NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
566629 |
2mby   |
19416 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 631 |
data_2mby_MR_file_constraints
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2mby
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2mby 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2mby
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2mby "Master copy" parsed_2mby
stop_
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save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2mby
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2mby.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2mby 1
1 2mby.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 523 parsed_2mby 1
1 2mby.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 68 parsed_2mby 1
1 2mby.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "hydrogen bond" simple 40 parsed_2mby 1
1 2mby.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2mby 1
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save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2mby
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA BINDING PROTEIN 08-AUG-13 2MBY
*TITLE NMR STRUCTURE OF RRP7 C-TERMINAL DOMAIN
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: RIBOSOMAL RNA-PROCESSING PROTEIN 7;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: UNP RESIDUES 256-297;
*COMPND 5 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: SACCHAROMYCES CEREVISIAE;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: YEAST;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 559292;
*SOURCE 5 STRAIN: ATCC 204508 / S288C;
*SOURCE 6 GENE: RRP7, YCL031C, YCL184, YCL31C;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 10 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PETDUET
*KEYWDS 90S PRERIBOSOME, NUCLEOLUS, RNA BINDING PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 1
*AUTHOR J.LIN, Y.FENG, K.YE
*REVDAT 1 25-SEP-13 2MBY 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2mby
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2mby 1
2 1 . . . parsed_2mby 1
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138 1 . . . parsed_2mby 1
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21 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -110.10 -42.00 . . 263 . C . 264 . N . 264 . CA . 264 . C parsed_2mby 1
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24 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -74.50 26.40 . . 268 . N . 268 . CA . 268 . C . 269 . N parsed_2mby 1
25 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -82.90 -42.90 . . 268 . C . 269 . N . 269 . CA . 269 . C parsed_2mby 1
26 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -61.90 -21.90 . . 269 . N . 269 . CA . 269 . C . 270 . N parsed_2mby 1
27 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -97.10 -39.40 . . 269 . C . 270 . N . 270 . CA . 270 . C parsed_2mby 1
28 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -57.30 -16.10 . . 270 . N . 270 . CA . 270 . C . 271 . N parsed_2mby 1
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34 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -60.80 -14.60 . . 273 . N . 273 . CA . 273 . C . 274 . N parsed_2mby 1
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36 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -60.40 -15.30 . . 274 . N . 274 . CA . 274 . C . 275 . N parsed_2mby 1
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65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -147.30 -45.80 . . 292 . C . 293 . N . 293 . CA . 293 . C parsed_2mby 1
66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103.20 173.00 . . 293 . N . 293 . CA . 293 . C . 294 . N parsed_2mby 1
67 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -111.20 -49.80 . . 293 . C . 294 . N . 294 . CA . 294 . C parsed_2mby 1
68 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90.30 173.90 . . 294 . N . 294 . CA . 294 . C . 295 . N parsed_2mby 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2mby
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . parsed_2mby 2
3 1 . . . parsed_2mby 2
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5 1 . . . parsed_2mby 2
6 1 . . . parsed_2mby 2
7 1 . . . parsed_2mby 2
8 1 . . . parsed_2mby 2
9 1 . . . parsed_2mby 2
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12 1 . . . parsed_2mby 2
13 1 . . . parsed_2mby 2
14 1 . . . parsed_2mby 2
15 1 . . . parsed_2mby 2
16 1 . . . parsed_2mby 2
17 1 . . . parsed_2mby 2
18 1 . . . parsed_2mby 2
19 1 . . . parsed_2mby 2
20 1 . . . parsed_2mby 2
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22 1 . . . parsed_2mby 2
23 1 . . . parsed_2mby 2
24 1 . . . parsed_2mby 2
25 1 . . . parsed_2mby 2
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27 1 . . . parsed_2mby 2
28 1 . . . parsed_2mby 2
29 1 . . . parsed_2mby 2
30 1 . . . parsed_2mby 2
31 1 . . . parsed_2mby 2
32 1 . . . parsed_2mby 2
33 1 . . . parsed_2mby 2
34 1 . . . parsed_2mby 2
35 1 . . . parsed_2mby 2
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37 1 . . . parsed_2mby 2
38 1 . . . parsed_2mby 2
39 1 . . . parsed_2mby 2
40 1 . . . parsed_2mby 2
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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4 1 1 . . . . . . . . . 255 . O parsed_2mby 2
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5 1 2 . . . . . . . . . 260 . HN parsed_2mby 2
6 1 1 . . . . . . . . . 256 . O parsed_2mby 2
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8 1 1 . . . . . . . . . 257 . O parsed_2mby 2
8 1 2 . . . . . . . . . 261 . N parsed_2mby 2
9 1 1 . . . . . . . . . 258 . O parsed_2mby 2
9 1 2 . . . . . . . . . 262 . HN parsed_2mby 2
10 1 1 . . . . . . . . . 258 . O parsed_2mby 2
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11 1 2 . . . . . . . . . 263 . HN parsed_2mby 2
12 1 1 . . . . . . . . . 259 . O parsed_2mby 2
12 1 2 . . . . . . . . . 263 . N parsed_2mby 2
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16 1 1 . . . . . . . . . 271 . O parsed_2mby 2
16 1 2 . . . . . . . . . 275 . N parsed_2mby 2
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17 1 2 . . . . . . . . . 276 . HN parsed_2mby 2
18 1 1 . . . . . . . . . 272 . O parsed_2mby 2
18 1 2 . . . . . . . . . 276 . N parsed_2mby 2
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20 1 2 . . . . . . . . . 277 . N parsed_2mby 2
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21 1 2 . . . . . . . . . 278 . HN parsed_2mby 2
22 1 1 . . . . . . . . . 274 . O parsed_2mby 2
22 1 2 . . . . . . . . . 278 . N parsed_2mby 2
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30 1 2 . . . . . . . . . 282 . N parsed_2mby 2
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38 1 2 . . . . . . . . . 286 . N parsed_2mby 2
39 1 1 . . . . . . . . . 283 . O parsed_2mby 2
39 1 2 . . . . . . . . . 287 . HN parsed_2mby 2
40 1 1 . . . . . . . . . 283 . O parsed_2mby 2
40 1 2 . . . . . . . . . 287 . N parsed_2mby 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
_Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err
_Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err
_Dist_constraint_value.Distance_val
_Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val
_Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val
_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . . . 2.0 1.9 2.1 parsed_2mby 2
2 1 . . . . . 3.0 2.9 3.1 parsed_2mby 2
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