NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
384242 | 1ka7 | 5211 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1ka7 save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 2159 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 83 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 2.220 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.194 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0086 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0010 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0267 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 2 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 3 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 4 VAL 0.015 0.015 1 0 "[ ]" 1 5 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 6 VAL 0.025 0.013 1 0 "[ ]" 1 7 TYR 0.026 0.015 1 0 "[ ]" 1 8 HIS 0.429 0.194 1 0 "[ ]" 1 9 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 10 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 11 ILE 0.028 0.008 1 0 "[ ]" 1 12 SER 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 13 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 14 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 15 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 16 GLY 0.004 0.004 1 0 "[ ]" 1 17 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 18 LYS 0.020 0.012 1 0 "[ ]" 1 19 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 20 LEU 0.030 0.015 1 0 "[ ]" 1 21 LEU 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 22 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 23 THR 0.157 0.073 1 0 "[ ]" 1 24 GLY 0.022 0.022 1 0 "[ ]" 1 25 LEU 0.027 0.017 1 0 "[ ]" 1 26 ASP 0.056 0.028 1 0 "[ ]" 1 27 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 28 SER 0.039 0.029 1 0 "[ ]" 1 29 TYR 0.042 0.029 1 0 "[ ]" 1 30 LEU 0.093 0.026 1 0 "[ ]" 1 31 LEU 0.013 0.013 1 0 "[ ]" 1 32 ARG 0.017 0.009 1 0 "[ ]" 1 33 ASP 0.020 0.010 1 0 "[ ]" 1 34 SER 0.040 0.013 1 0 "[ ]" 1 35 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 36 SER 0.018 0.018 1 0 "[ ]" 1 37 VAL 0.016 0.013 1 0 "[ ]" 1 38 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 39 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 40 VAL 0.031 0.018 1 0 "[ ]" 1 41 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 42 CYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 43 LEU 0.135 0.057 1 0 "[ ]" 1 44 CYS 0.048 0.029 1 0 "[ ]" 1 45 VAL 0.312 0.164 1 0 "[ ]" 1 46 LEU 0.038 0.022 1 0 "[ ]" 1 47 TYR 0.238 0.164 1 0 "[ ]" 1 48 HIS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 49 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 50 TYR 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 51 ILE 0.079 0.027 1 0 "[ ]" 1 52 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 53 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 54 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 55 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 56 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 58 GLN 0.024 0.020 1 0 "[ ]" 1 59 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 60 GLU 0.023 0.021 1 0 "[ ]" 1 61 THR 0.048 0.025 1 0 "[ ]" 1 62 GLY 0.025 0.025 1 0 "[ ]" 1 63 SER 0.004 0.003 1 0 "[ ]" 1 64 TRP 0.025 0.018 1 0 "[ ]" 1 65 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 66 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 67 GLU 0.000 0.000 1 0 "[ ]" 1 68 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 69 ALA 0.004 0.004 1 0 "[ ]" 1 70 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 71 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 72 VAL 0.004 0.004 1 0 "[ ]" 1 73 HIS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 74 LYS 0.016 0.016 1 0 "[ ]" 1 75 ARG 0.045 0.045 1 0 "[ ]" 1 76 TYR 0.017 0.016 1 0 "[ ]" 1 77 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 78 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 79 LYS 0.048 0.018 1 0 "[ ]" 1 80 ILE 0.023 0.008 1 0 "[ ]" 1 81 LYS 0.024 0.016 1 0 "[ ]" 1 82 ASN 0.038 0.024 1 0 "[ ]" 1 83 LEU 0.020 0.020 1 0 "[ ]" 1 84 ILE 0.082 0.034 1 0 "[ ]" 1 85 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 86 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 87 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 88 GLN 0.073 0.027 1 0 "[ ]" 1 89 LYS 0.024 0.015 1 0 "[ ]" 1 90 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 91 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 92 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 93 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 94 ILE 0.069 0.043 1 0 "[ ]" 1 95 VAL 0.047 0.029 1 0 "[ ]" 1 96 ILE 0.128 0.039 1 0 "[ ]" 1 97 PRO 0.083 0.043 1 0 "[ ]" 1 98 LEU 0.040 0.020 1 0 "[ ]" 1 99 GLN 0.169 0.088 1 0 "[ ]" 1 100 TYR 0.462 0.150 1 0 "[ ]" 1 101 PRO 0.024 0.024 1 0 "[ ]" 1 102 VAL 0.039 0.024 1 0 "[ ]" 1 103 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 104 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 105 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 106 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 4 LEU 0.017 0.013 1 0 "[ ]" 2 5 THR 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 2 6 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 7 TYR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 8 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 9 GLN 0.000 0.000 1 0 "[ ]" 2 10 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 11 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 2 12 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 2 ASP HA 1 3 ALA H 2.700 2.200 3.200 2.424 2.424 2.424 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 2 ASP HA 1 3 ALA MB 4.300 3.400 5.200 4.274 4.274 4.274 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 2 ASP HA 1 4 VAL H 5.900 4.700 6.000 5.197 5.197 5.197 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 2 ASP HB2 1 3 ALA H 4.000 3.200 4.800 4.593 4.593 4.593 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 2 ASP HB2 1 4 VAL MG2 4.600 3.700 5.500 4.900 4.900 4.900 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 2 ASP HB2 1 80 ILE MG 4.200 2.700 5.700 4.752 4.752 4.752 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 2 ASP HB3 1 3 ALA H 4.100 3.300 4.900 4.252 4.252 4.252 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 3 ALA H 1 3 ALA HA 3.000 2.400 3.600 2.920 2.920 2.920 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 3 ALA H 1 3 ALA MB 2.500 . 3.400 2.174 2.174 2.174 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 3 ALA H 1 4 VAL H 3.900 3.100 4.700 4.212 4.212 4.212 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 3 ALA HA 1 3 ALA MB 2.200 . 2.600 2.104 2.104 2.104 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 3 ALA HA 1 4 VAL H 2.300 . 2.800 2.186 2.186 2.186 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 3 ALA HA 1 4 VAL MG2 4.400 2.900 5.900 3.892 3.892 3.892 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 3 ALA MB 1 4 VAL H 3.700 3.000 4.400 3.477 3.477 3.477 . 0 0 "[ ]" 1 15 1 3 ALA MB 1 81 LYS HB3 1.900 . 6.000 5.209 5.209 5.209 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 4 VAL H 1 4 VAL HB 2.800 2.200 3.400 2.669 2.669 2.669 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 4 VAL H 1 4 VAL QG 2.700 2.200 3.200 2.634 2.634 2.634 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 4 VAL H 1 4 VAL MG2 2.500 . 3.400 2.681 2.681 2.681 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 4 VAL H 1 6 VAL MG2 5.000 4.000 6.000 5.480 5.480 5.480 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 4 VAL H 1 7 TYR HB3 4.900 3.900 5.900 5.520 5.520 5.520 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 4 VAL H 1 80 ILE MG 5.800 4.600 6.000 5.173 5.173 5.173 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 4 VAL HA 1 4 VAL MG2 3.000 . 4.000 2.364 2.364 2.364 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 4 VAL HA 1 5 ALA MB 5.500 3.600 6.000 4.129 4.129 4.129 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 4 VAL HB 1 4 VAL QG 2.100 . 2.800 1.879 1.879 1.879 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 4 VAL HB 1 4 VAL MG2 2.400 . 2.900 2.094 2.094 2.094 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 4 VAL HB 1 6 VAL H 5.200 4.200 6.000 4.643 4.643 4.643 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 4 VAL HB 1 6 VAL MG2 4.500 2.900 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