NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
655768 |
6vrj   |
30721 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1138 |
data_6vrj_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_6vrj
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_6vrj 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_6vrj
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 6vrj "Master copy" parsed_6vrj
stop_
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save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_6vrj
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 6vrj.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6vrj 1
1 6vrj.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 936 parsed_6vrj 1
1 6vrj.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 78 parsed_6vrj 1
1 6vrj.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 124 parsed_6vrj 1
1 6vrj.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_6vrj 1
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save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_6vrj
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER TRANSLATION 07-FEB-20 6VRJ
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA IF3 C-TERMINAL DOMAIN
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: TRANSLATION INITIATION FACTOR IF-3;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: C-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 81-177;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: PSEUDOMONAS AERUGINOSA;
*SOURCE 3 ORGANISM_TAXID: 287;
*SOURCE 4 GENE: INFC, IPC47_09970;
*SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562
*KEYWDS TRANSLATION INITIATION FACTOR 3, TRANSLATION
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 10
*AUTHOR Y.ZHANG,L.LI
*REVDAT 1 10-FEB-21 6VRJ 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6vrj
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6vrj 1
2 1 . . . parsed_6vrj 1
3 1 . . . parsed_6vrj 1
4 1 . . . parsed_6vrj 1
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23 1 . . . parsed_6vrj 1
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136 L121 993 1 993 6 parsed_6vrj 1
137 S122 998 1 998 6 parsed_6vrj 1
138 E123 1001 1 1001 6 parsed_6vrj 1
139 D125 1005 1 1005 6 parsed_6vrj 1
140 K126 1010 1 1010 6 parsed_6vrj 1
141 A127 1018 1 1018 6 parsed_6vrj 1
142 K128 1026 1 1026 6 parsed_6vrj 1
143 V129 1033 1 1033 6 parsed_6vrj 1
144 S130 1043 1 1043 6 parsed_6vrj 1
145 L131 1048 1 1048 6 parsed_6vrj 1
146
;
R132
assign (resid 132 and name HA )(resid 132 and name HB# ) 0.0 1.0 4.0
;
1065 1 1066 81 parsed_6vrj 1
147 F133 1072 1 1072 6 parsed_6vrj 1
148
;
assign (resid 133 and name HA )(resid 134 and name HG# ) 0.0 1.0 5.5
R136
assign (resid 136 and name HA )(resid 136 and name HB# ) 0.0 1.0 4.0
;
1077 1 1080 81 parsed_6vrj 1
149 E137 1083 1 1083 6 parsed_6vrj 1
150 M138 1089 1 1089 6 parsed_6vrj 1
151 A139 1094 1 1094 6 parsed_6vrj 1
152 H140 1100 1 1100 6 parsed_6vrj 1
153 Q141 1107 1 1107 6 parsed_6vrj 1
154 E142 1114 1 1114 6 parsed_6vrj 1
155 L143 1121 1 1121 6 parsed_6vrj 1
156 M145 1131 1 1131 6 parsed_6vrj 1
157 E146 1138 1 1138 6 parsed_6vrj 1
158 L147 1146 1 1146 6 parsed_6vrj 1
159 "assign (resid 147 and name HD2# )(resid 101 and name HA ) 0.0 1.5 6.5" 1154 1 1154 81 parsed_6vrj 1
160 L148 1161 1 1161 6 parsed_6vrj 1
161 K149 1176 1 1176 6 parsed_6vrj 1
162
;
R150
assign (resid 150 and name HA )(resid 150 and name HB# ) 0.0 1.0 4.0
;
1184 1 1185 81 parsed_6vrj 1
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171 G159 1259 1 1259 6 parsed_6vrj 1
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173 V161 1270 1 1270 6 parsed_6vrj 1
174 "assign (resid 161 and name HG1# )(resid 174 and name HB# ) 0.0 2.5 7.0" 1275 1 1275 82 parsed_6vrj 1
175 "assign (resid 161 and name HG1# )(resid 164 and name HD2 ) 0.0 1.5 6.5" 1278 1 1278 82 parsed_6vrj 1
176
;
assign (resid 161 and name HG2# )(resid 176 and name HD1# ) 0.0 3.0 7.5
E162
;
1282 1 1284 6 parsed_6vrj 1
177 Q163 1291 1 1291 6 parsed_6vrj 1
178 "assign (resid 163 and name HA )(resid 162 and name HG# ) 0.0 1.0 6.0" 1296 1 1296 81 parsed_6vrj 1
179 H164 1303 1 1303 6 parsed_6vrj 1
180 "assign (resid 164 and name HA )(resid 161 and name HA ) 0.0 0.0 5.0" 1307 1 1307 80 parsed_6vrj 1
181 P165 1311 1 1311 6 parsed_6vrj 1
182 K166 1319 1 1319 6 parsed_6vrj 1
183 L167 1326 1 1326 6 parsed_6vrj 1
184 E168 1337 1 1337 6 parsed_6vrj 1
185
;
R170
assign (resid 170 and name HA )(resid 170 and name HB# ) 0.0 1.0 4.0
;
1340 1 1341 81 parsed_6vrj 1
186 Q171 1344 1 1344 6 parsed_6vrj 1
187 L172 1352 1 1352 6 parsed_6vrj 1
188 M173 1363 1 1363 6 parsed_6vrj 1
189 M174 1373 1 1373 6 parsed_6vrj 1
190 V175 1381 1 1381 6 parsed_6vrj 1
191 I176 1393 1 1393 6 parsed_6vrj 1
192 A177 1406 1 1406 6 parsed_6vrj 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 1: IF3CT_nmrrestraints" 1 1 1 40 parsed_6vrj 1
2 ******************************************************************************* 768 1 768 79 parsed_6vrj 1
3 ********************************************************************************* 1416 1 1416 81 parsed_6vrj 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_6vrj
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_6vrj 2
2 1 . . . parsed_6vrj 2
3 1 . . . parsed_6vrj 2
4 1 . . . parsed_6vrj 2
5 1 . . . parsed_6vrj 2
6 1 . . . parsed_6vrj 2
7 1 . . . parsed_6vrj 2
8 1 . . . parsed_6vrj 2
9 1 . . . parsed_6vrj 2
10 1 . . . parsed_6vrj 2
11 1 . . . parsed_6vrj 2
12 1 . . . parsed_6vrj 2
13 1 . . . parsed_6vrj 2
14 1 . . . parsed_6vrj 2
15 1 . . . parsed_6vrj 2
16 1 . . . parsed_6vrj 2
17 1 . . . parsed_6vrj 2
18 1 . . . parsed_6vrj 2
19 1 . . . parsed_6vrj 2
20 1 . . . parsed_6vrj 2
21 1 . . . parsed_6vrj 2
22 1 . . . parsed_6vrj 2
23 1 . . . parsed_6vrj 2
24 1 . . . parsed_6vrj 2
25 1 . . . parsed_6vrj 2
26 1 . . . parsed_6vrj 2
27 1 . . . parsed_6vrj 2
28 1 . . . parsed_6vrj 2
29 1 . . . parsed_6vrj 2
30 1 . . . parsed_6vrj 2
31 1 . . . parsed_6vrj 2
32 1 . . . parsed_6vrj 2
33 1 . . . parsed_6vrj 2
34 1 . . . parsed_6vrj 2
35 1 . . . parsed_6vrj 2
36 1 . . . parsed_6vrj 2
37 1 . . . parsed_6vrj 2
38 1 . . . parsed_6vrj 2
39 1 . . . parsed_6vrj 2
40 1 . . . parsed_6vrj 2
41 1 . . . parsed_6vrj 2
42 1 . . . parsed_6vrj 2
43 1 . . . parsed_6vrj 2
44 1 . . . parsed_6vrj 2
45 1 . . . parsed_6vrj 2
46 1 . . . parsed_6vrj 2
47 1 . . . parsed_6vrj 2
48 1 . . . parsed_6vrj 2
49 1 . . . parsed_6vrj 2
50 1 . . . parsed_6vrj 2
51 1 . . . parsed_6vrj 2
52 1 . . . parsed_6vrj 2
53 1 . . . parsed_6vrj 2
54 1 . . . parsed_6vrj 2
55 1 . . . parsed_6vrj 2
56 1 . . . parsed_6vrj 2
57 1 . . . parsed_6vrj 2
58 1 . . . parsed_6vrj 2
59 1 . . . parsed_6vrj 2
60 1 . . . parsed_6vrj 2
61 1 . . . parsed_6vrj 2
62 1 . . . parsed_6vrj 2
63 1 . . . parsed_6vrj 2
64 1 . . . parsed_6vrj 2
65 1 . . . parsed_6vrj 2
66 1 . . . parsed_6vrj 2
67 1 . . . parsed_6vrj 2
68 1 . . . parsed_6vrj 2
69 1 . . . parsed_6vrj 2
70 1 . . . parsed_6vrj 2
71 1 . . . parsed_6vrj 2
72 1 . . . parsed_6vrj 2
73 1 . . . parsed_6vrj 2
74 1 . . . parsed_6vrj 2
75 1 . . . parsed_6vrj 2
76 1 . . . parsed_6vrj 2
77 1 . . . parsed_6vrj 2
78 1 . . . parsed_6vrj 2
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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2 1 1 . . . . . . . . . 107 . O parsed_6vrj 2
2 1 2 . . . . . . . . . 111 . HN parsed_6vrj 2
3 1 1 . . . . . . . . . 108 . O parsed_6vrj 2
3 1 2 . . . . . . . . . 112 . N parsed_6vrj 2
4 1 1 . . . . . . . . . 108 . O parsed_6vrj 2
4 1 2 . . . . . . . . . 112 . HN parsed_6vrj 2
5 1 1 . . . . . . . . . 109 . O parsed_6vrj 2
5 1 2 . . . . . . . . . 113 . N parsed_6vrj 2
6 1 1 . . . . . . . . . 109 . O parsed_6vrj 2
6 1 2 . . . . . . . . . 113 . HN parsed_6vrj 2
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7 1 2 . . . . . . . . . 114 . N parsed_6vrj 2
8 1 1 . . . . . . . . . 110 . O parsed_6vrj 2
8 1 2 . . . . . . . . . 114 . HN parsed_6vrj 2
9 1 1 . . . . . . . . . 111 . O parsed_6vrj 2
9 1 2 . . . . . . . . . 115 . N parsed_6vrj 2
10 1 1 . . . . . . . . . 111 . O parsed_6vrj 2
10 1 2 . . . . . . . . . 115 . HN parsed_6vrj 2
11 1 1 . . . . . . . . . 112 . O parsed_6vrj 2
11 1 2 . . . . . . . . . 116 . N parsed_6vrj 2
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12 1 2 . . . . . . . . . 116 . HN parsed_6vrj 2
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13 1 2 . . . . . . . . . 117 . N parsed_6vrj 2
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14 1 2 . . . . . . . . . 117 . HN parsed_6vrj 2
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15 1 2 . . . . . . . . . 118 . N parsed_6vrj 2
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17 1 2 . . . . . . . . . 119 . N parsed_6vrj 2
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18 1 2 . . . . . . . . . 119 . HN parsed_6vrj 2
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19 1 2 . . . . . . . . . 120 . N parsed_6vrj 2
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20 1 2 . . . . . . . . . 120 . HN parsed_6vrj 2
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24 1 2 . . . . . . . . . 122 . HN parsed_6vrj 2
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29 1 2 . . . . . . . . . 143 . N parsed_6vrj 2
30 1 1 . . . . . . . . . 139 . O parsed_6vrj 2
30 1 2 . . . . . . . . . 143 . HN parsed_6vrj 2
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34 1 2 . . . . . . . . . 145 . HN parsed_6vrj 2
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35 1 2 . . . . . . . . . 146 . N parsed_6vrj 2
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36 1 2 . . . . . . . . . 146 . HN parsed_6vrj 2
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37 1 2 . . . . . . . . . 147 . N parsed_6vrj 2
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38 1 2 . . . . . . . . . 147 . HN parsed_6vrj 2
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44 1 2 . . . . . . . . . 150 . HN parsed_6vrj 2
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loop_
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loop_
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
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_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1
;
!!alpha helix
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;
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_Dist_constraint_parse_err.End_column
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4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -139.8 -99.8 . . 98 . C . 99 . N . 99 . CA . 99 . C parsed_6vrj 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -136.6 -80.8 . . 99 . C . 100 . N . 100 . CA . 100 . C parsed_6vrj 1
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7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -80.5 -40.5 . . 106 . C . 107 . N . 107 . CA . 107 . C parsed_6vrj 1
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9 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -91.1 -51.1 . . 108 . C . 109 . N . 109 . CA . 109 . C parsed_6vrj 1
10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -81.4 -41.4 . . 109 . C . 110 . N . 110 . CA . 110 . C parsed_6vrj 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -84.2 -44.2 . . 110 . C . 111 . N . 111 . CA . 111 . C parsed_6vrj 1
12 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -86.0 -46.0 . . 111 . C . 112 . N . 112 . CA . 112 . C parsed_6vrj 1
13 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -85.7 -45.7 . . 112 . C . 113 . N . 113 . CA . 113 . C parsed_6vrj 1
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25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -141.0 -101.0 . . 128 . C . 129 . N . 129 . CA . 129 . C parsed_6vrj 1
26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -150.3 -102.1 . . 129 . C . 130 . N . 130 . CA . 130 . C parsed_6vrj 1
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29 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -155.8 -88.2 . . 132 . C . 133 . N . 133 . CA . 133 . C parsed_6vrj 1
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33 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -102.0 -22.0 . . 138 . C . 139 . N . 139 . CA . 139 . C parsed_6vrj 1
34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -83.9 -43.9 . . 140 . C . 141 . N . 141 . CA . 141 . C parsed_6vrj 1
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165 P -61.263 144.524 9.990 12.296 0.749 0.854 10 12 Generous
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(resid 165 and name CA ) (resid 165 and name C ) 1.0 -61.3 30.0 2
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(resid 106 and name C ) (resid 107 and name N ) 1.0 138.3 28.6 2
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84
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(resid 123 and name C ) (resid 124 and name N ) 1.0 -34.7 20.1 2
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92
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Contact the webmaster for help, if required. Saturday, June 1, 2024 9:51:47 PM GMT (wattos1)