NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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42530 |
1yyj   |
6560 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1603 |
data_1yyj_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1yyj
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1yyj 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1yyj
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1yyj "Master copy" parsed_1yyj
stop_
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save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1yyj
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1yyj.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1yyj 1
1 1yyj.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 1603 parsed_1yyj 1
1 1yyj.mr . . "MR format" 3 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1yyj 1
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save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1yyj
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER DE NOVO PROTEIN 25-FEB-05 1YYJ
*TITLE THE NMR SOLUTION STRUCTURE OF A REDESIGNED APOCYTOCHROME
*TITLE 2 B562:RD-APOCYT B562
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: REDESIGNED APOCYTOCHROME B562;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 3 OTHER_DETAILS: THE PEPTIDE WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED. THE
*SOURCE 4 SEQUENCE OF THE PEPTIDE IS NATURALLY FOUND IN HOMO SAPIENS
*SOURCE 5 (HUMAN).
*KEYWDS FOUR HELIX PROTEIN, STRUCTURAL GENOMICS, PSI, PROTEIN
*KEYWDS 2 STRUCTURE INITIATIVE, BERKELEY STRUCTURAL GENOMICS CENTER,
*KEYWDS 3 BSGC
*EXPDTA NMR, 10 STRUCTURES
*AUTHOR H.FENG, J.TAKEI, R.LIPSITZ, N.TJANDRA, Y.BAI, BERKELEY
*AUTHOR 2 STRUCTURAL GENOMICS CENTER (BSGC)
*REVDAT 1 25-AUG-05 1YYJ 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1yyj
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1yyj 1
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3 1 . . . parsed_1yyj 1
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170 1 2 . . . . . . . . . 14 . HD1# parsed_1yyj 1
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173 1 2 . . . . . . . . . 15 . HN parsed_1yyj 1
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I98
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R99
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A100
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Y101
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N102
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Q103
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Y105
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1128
;
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G106
@ END_XPLR_NOE_FILE
pck2xplr.nawk Table; Input File: cnoeC1C.PCK
Date: Fri Jun 27 14:36:18 EDT 2003
Path: /home/fengh/My_xplor/ING_new2
@ BEGIN_XPLR_PCK_SUM
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Total 536 93 131 189 123
@ END_XPLR_PCK_SUM
@ BEGIN_XPLR_NOE_FILE
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L3
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V84
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A.350 at 1.20e+07
assign (resid 84 and name HA ) (resid 86 and name HB2 ) 3.5 1.2 0.5 ! A.376 at 1.99e+07
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K85
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E86
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A.611 at 3.90e+07
A87
Q88
;
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A.761 at 1.20e+07
A89
A90
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A91
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E92
;
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1551
;
A.142 at 3.57e+07
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assign (resid 92 and name HB1 ) (resid 96 and name HG2# ) 4.5 2.2 2.5 ! A.832 at 3.26e+06
Q93
;
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;
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assign (resid 93 and name HB1 ) (resid 97 and name HB ) 4.5 2.2 2.0 ! A.588 at 1.43e+06
L94
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T96
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T97
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;
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R99
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;
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assign (resid 99 and name HD2 ) (resid 103 and name HG2 ) 4.0 2.2 1.0 ! A.572 at 1.17e+07
assign (resid 99 and name HA ) (resid 103 and name HG2 ) 4.0 2.2 1.0 ! A.214 at 1.38e+07
A100
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Y101
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N102
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Y105
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G106
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