NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | item_count |
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495811 |
2xfm   |
cing | 2-parsed | STAR | dihedral angle | 219 |
data_2xfm_MR_file_constraints
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_Study_list.Entry_ID parsed_2xfm
_Study_list.ID 1
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_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2xfm 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Entry.Version_type original
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_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
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_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
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_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2xfm "Master copy" parsed_2xfm
stop_
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_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
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_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
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_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
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_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2xfm.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2xfm 1
1 2xfm.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE ambi 2132 parsed_2xfm 1
1 2xfm.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 27 parsed_2xfm 1
1 2xfm.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 219 parsed_2xfm 1
1 2xfm.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2xfm 1
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_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_2xfm
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_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 4
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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_Torsion_angle_constraint.Atom_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Resonance_ID_4
_Torsion_angle_constraint.Angle_lower_bound_val
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_Torsion_angle_constraint.Entry_ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_constraint_list_ID
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65 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -49.00 -31.00 . . 5 . N . 5 . CA . 5 . C . 6 . N parsed_2xfm 1
66 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -71.50 -56.50 . . 5 . C . 6 . N . 6 . CA . 6 . C parsed_2xfm 1
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213 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130.50 169.50 . . 113 . N . 113 . CA . 113 . C . 114 . N parsed_2xfm 1
214 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -155.50 -80.50 . . 113 . C . 114 . N . 114 . CA . 114 . C parsed_2xfm 1
215 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133.00 181.00 . . 114 . N . 114 . CA . 114 . C . 115 . N parsed_2xfm 1
216 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -163.00 -55.00 . . 114 . C . 115 . N . 115 . CA . 115 . C parsed_2xfm 1
217 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51.50 234.50 . . 115 . N . 115 . CA . 115 . C . 116 . N parsed_2xfm 1
218 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -130.00 -70.00 . . 115 . C . 116 . N . 116 . CA . 116 . C parsed_2xfm 1
219 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -27.00 3.00 . . 116 . N . 116 . CA . 116 . C . 117 . N parsed_2xfm 1
stop_
loop_
_TA_constraint_comment_org.ID
_TA_constraint_comment_org.Comment_text
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_TA_constraint_comment_org.Comment_begin_column
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_TA_constraint_comment_org.Entry_ID
_TA_constraint_comment_org.Torsion_angle_constraint_list_ID
1
;
! chi_dih.inp: RNA chi restraints for anti/syn conformations
! anti (190.0 +/- 100.0) c3' endo /anti (190.0 +/- 60.0) c2' endo, syn (20.0 +/- 100.0)
;
1 1 2 89 parsed_2xfm 1
2 "A208 syn, c3' endo" 5 88 5 109 parsed_2xfm 1
3 "C210 anti, c2' endo" 8 88 8 109 parsed_2xfm 1
4 "G211 syn, c3' endo" 11 88 11 108 parsed_2xfm 1
5 "A212 syn, c3' endo" 14 88 14 108 parsed_2xfm 1
6
;
C213 anti, c2' endo
! sug_dih.inp: RNA sugar pucker restraints for N (C3' endo) or S (C2' endo) type conformations
! phi_12_N (99.0 +/- 20.0), phi_23_N (38.0 +/- 20.0), delta_N (82.0 +/- 30.0)
! phi_12_S (160.0 +/- 20.0), phi_23_S (-25.0 +/- 20.0), delta_S (140.0 +/- 50.0)
;
17 88 21 82 parsed_2xfm 1
7 "A208 N/C3' endo" 26 89 26 106 parsed_2xfm 1
8 "A208 N delta" 28 89 30 3 parsed_2xfm 1
9 "G211 N/C3' endo" 34 89 34 106 parsed_2xfm 1
10 "G211 N delta" 36 89 36 103 parsed_2xfm 1
11 "A212 N/C3' endo" 41 89 41 106 parsed_2xfm 1
12
;
A212 N delta
bb_dih.inp: RNA backbone dihedral ranges
!! alpha (0.0 +/- 120.0), beta (180.0 +/- 30.0), gamma (60.0 +/- 30.0)
!! epsilon (180.0 +/- 30.0), zeta (0.0 +/- 120.0)
;
43 89 49 53 parsed_2xfm 1
13 "[208] beta" 53 89 53 101 parsed_2xfm 1
14 "[208] gamma" 55 89 55 102 parsed_2xfm 1
15 "[208] epsilon" 57 89 57 104 parsed_2xfm 1
16 "[208] zeta" 59 89 59 101 parsed_2xfm 1
17 "A208 delta" 61 88 61 101 parsed_2xfm 1
18 "[209] alpha" 65 89 65 102 parsed_2xfm 1
19 "[209] beta" 67 89 67 101 parsed_2xfm 1
20 "[209] gamma" 69 89 69 102 parsed_2xfm 1
21 "[209] epsilon" 71 89 71 104 parsed_2xfm 1
22 "[209] zeta" 73 89 73 101 parsed_2xfm 1
23 "A209 delta" 75 88 75 101 parsed_2xfm 1
24 "[210] alpha" 79 89 79 102 parsed_2xfm 1
25 "[210] beta" 81 89 81 101 parsed_2xfm 1
26 "[210] gamma" 83 89 83 102 parsed_2xfm 1
27 "[210] epsilon" 85 89 85 104 parsed_2xfm 1
28 "[210] zeta" 87 89 87 101 parsed_2xfm 1
29 "A210 delta" 89 88 89 101 parsed_2xfm 1
30 "[211] alpha" 93 89 93 102 parsed_2xfm 1
31 "[211] beta" 95 89 95 101 parsed_2xfm 1
32 "[211] gamma" 97 89 97 102 parsed_2xfm 1
33 "[211] epsilon" 99 89 99 104 parsed_2xfm 1
34 "[211] zeta" 101 89 101 101 parsed_2xfm 1
35 "A211 delta" 103 88 103 101 parsed_2xfm 1
36 "[212] alpha" 107 89 107 102 parsed_2xfm 1
37 "[212] beta" 109 89 109 101 parsed_2xfm 1
38 "[212] gamma" 111 89 111 102 parsed_2xfm 1
39 "[212] epsilon" 113 89 113 104 parsed_2xfm 1
40 "[212] zeta" 115 89 115 101 parsed_2xfm 1
41 "A212 delta" 117 88 117 101 parsed_2xfm 1
42 "[213] alpha" 121 89 121 102 parsed_2xfm 1
43 "[213] beta" 123 89 123 101 parsed_2xfm 1
44 "[213] gamma" 125 89 125 102 parsed_2xfm 1
45 "[213] epsilon" 127 89 127 104 parsed_2xfm 1
46 "[213] zeta" 129 89 129 101 parsed_2xfm 1
47 "A213 delta" 131 88 131 101 parsed_2xfm 1
48 "[214] alpha" 135 89 135 102 parsed_2xfm 1
49 "[214] beta" 137 89 137 101 parsed_2xfm 1
50 "[214] gamma" 139 89 139 102 parsed_2xfm 1
51 "[214] epsilon" 141 89 141 104 parsed_2xfm 1
52 "[214] zeta" 143 89 143 101 parsed_2xfm 1
53 "A214 delta" 145 88 145 101 parsed_2xfm 1
54 "[215] alpha" 149 89 149 102 parsed_2xfm 1
55 "[215] beta" 151 89 151 101 parsed_2xfm 1
56 "[215] gamma" 153 89 153 102 parsed_2xfm 1
57
;
A215 delta
using 1.5 times the talos error!
3 E TALOS PHI = -109.00 +/- 35.00
;
155 88 161 48 parsed_2xfm 1
58 "3 E TALOS PSI = 136.00 +/- 29.00" 165 1 165 47 parsed_2xfm 1
59 "4 T TALOS PHI = -90.00 +/- 10.00" 169 1 169 47 parsed_2xfm 1
60 "4 T TALOS PSI = 167.00 +/- 6.00" 173 1 173 47 parsed_2xfm 1
61 "5 V TALOS PHI = -58.00 +/- 6.00" 177 1 177 47 parsed_2xfm 1
62 "5 V TALOS PSI = -40.00 +/- 6.00" 181 1 181 47 parsed_2xfm 1
63 "6 L TALOS PHI = -64.00 +/- 5.00" 185 1 185 47 parsed_2xfm 1
64 "6 L TALOS PSI = -39.00 +/- 8.00" 189 1 189 47 parsed_2xfm 1
65 "7 D TALOS PHI = -64.00 +/- 4.00" 193 1 193 47 parsed_2xfm 1
66 "7 D TALOS PSI = -40.00 +/- 4.00" 197 1 197 47 parsed_2xfm 1
67 "8 F TALOS PHI = -67.00 +/- 3.00" 201 1 201 47 parsed_2xfm 1
68 "8 F TALOS PSI = -42.00 +/- 5.00" 205 1 205 47 parsed_2xfm 1
69 "9 M TALOS PHI = -65.00 +/- 6.00" 209 1 209 47 parsed_2xfm 1
70 "9 M TALOS PSI = -39.00 +/- 5.00" 213 1 213 47 parsed_2xfm 1
71 "10 F TALOS PHI = -63.00 +/- 6.00" 217 1 217 47 parsed_2xfm 1
72 "10 F TALOS PSI = -43.00 +/- 5.00" 221 1 221 47 parsed_2xfm 1
73 "11 N TALOS PHI = -64.00 +/- 5.00" 225 1 225 47 parsed_2xfm 1
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76 "12 L TALOS PSI = -38.00 +/- 7.00" 237 1 237 47 parsed_2xfm 1
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78 "13 Y TALOS PSI = -39.00 +/- 7.00" 245 1 245 47 parsed_2xfm 1
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