2ajj 1
33 1 2 . . . . . . . . . 9 . HN parsed_2ajj 1
34 1 1 . . . . . . . . . 5 . HG2# parsed_2ajj 1
34 1 2 . . . . . . . . . 9 . HN parsed_2ajj 1
35 1 1 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_2ajj 1
35 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_2ajj 1
36 1 1 . . . . . . . . . 6 . HA parsed_2ajj 1
36 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_2ajj 1
37 1 1 . . . . . . . . . 6 . HB# parsed_2ajj 1
37 1 2 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_2ajj 1
38 1 1 . . . . . . . . . 6 . HG parsed_2ajj 1
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163 1 2 . . . . . . . . . 19 . HN parsed_2ajj 1
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165 1 1 . . . . . . . . . 17 . HA parsed_2ajj 1
165 1 2 . . . . . . . . . 20 . HB2 parsed_2ajj 1
166 1 1 . . . . . . . . . 17 . HA parsed_2ajj 1
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167 1 1 . . . . . . . . . 17 . HA parsed_2ajj 1
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168 1 1 . . . . . . . . . 17 . HA parsed_2ajj 1
168 1 2 . . . . . . . . . 20 . HD2# parsed_2ajj 1
169 1 1 . . . . . . . . . 17 . HA parsed_2ajj 1
169 1 2 . . . . . . . . . 20 . HD1# parsed_2ajj 1
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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=============================================================
> RESTRAINTS FROM s26a_backbone.list
> SEQUENCE
SGNYVLDLIYSLHKQINRGLKKIVLGX
> DISTANCE RESTRAINTS
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6.00e+03 < volume <= 1.50e+04 ---> retraints = 3.5 A
1.50e+04 < volume ---> retraints = 2.8 A
> CORRECTION FACTOR FOR PSEUDO-ATOMS
-CH2 = + 1.0 A (ex.: HB# in F)
-Haromatic = + 1.0 A (ex.: HD* in Y)
-CH3# = + 2.0 A (ex.: HG2# in I)
-CH3* = + 2.4 A (ex.: HD* in L)
=============================================================
<========== S1 ==========>
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<========== L8 ==========>
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23 "assign (resid 17 and name HN )(resid 19 and name HN ) 4.5 2.7 0.5 !* due to superposition" 221 1 221 107 parsed_2ajj 1
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29 "assign (resid 22 and name HA )(resid 25 and name HN ) 3.5 1.7 0.4 !* due to superposition" 289 1 289 107 parsed_2ajj 1
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32 "assign (resid 24 and name HN )(resid 26 and name HN ) 4.5 2.7 0.5 !* due to superposition" 312 1 312 107 parsed_2ajj 1
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Contact the webmaster for help, if required. Saturday, June 1, 2024 3:45:04 AM GMT (wattos1)