NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
|
|
408764 |
1z0r   |
4281 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1z0r
save_distance_constraint_statistics_1
_Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 2685
_Distance_constraint_stats_list.Viol_count 2613
_Distance_constraint_stats_list.Viol_total 1807.251
_Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.825
_Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0474
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0137
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0988
_Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500
_Distance_constraint_stats_list.Details
;
Description of the tags in this list:
* 1 * Administrative tag
* 2 * Administrative tag
* 3 * Administrative tag
* 4 * ID of the restraint list.
* 5 * Number of restraints in list.
* 6 * Number of violated restraints (each model violation is used).
* 7 * Sum of violations in Angstrom.
* 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way.
* 9 * Rms of violations over all restraints.
* 10 * Average violation over all restraints.
* 11 * Average violation over violated restraints.
This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated.
These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998).
* 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table.
* 13 * This tag
Description of the tags in the per residue table below:
* 1 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 2 * Residue number
* 3 * Residue name
* 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging)
* 5 * Model number with the maximum violation
* 6 * Number of models with a violation above cutoff
* 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff.
An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest
violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff.
For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'.
For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1.
* 8 * Administrative tag
* 9 * Administrative tag
Description of the tags in the per restraint table below:
* 1 * Restraint ID within restraint list.
First node, FIRST member, first atom's:
* 2 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 3 * Residue number
* 4 * Residue name
* 5 * Name of (pseudo-)atom
First node, SECOND member, first atom's:
* 6 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 7 * Residue number
* 8 * Residue name
* 9 * Name of (pseudo-)atom
FIRST node's:
* 10 * Target distance value (Angstrom)
* 11 * Lower bound distance (Angstrom)
* 12 * Upper bound distance (Angstrom)
* 13 * Average distance in ensemble of models
* 14 * Minimum distance in ensemble of models
* 15 * Maximum distance in ensemble of models
* 16 * Maximum violation (without any averaging)
* 17 * Model number with the maximum violation
* 18 * Number of models with a violation above cutoff
* 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above.
* 20 * Administrative tag
* 21 * Administrative tag
;
loop_
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model
1 2 LYS 6.092 0.825 2 1 "[ + . ]"
1 3 SER 10.199 0.357 2 0 "[ . ]"
1 4 THR 6.924 0.463 7 0 "[ . ]"
1 5 GLY 3.467 0.199 5 0 "[ . ]"
1 6 ILE 3.862 0.357 2 0 "[ . ]"
1 7 VAL 6.804 0.263 4 0 "[ . ]"
1 8 ARG 5.698 0.394 6 0 "[ . ]"
1 9 LYS 9.189 0.825 2 1 "[ + . ]"
1 10 VAL 6.365 0.190 3 0 "[ . ]"
1 11 ASP 4.293 0.276 7 0 "[ . ]"
1 12 GLU 10.309 0.481 5 0 "[ . ]"
1 13 LEU 4.297 0.481 5 0 "[ . ]"
1 14 GLY 3.011 0.190 3 0 "[ . ]"
1 15 ARG 7.318 0.481 5 0 "[ . ]"
1 16 VAL 7.714 0.528 6 2 "[ -.+ ]"
1 17 VAL 3.405 0.242 6 0 "[ . ]"
1 18 ILE 15.225 0.394 6 0 "[ . ]"
1 19 PRO 5.650 0.249 5 0 "[ . ]"
1 20 ILE 9.360 0.360 4 0 "[ . ]"
1 21 GLU 9.065 0.315 4 0 "[ . ]"
1 22 LEU 8.362 0.394 6 0 "[ . ]"
1 23 ARG 8.124 0.394 6 0 "[ . ]"
1 24 ARG 14.251 0.631 1 1 "[+ . ]"
1 25 THR 10.830 0.394 6 0 "[ . ]"
1 26 LEU 5.492 0.289 4 0 "[ . ]"
1 27 GLY 3.697 0.299 7 0 "[ . ]"
1 28 ILE 4.627 0.289 4 0 "[ . ]"
1 29 ALA 6.063 0.447 2 0 "[ . ]"
1 30 GLU 8.948 0.664 6 3 "[* -.+ ]"
1 31 LYS 6.856 0.275 1 0 "[ . ]"
1 32 ASP 14.168 0.825 2 2 "[ + * ]"
1 33 ALA 7.110 0.680 5 2 "[ - + ]"
1 34 LEU 14.200 0.825 2 1 "[ + . ]"
1 35 GLU 15.385 0.318 3 0 "[ . ]"
1 36 ILE 8.306 0.278 6 0 "[ . ]"
1 37 TYR 12.845 0.825 2 1 "[ + . ]"
1 38 VAL 15.335 0.825 2 1 "[ + . ]"
1 39 ASP 2.811 0.198 6 0 "[ . ]"
1 40 ASP 2.208 0.432 2 0 "[ . ]"
1 41 GLU 1.230 0.200 3 0 "[ . ]"
1 42 LYS 9.294 0.440 2 0 "[ . ]"
1 43 ILE 8.937 0.528 6 2 "[ -.+ ]"
1 44 ILE 6.377 0.288 4 0 "[ . ]"
1 45 LEU 9.870 0.528 6 2 "[ -.+ ]"
1 46 LYS 6.964 0.272 7 0 "[ . ]"
1 47 LYS 10.754 0.825 2 1 "[ + . ]"
1 48 TYR 4.596 0.300 3 0 "[ . ]"
1 49 LYS 4.717 0.486 3 0 "[ . ]"
1 50 PRO 5.934 0.486 3 0 "[ . ]"
1 51 ASN 4.698 0.390 4 0 "[ . ]"
1 52 MET 2.999 0.390 4 0 "[ . ]"
1 53 THR 3.417 0.322 4 0 "[ . ]"
2 2 LYS 5.944 0.825 2 1 "[ + . ]"
2 3 SER 8.939 0.348 2 0 "[ . ]"
2 4 THR 5.992 0.463 7 0 "[ . ]"
2 5 GLY 3.465 0.199 5 0 "[ . ]"
2 6 ILE 3.894 0.348 2 0 "[ . ]"
2 7 VAL 7.025 0.278 6 0 "[ . ]"
2 8 ARG 5.902 0.394 6 0 "[ . ]"
2 9 LYS 8.894 0.825 2 1 "[ + . ]"
2 10 VAL 5.770 0.190 3 0 "[ . ]"
2 11 ASP 3.227 0.276 7 0 "[ . ]"
2 12 GLU 11.093 0.664 6 3 "[* -.+ ]"
2 13 LEU 3.253 0.481 5 0 "[ . ]"
2 14 GLY 4.232 0.249 5 0 "[ . ]"
2 15 ARG 8.185 0.481 5 0 "[ . ]"
2 16 VAL 7.292 0.528 6 2 "[ -.+ ]"
2 17 VAL 2.196 0.178 7 0 "[ . ]"
2 18 ILE 13.897 0.394 6 0 "[ . ]"
2 19 PRO 6.248 0.249 5 0 "[ . ]"
2 20 ILE 7.867 0.360 4 0 "[ . ]"
2 21 GLU 9.263 0.315 4 0 "[ . ]"
2 22 LEU 6.985 0.394 6 0 "[ . ]"
2 23 ARG 9.752 0.543 1 1 "[+ . ]"
2 24 ARG 10.964 0.631 1 1 "[+ . ]"
2 25 THR 10.511 0.394 6 0 "[ . ]"
2 26 LEU 5.128 0.266 1 0 "[ . ]"
2 27 GLY 2.631 0.266 1 0 "[ . ]"
2 28 ILE 5.853 0.289 4 0 "[ . ]"
2 29 ALA 7.768 0.447 2 0 "[ . ]"
2 30 GLU 9.071 0.404 1 0 "[ . ]"
2 31 LYS 5.712 0.275 1 0 "[ . ]"
2 32 ASP 13.104 0.825 2 2 "[ + * ]"
2 33 ALA 7.861 0.680 5 2 "[ - + ]"
2 34 LEU 10.104 0.825 2 1 "[ + . ]"
2 35 GLU 14.025 0.300 3 0 "[ . ]"
2 36 ILE 8.196 0.246 6 0 "[ . ]"
2 37 TYR 13.511 0.825 2 1 "[ + . ]"
2 38 VAL 14.678 0.825 2 1 "[ + . ]"
2 39 ASP 2.697 0.205 2 0 "[ . ]"
2 40 ASP 3.063 0.454 2 0 "[ . ]"
2 41 GLU 2.085 0.454 2 0 "[ . ]"
2 42 LYS 9.501 0.467 4 0 "[ . ]"
2 43 ILE 9.103 0.528 6 2 "[ -.+ ]"
2 44 ILE 5.901 0.288 4 0 "[ . ]"
2 45 LEU 10.024 0.528 6 2 "[ -.+ ]"
2 46 LYS 7.034 0.272 7 0 "[ . ]"
2 47 LYS 10.223 0.825 2 1 "[ + . ]"
2 48 TYR 4.845 0.300 3 0 "[ . ]"
2 49 LYS 4.057 0.486 3 0 "[ . ]"
2 50 PRO 4.690 0.486 3 0 "[ . ]"
2 51 ASN 5.132 0.390 4 0 "[ . ]"
2 52 MET 2.951 0.390 4 0 "[ . ]"
2 53 THR 2.838 0.217 3 0 "[ . ]"
stop_
loop_
_Distance_constraint_stats.Restraint_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_ID
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val
_Distance_constraint_stats.Distance_average
_Distance_constraint_stats.Distance_minimum
_Distance_constraint_stats.Distance_maximum
_Distance_constraint_stats.Max_violation
_Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model
_Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID
1 1 2 LYS HA 1 3 SER H 1.800 . 6.000 3.079 2.869 3.254 . 0 0 "[ . ]" 1
2 1 2 LYS HA 1 3 SER H 2.200 . 2.800 2.730 2.558 2.909 0.109 2 0 "[ . ]" 1
3 1 2 LYS HA 1 3 SER HA 1.800 . 6.000 4.543 4.434 4.634 . 0 0 "[ . ]" 1
4 1 2 LYS HA 1 3 SER QB 1.800 . 6.000 4.929 4.654 5.147 . 0 0 "[ . ]" 1
5 1 2 LYS HA 1 3 SER HB2 3.100 . 6.000 4.934 4.729 5.162 . 0 0 "[ . ]" 1
6 1 2 LYS HA 1 3 SER HB3 3.000 . 6.000 4.932 4.688 5.151 . 0 0 "[ . ]" 1
7 1 2 LYS HA 1 4 THR H 2.100 . 6.000 5.147 5.085 5.313 . 0 0 "[ . ]" 1
8 1 2 LYS HA 1 5 GLY H 2.200 . 6.000 5.449 5.306 5.528 . 0 0 "[ . ]" 1
9 1 2 LYS HA 1 25 THR H 2.600 . 6.000 5.833 5.395 6.018 0.018 2 0 "[ . ]" 1
10 1 2 LYS HA 1 38 VAL HB 2.100 . 2.700 2.347 2.279 2.403 . 0 0 "[ . ]" 1
11 1 2 LYS HB3 1 3 SER HB2 3.400 . 4.800 3.938 2.892 4.837 0.037 6 0 "[ . ]" 1
12 1 2 LYS HB3 1 3 SER HB3 3.500 . 5.000 3.853 2.777 4.662 . 0 0 "[ . ]" 1
13 1 2 LYS HB3 1 4 THR HA 3.000 . 6.000 4.501 4.340 4.716 . 0 0 "[ . ]" 1
14 1 2 LYS HB3 1 4 THR HB 2.900 . 6.000 4.252 4.027 4.397 . 0 0 "[ . ]" 1
15 1 2 LYS QD 1 2 LYS QE 1.800 . 2.200 2.077 2.015 2.091 . 0 0 "[ . ]" 1
16 1 2 LYS QD 1 3 SER HB2 3.300 . 4.700 4.247 3.444 4.724 0.024 5 0 "[ . ]" 1
17 1 2 LYS QD 1 4 THR HA 2.900 . 6.000 5.874 3.791 6.463 0.463 7 0 "[ . ]" 1
18 1 2 LYS HD2 1 3 SER HB3 3.400 . 4.800 4.309 3.514 4.770 . 0 0 "[ . ]" 1
19 1 2 LYS QE 1 2 LYS QG 1.800 . 2.200 2.213 2.067 2.300 0.100 7 0 "[ . ]" 1
20 1 2 LYS QE 1 3 SER H 1.800 . 2.200 2.133 1.851 2.407 0.207 4 0 "[ . ]" 1
21 1 2 LYS QE 1 3 SER QB 1.800 . 2.200 2.218 2.113 2.291 0.091 1 0 "[ . ]" 1
22 1 2 LYS HE2 1 3 SER H 2.200 . 2.800 1.881 1.733 2.206 . 0 0 "[ . ]" 1
23 1 2 LYS HE2 1 3 SER HA 2.400 . 3.100 2.917 2.442 3.122 0.022 4 0 "[ . ]" 1
24 1 2 LYS HE2 1 3 SER HA 2.900 . 4.000 3.084 2.946 3.320 . 0 0 "[ . ]" 1
25 1 2 LYS HE2 1 8 ARG HB2 2.800 . 3.800 3.587 3.494 3.812 0.012 2 0 "[ . ]" 1
26 1 2 LYS HE2 1 34 LEU HA 3.000 . 4.100 4.450 4.198 4.925 0.825 2 1 "[ + . ]" 1
27 1 2 LYS HE2 1 40 ASP H 2.500 . 3.300 2.750 2.617 2.998 . 0 0 "[ . ]" 1
28 1 2 LYS HE3 1 3 SER HB2 3.400 . 4.800 2.281 1.858 2.911 0.142 2 0 "[ . ]" 1
29 1 2 LYS HE3 1 4 THR HA 3.100 . 6.000 5.583 5.204 5.858 . 0 0 "[ . ]" 1
30 1 2 LYS HE3 1 8 ARG HA 2.900 . 3.900 2.937 2.605 3.767 . 0 0 "[ . ]" 1
31 1 2 LYS HE3 1 38 VAL QG 3.000 . 4.100 3.083 2.809 3.429 . 0 0 "[ . ]" 1
32 1 2 LYS QG 1 3 SER HA 1.800 . 6.000 4.204 3.799 5.586 . 0 0 "[ . ]" 1
33 1 2 LYS HG3 1 3 SER HA 3.100 . 4.300 3.553 3.378 3.766 . 0 0 "[ . ]" 1
34 1 2 LYS HG3 1 4 THR HB 2.900 . 6.000 5.970 5.637 6.322 0.322 4 0 "[ . ]" 1
35 1 2 LYS HG3 1 23 ARG HB2 2.900 . 6.000 4.367 3.681 4.980 . 0 0 "[ . ]" 1
36 1 2 LYS HG3 1 40 ASP HB3 2.000 . 6.000 5.233 4.468 5.709 . 0 0 "[ . ]" 1
37 1 3 SER H 1 3 SER HA 2.100 . 2.600 2.249 2.235 2.263 . 0 0 "[ . ]" 1
38 1 3 SER H 1 3 SER QB 1.800 . 2.200 2.292 2.168 2.423 0.223 2 0 "[ . ]" 1
39 1 3 SER H 1 3 SER HB2 2.500 . 3.300 2.188 1.959 2.388 . 0 0 "[ . ]" 1
40 1 3 SER H 1 4 THR HA 1.800 . 6.000 5.448 5.357 5.568 . 0 0 "[ . ]" 1
41 1 3 SER H 1 38 VAL MG1 2.900 . 3.900 2.717 2.566 3.064 . 0 0 "[ . ]" 1
42 1 3 SER H 1 39 ASP HA 3.000 . 4.200 4.183 3.921 4.382 0.182 4 0 "[ . ]" 1
43 1 3 SER HA 1 4 THR H 1.800 . 2.200 2.116 2.081 2.177 . 0 0 "[ . ]" 1
44 1 3 SER HA 1 4 THR H 1.900 . 2.300 1.883 1.858 1.960 . 0 0 "[ . ]" 1
45 1 3 SER HA 1 5 GLY H 2.200 . 2.800 2.838 2.801 2.892 0.092 4 0 "[ . ]" 1
46 1 3 SER HA 1 4 THR HG1 1.800 . 6.000 3.505 3.030 3.704 . 0 0 "[ . ]" 1
47 1 3 SER HA 1 4 THR MG 2.700 . 3.600 3.115 2.918 3.201 . 0 0 "[ . ]" 1
48 1 3 SER HA 1 5 GLY QA 1.800 . 6.000 5.278 5.185 5.411 . 0 0 "[ . ]" 1
49 1 3 SER HA 1 6 ILE HB 1.800 . 6.000 6.309 6.264 6.357 0.357 2 0 "[ . ]" 1
50 1 3 SER HA 1 22 LEU MD2 3.100 . 4.300 2.556 2.468 2.604 . 0 0 "[ . ]" 1
51 1 3 SER HA 1 36 ILE HA 2.900 . 6.000 6.077 6.054 6.119 0.119 2 0 "[ . ]" 1
52 1 3 SER HA 1 37 TYR HA 1.900 . 2.300 2.388 2.340 2.448 0.148 4 0 "[ . ]" 1
53 1 3 SER HA 1 37 TYR HB2 2.800 . 3.800 3.358 3.212 3.509 . 0 0 "[ . ]" 1
54 1 3 SER HA 1 38 VAL H 2.600 . 3.500 1.666 1.568 1.792 0.132 2 0 "[ . ]" 1
55 1 3 SER HA 1 38 VAL HB 2.800 . 3.800 2.056 1.970 2.141 . 0 0 "[ . ]" 1
56 1 3 SER HA 1 38 VAL QG 2.900 . 3.900 2.315 2.120 2.476 . 0 0 "[ . ]" 1
57 1 3 SER HA 1 38 VAL QG 3.100 . 4.300 2.760 2.650 2.913 . 0 0 "[ . ]" 1
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