NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
48327 |
2ihx   |
15113 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1900 |
data_2ihx_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_2ihx
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_2ihx 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_2ihx
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 2ihx "Master copy" parsed_2ihx
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_2ihx
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 2ihx.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . n/a 2 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . DYANA/DIANA 3 sequence "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . n/a 4 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . DYANA/DIANA 5 distance "general distance" simple 1135 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . n/a 6 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . DYANA/DIANA 7 distance NOE simple 521 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . n/a 8 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . DYANA/DIANA 9 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 244 parsed_2ihx 1
1 2ihx.mr . . "MR format" 10 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_2ihx 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2ihx
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER VIRUS/VIRAL PROTEIN/RNA 27-SEP-06 2IHX
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF THE ROUS SARCOMA VIRUS NUCLEOCAPSID
*TITLE 2 PROTEIN:UPSI RNA PACKAGING SIGNAL COMPLEX
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: NUCLEOCAPSID (NC) PROTEIN;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 FRAGMENT: NUCLEOCAPSID DOMAIN (RESIDUES 503-563);
*COMPND 5 ENGINEERED: YES;
*COMPND 6 MOL_ID: 2;
*COMPND 7 MOLECULE: UPSI RNA;
*COMPND 8 CHAIN: B;
*COMPND 9 FRAGMENT: MINIMAL RNA PACKAGING SIGNAL IN THE 5'-
*COMPND 10 UNTRANSLATED REGION (UTR) OF ROUS SARCOMA VIRUS (RSV);
*COMPND 11 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: ROUS SARCOMA VIRUS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: VIRUS;
*SOURCE 4 STRAIN: PRAGUE C (PR-C);
*SOURCE 5 GENE: GAG;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_COMMON: BACTERIA;
*SOURCE 8 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN: BL21 CODON PLUS (DE3)-RIL;
*SOURCE 9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE: PLASMID;
*SOURCE 10 EXPRESSION_SYSTEM_PLASMID: PGEX-6P-1;
*SOURCE 11 MOL_ID: 2;
*SOURCE 12 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 13 OTHER_DETAILS: RNA WAS PREPARED BY IN VITRO T7 RNA
*SOURCE 14 TRANSCRIPTION. THE SEQUENCE OCCURS NATURALLY IN ROUS
*SOURCE 15 SARCOMA VIRUS (RSV)
*KEYWDS PROTEIN-RNA COMPLEX
*EXPDTA NMR, 20 STRUCTURES
*AUTHOR J.ZHOU, M.SUMMERS
*REVDAT 1 16-JAN-07 2IHX 0
;
save_
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_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2ihx
_Org_constr_file_comment.ID 2
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 2
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
******************************************************************
CYANA SEQUENCE FILE
******************************************************************
;
save_
save_MR_file_comment_4
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_2ihx
_Org_constr_file_comment.ID 3
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 4
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
******************************************************************
CYANA UPPER LIMIT RESTRAINT FILE
******************************************************************
;
save_
save_DYANA/DIANA_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_2ihx
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type "general distance"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 5
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_2ihx 1
2 1 . . . parsed_2ihx 1
3 1 . . . parsed_2ihx 1
4 1 . . . parsed_2ihx 1
5 1 . . . parsed_2ihx 1
6 1 . . . parsed_2ihx 1
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15 1 . . . parsed_2ihx 1
16 1 . . . parsed_2ihx 1
17 1 . . . parsed_2ihx 1
18 1 . . . parsed_2ihx 1
19 1 . . . parsed_2ihx 1
20 1 . . . parsed_2ihx 1
21 1 . . . parsed_2ihx 1
22 1 . . . parsed_2ihx 1
23 1 . . . parsed_2ihx 1
24 1 . . . parsed_2ihx 1
25 1 . . . parsed_2ihx 1
26 1 . . . parsed_2ihx 1
27 1 . . . parsed_2ihx 1
28 1 . . . parsed_2ihx 1
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39 1 . . . parsed_2ihx 1
40 1 . . . parsed_2ihx 1
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42 1 . . . parsed_2ihx 1
43 1 . . . parsed_2ihx 1
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45 1 . . . parsed_2ihx 1
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49 1 . . . parsed_2ihx 1
50 1 . . . parsed_2ihx 1
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55 1 . . . parsed_2ihx 1
56 1 . . . parsed_2ihx 1
57 1 . . . parsed_2ihx 1
58 1 . . . parsed_2ihx 1
59 1 . . . parsed_2ihx 1
60 1 . . . parsed_2ihx 1
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67 1 . . . parsed_2ihx 1
68 1 . . . parsed_2ihx 1
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70 1 . . . parsed_2ihx 1
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87 1 . . . parsed_2ihx 1
88 1 . . . parsed_2ihx 1
89 1 . . . parsed_2ihx 1
90 1 . . . parsed_2ihx 1
91 1 . . . parsed_2ihx 1
92 1 . . . parsed_2ihx 1
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136 1 . . . parsed_2ihx 1
137 1 . . . parsed_2ihx 1
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151 1 . . . parsed_2ihx 1
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156 1 . . . parsed_2ihx 1
157 1 . . . parsed_2ihx 1
158 1 . . . parsed_2ihx 1
159 1 . . . parsed_2ihx 1
160 1 . . . parsed_2ihx 1
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171 1 . . . parsed_2ihx 1
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176 1 . . . parsed_2ihx 1
177 1 . . . parsed_2ihx 1
178 1 . . . parsed_2ihx 1
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254 1 . . . parsed_2ihx 1
255 1 . . . parsed_2ihx 1
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25 1 2 . . . . . . . . . 30 TYR O parsed_2ihx 1
26 1 1 . . . . . . . . . 33 GLN H parsed_2ihx 1
26 1 2 . . . . . . . . . 30 TYR O parsed_2ihx 1
27 1 1 . . . . . . . . . 34 CYSZ N parsed_2ihx 1
27 1 2 . . . . . . . . . 31 GLN O parsed_2ihx 1
28 1 1 . . . . . . . . . 34 CYSZ H parsed_2ihx 1
28 1 2 . . . . . . . . . 31 GLN O parsed_2ihx 1
29 1 1 . . . . . . . . . 36 LYS H parsed_2ihx 1
29 1 2 . . . . . . . . . 34 CYSZ SG parsed_2ihx 1
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30 1 2 . . . . . . . . . 34 CYSZ SG parsed_2ihx 1
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31 1 2 . . . . . . . . . 34 CYSZ O parsed_2ihx 1
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32 1 2 . . . . . . . . . 34 CYSZ O parsed_2ihx 1
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35 1 1 . . . . . . . . . 18 ARG HA parsed_2ihx 1
35 1 2 . . . . . . . . . 30 TYR QE parsed_2ihx 1
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38 1 2 . . . . . . . . . 30 TYR QE parsed_2ihx 1
39 1 1 . . . . . . . . . 19 GLY H parsed_2ihx 1
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83 1 2 . . . . . . . . . 29 HIS HE1 parsed_2ihx 1
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102 1 2 . . . . . . . . . 34 CYSZ H parsed_2ihx 1
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103 1 2 . . . . . . . . . 32 ALA H parsed_2ihx 1
104 1 1 . . . . . . . . . 32 ALA H parsed_2ihx 1
104 1 2 . . . . . . . . . 33 GLN H parsed_2ihx 1
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105 1 2 . . . . . . . . . 32 ALA H parsed_2ihx 1
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110 1 1 . . . . . . . . . 34 CYSZ H parsed_2ihx 1
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112 1 1 . . . . . . . . . 34 CYSZ HA parsed_2ihx 1
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116 1 1 . . . . . . . . . 36 LYS H parsed_2ihx 1
116 1 2 . . . . . . . . . 37 LYS H parsed_2ihx 1
117 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ ZN parsed_2ihx 1
117 1 2 . . . . . . . . . 47 CYS- CB parsed_2ihx 1
118 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ ZN parsed_2ihx 1
118 1 2 . . . . . . . . . 50 CYS- CB parsed_2ihx 1
119 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ ZN parsed_2ihx 1
119 1 2 . . . . . . . . . 47 CYS- SG parsed_2ihx 1
120 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ ZN parsed_2ihx 1
120 1 2 . . . . . . . . . 50 CYS- SG parsed_2ihx 1
121 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ ZN parsed_2ihx 1
121 1 2 . . . . . . . . . 60 CYSZ SG parsed_2ihx 1
122 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ ZN parsed_2ihx 1
122 1 2 . . . . . . . . . 55 HIS NE2 parsed_2ihx 1
123 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ SG parsed_2ihx 1
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128 1 2 . . . . . . . . . 55 HIS NE2 parsed_2ihx 1
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130 1 2 . . . . . . . . . 45 GLU O parsed_2ihx 1
131 1 1 . . . . . . . . . 47 CYS- N parsed_2ihx 1
131 1 2 . . . . . . . . . 52 GLY O parsed_2ihx 1
132 1 1 . . . . . . . . . 47 CYS- H parsed_2ihx 1
132 1 2 . . . . . . . . . 52 GLY O parsed_2ihx 1
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135 1 1 . . . . . . . . . 52 GLY H parsed_2ihx 1
135 1 2 . . . . . . . . . 50 CYS- SG parsed_2ihx 1
136 1 1 . . . . . . . . . 52 GLY N parsed_2ihx 1
136 1 2 . . . . . . . . . 50 CYS- SG parsed_2ihx 1
137 1 1 . . . . . . . . . 50 CYS- H parsed_2ihx 1
137 1 2 . . . . . . . . . 47 CYS- SG parsed_2ihx 1
138 1 1 . . . . . . . . . 50 CYS- N parsed_2ihx 1
138 1 2 . . . . . . . . . 47 CYS- SG parsed_2ihx 1
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140 1 1 . . . . . . . . . 59 GLN H parsed_2ihx 1
140 1 2 . . . . . . . . . 56 ASN O parsed_2ihx 1
141 1 1 . . . . . . . . . 60 CYSZ N parsed_2ihx 1
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143 1 2 . . . . . . . . . 60 CYSZ SG parsed_2ihx 1
144 1 1 . . . . . . . . . 62 LYS N parsed_2ihx 1
144 1 2 . . . . . . . . . 60 CYSZ SG parsed_2ihx 1
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145 1 2 . . . . . . . . . 60 CYSZ O parsed_2ihx 1
146 1 1 . . . . . . . . . 63 ARG N parsed_2ihx 1
146 1 2 . . . . . . . . . 60 CYSZ O parsed_2ihx 1
147 1 1 . . . . . . . . . 64 ASP H parsed_2ihx 1
147 1 2 . . . . . . . . . 61 ARG O parsed_2ihx 1
148 1 1 . . . . . . . . . 64 ASP N parsed_2ihx 1
148 1 2 . . . . . . . . . 61 ARG O parsed_2ihx 1
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149 1 2 . . . . . . . . . 61 ARG O parsed_2ihx 1
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151 1 2 . . . . . . . . . 47 CYS- H parsed_2ihx 1
152 1 1 . . . . . . . . . 46 ARG HA parsed_2ihx 1
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stop_
loop_
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129 linker-1 734 1 734 9 parsed_2ihx 1
130 SL-A 739 1 739 5 parsed_2ihx 1
131 "---------------End C4'-O4' bond for linker-1 and SL-A--------------" 766 1 766 68 parsed_2ihx 1
132 "------------------Begin SL-A H-bonds-------------------------------" 768 1 768 68 parsed_2ihx 1
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138 G177-C191 807 1 807 10 parsed_2ihx 1
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140 U179-A189 823 1 823 10 parsed_2ihx 1
141 U180-G188 829 1 829 10 parsed_2ihx 1
142 A181-G187 835 1 835 10 parsed_2ihx 1
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144 "-----Begin liker-1 and SL-A intraresidue and interresidue NOEs-----" 842 1 842 68 parsed_2ihx 1
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170 A189 998 1 998 6 parsed_2ihx 1
171 G190 1010 1 1010 5 parsed_2ihx 1
172 C191 1021 1 1021 5 parsed_2ihx 1
173 G192 1031 1 1031 5 parsed_2ihx 1
174 G193 1041 1 1041 5 parsed_2ihx 1
175 A194 1051 1 1051 6 parsed_2ihx 1
176 C195 1064 1 1064 5 parsed_2ihx 1
177 G196 1074 1 1074 5 parsed_2ihx 1
178 "-------End linker-1 and SL-A intraresidue and interresidue NOEs---" 1080 1 1080 67 parsed_2ihx 1
179 "--------------Begin SL-A phosphate limit of approach--------------" 1082 1 1082 67 parsed_2ihx 1
180 "----------------End SL-A phosphate limit of approach--------------" 1106 1 1106 67 parsed_2ihx 1
181 "##################################################################" 1108 1 1108 68 parsed_2ihx 1
182 "## End linker-1 and SL-A" 1109 1 1109 27 parsed_2ihx 1
183 "##################################################################" 1110 1 1110 68 parsed_2ihx 1
184 "##################################################################" 1112 1 1112 68 parsed_2ihx 1
185 "## Begin intermolecular interactions" 1113 1 1113 38 parsed_2ihx 1
186 "##################################################################" 1114 1 1114 68 parsed_2ihx 1
187 ------------------------------------------------------------------- 1116 1 1116 68 parsed_2ihx 1
188 "Intermolecular Hydrogen Bonds (H-bonds)" 1117 1 1117 41 parsed_2ihx 1
189 ------------------------------------------------------------------- 1118 1 1118 68 parsed_2ihx 1
190 "197 RADE OP1 61 ARG NE 3.00 1.00E+00" 1125 1 1125 48 parsed_2ihx 1
191 "196 RGUA OP2 62 LYS HZ1 2.00 1.00E+00 #potential" 1126 1 1126 59 parsed_2ihx 1
192 "168 RADE OP1 58 LYS HZ1 2.00 1.00E+00" 1128 1 1128 48 parsed_2ihx 1
193 "168 RADE OP1 58 LYS NZ 3.00 1.00E+00" 1129 1 1129 48 parsed_2ihx 1
194 "#170 RCYT N3 63 ARG HH22 2.00 1.00E+00" 1131 1 1131 50 parsed_2ihx 1
195 "#170 RCYT N3 63 ARG NH2 3.00 1.00E+00" 1132 1 1132 50 parsed_2ihx 1
196 "#170 RCYT O2 63 ARG HE 2.00 1.00E+00" 1133 1 1133 50 parsed_2ihx 1
197 "#170 RCYT O2 63 ARG NE 3.00 1.00E+00" 1134 1 1134 50 parsed_2ihx 1
198 ----------------------------------------------------------- 1136 1 1136 60 parsed_2ihx 1
199 "Intermolecular NOEs" 1137 1 1137 21 parsed_2ihx 1
200 ----------------------------------------------------------- 1138 1 1138 60 parsed_2ihx 1
201 "RADE 168" 1140 1 1140 11 parsed_2ihx 1
202 Strong 1141 50 1141 56 parsed_2ihx 1
203 "Much weaker than H2" 1142 50 1142 69 parsed_2ihx 1
204 "168 RADE H2 55 HIS HD2 5.00 1.00E+00 #sd" 1144 1 1144 52 parsed_2ihx 1
205 STRONG 1146 50 1146 56 parsed_2ihx 1
206 "168 RADE H2 58 LYS QB 5.80 1.00E+00 #SD" 1147 1 1147 53 parsed_2ihx 1
207 SD 1148 50 1148 53 parsed_2ihx 1
208 "168 RADE H2 58 LYS QD 5.80 1.00E+00 #weaker than QE" 1149 1 1149 65 parsed_2ihx 1
209 "168 RADE H2 58 LYS QE 5.80 1.00E+00" 1150 1 1150 49 parsed_2ihx 1
210 "v. weak" 1151 50 1151 57 parsed_2ihx 1
211 "URA 169" 1157 1 1157 10 parsed_2ihx 1
212 "RCYT 170" 1159 1 1159 11 parsed_2ihx 1
213 "RGUA 196" 1161 1 1161 9 parsed_2ihx 1
214 "196 RGUA H1' 61 ARG QD 5.80 1.00E+00" 1162 1 1162 48 parsed_2ihx 1
215 "RADE 197" 1164 1 1164 9 parsed_2ihx 1
216 "197 RADE H1' 52 GLY QA 5.80 1.00E+00" 1166 1 1166 48 parsed_2ihx 1
217 "weaker than H1'" 1167 50 1167 65 parsed_2ihx 1
218 "197 RADE H8 55 HIS HD2 5.00 1.00E+00 #SD via HE1" 1168 1 1168 60 parsed_2ihx 1
219 "197 RADE H8 61 ARG HA 5.00 1.00E+00 #SD via side chain" 1171 1 1171 67 parsed_2ihx 1
220 "197 RADE H8 62 LYS QB 5.80 1.00E+00" 1176 1 1176 48 parsed_2ihx 1
221 "197 RADE H8 62 LYS QG 5.80 1.00E+00" 1177 1 1177 48 parsed_2ihx 1
222 "197 RADE H8 62 LYS HA 5.80 1.00E+00 #SD via QB" 1178 1 1178 59 parsed_2ihx 1
223 "##################################################################" 1180 1 1180 68 parsed_2ihx 1
224 "### End intermolecular interactions" 1181 1 1181 37 parsed_2ihx 1
225 "##################################################################" 1182 1 1182 68 parsed_2ihx 1
226 "##################################################################" 1185 1 1185 68 parsed_2ihx 1
227 "### Begin linker-2 and SL-B" 1186 1 1186 29 parsed_2ihx 1
228 "##################################################################" 1187 1 1187 68 parsed_2ihx 1
229 "---------------Begin C4'-O4'bond for linker-2 and SL-B-------------" 1189 1 1189 68 parsed_2ihx 1
230 "# C4' to O4'" 1190 1 1190 15 parsed_2ihx 1
231 linker-2 1191 1 1191 9 parsed_2ihx 1
232 SL-B 1197 1 1197 5 parsed_2ihx 1
233 "# C5' to O4'" 1212 1 1212 14 parsed_2ihx 1
234 linker-2 1213 1 1213 9 parsed_2ihx 1
235 SL-B 1219 1 1219 5 parsed_2ihx 1
236 "# C5'to C3'" 1234 1 1234 14 parsed_2ihx 1
237 linker-2 1235 1 1235 9 parsed_2ihx 1
238 SL-B 1241 1 1241 5 parsed_2ihx 1
239 "---------------END C4'-O4'bond for SL-B----------------------------" 1255 1 1255 68 parsed_2ihx 1
240 "---------------Begin H-bonds for SL-B------------------------------" 1257 1 1257 68 parsed_2ihx 1
241 C201-G213 1258 1 1258 10 parsed_2ihx 1
242 C202-G212 1266 1 1266 10 parsed_2ihx 1
243 C203-G211 1274 1 1274 10 parsed_2ihx 1
244 U204-A210 1282 1 1282 10 parsed_2ihx 1
245 A205-G209 1288 1 1288 22 parsed_2ihx 1
246 "-------------------End H-bonds for SL-B----------------------------" 1293 1 1293 68 parsed_2ihx 1
247 "---Begin intraresidue and interresidue NOEs for linker-2 and SL-B--" 1295 1 1295 68 parsed_2ihx 1
248 linker-2 1296 1 1296 9 parsed_2ihx 1
249 "RADE 197" 1297 1 1297 10 parsed_2ihx 1
250 Reversed 1298 66 1298 74 parsed_2ihx 1
251 Reversed 1299 66 1299 74 parsed_2ihx 1
252 U198 1301 1 1301 5 parsed_2ihx 1
253 Reversed 1302 66 1302 74 parsed_2ihx 1
254 Reversed 1303 66 1303 74 parsed_2ihx 1
255 "Unusually downfield shifted H5" 1305 66 1305 96 parsed_2ihx 1
256 Medium 1307 66 1307 73 parsed_2ihx 1
257 "198 URA H6 200 RADE H1' 5.00 1.00E+00 #v. wk.; SD via H2'" 1311 1 1311 84 parsed_2ihx 1
258 "198 URA H5 200 RADE H1' 5.00 1.00E+00 #v. wk.; SD via H2'" 1312 1 1312 84 parsed_2ihx 1
259 wk 1313 66 1313 68 parsed_2ihx 1
260 "198 URA H6 200 RADE H2 6.00 1.00E+00 #wk" 1314 1 1314 68 parsed_2ihx 1
261 "Unusually upfield shifted H2'" 1316 66 1316 95 parsed_2ihx 1
262 "198 URA H2' 200 RADE H1' 5.00 1.00E+00 #SD via H2'" 1319 1 1319 76 parsed_2ihx 1
263 "198 URA H1' 200 RADE H8 5.00 1.00E+00 #SD via H2'" 1320 1 1320 76 parsed_2ihx 1
264 "198 URA H1' 200 RADE H2 5.00 1.00E+00 #SD via H2'" 1321 1 1321 76 parsed_2ihx 1
265 G199 1323 1 1323 5 parsed_2ihx 1
266 unusual 1330 66 1330 73 parsed_2ihx 1
267 "199 RGUA H8 200 RADE H8 5.00 1.00E+00 #SD via H3'" 1331 1 1331 76 parsed_2ihx 1
268 A200 1333 1 1333 6 parsed_2ihx 1
269 unusual 1339 66 1339 73 parsed_2ihx 1
270 "LONG RANGE, STRONG" 1341 66 1341 84 parsed_2ihx 1
271 SL-B 1343 1 1343 5 parsed_2ihx 1
272 C201 1344 1 1344 5 parsed_2ihx 1
273 C202 1352 1 1352 5 parsed_2ihx 1
274 C203 1363 1 1363 5 parsed_2ihx 1
275 U204 1374 1 1374 5 parsed_2ihx 1
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280 G209 1417 1 1417 5 parsed_2ihx 1
281 A210 1427 1 1427 6 parsed_2ihx 1
282 G211 1439 1 1439 5 parsed_2ihx 1
283 G212 1449 1 1449 5 parsed_2ihx 1
284 G213 1459 1 1459 5 parsed_2ihx 1
285 "----End intraresidue and interresidue NOEs for linker-2 and SL-B--" 1467 1 1467 67 parsed_2ihx 1
286 "#################################################################" 1469 1 1469 67 parsed_2ihx 1
287 "## End linker-2 and SL-B" 1470 1 1470 26 parsed_2ihx 1
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289 "#################################################################" 1474 1 1474 67 parsed_2ihx 1
290 "## Begin SL-C and linker-3" 1475 1 1475 28 parsed_2ihx 1
291 "#################################################################" 1476 1 1476 67 parsed_2ihx 1
292 "---------------Begin C4'-O4' bond for SL-C------------------------" 1479 1 1479 67 parsed_2ihx 1
293 "C4'-O4' bond is not in the DYANA residue library -this is a cov. bond" 1480 1 1480 71 parsed_2ihx 1
294 SL-C 1481 1 1481 5 parsed_2ihx 1
295 linker-3 1492 1 1492 9 parsed_2ihx 1
296 "# C5' to O4'" 1497 1 1497 14 parsed_2ihx 1
297 SL-C 1498 1 1498 5 parsed_2ihx 1
298 linker-3 1509 1 1509 9 parsed_2ihx 1
299 "# C5' to C3'" 1514 1 1514 14 parsed_2ihx 1
300 SL-C 1515 1 1515 5 parsed_2ihx 1
301 linker-3 1526 1 1526 9 parsed_2ihx 1
302 "---------------End C4'-O4' bond for SL-C and linker-3--------------" 1530 1 1530 68 parsed_2ihx 1
303 "-------------Begin H-bonds for SL-C--------------------------------" 1532 1 1532 68 parsed_2ihx 1
304 G214-U223 1533 1 1533 10 parsed_2ihx 1
305 G215-C222 1539 1 1539 10 parsed_2ihx 1
306 C216-G221 1547 1 1547 10 parsed_2ihx 1
307 "U217-G220 #Reverse G*U Wobble" 1555 1 1555 68 parsed_2ihx 1
308 "Ribose H-bond" 1562 42 1562 55 parsed_2ihx 1
309 "Other H-bonds" 1565 1 1565 15 parsed_2ihx 1
310 "# Potential Bend H-bonds" 1569 1 1569 26 parsed_2ihx 1
311 "--------------End H-bonds for SL-C------------------------------------" 1572 1 1572 71 parsed_2ihx 1
312 "------Begin intraresidue and interresidue NOEs for SL-C and linker-3--" 1574 1 1574 71 parsed_2ihx 1
313 G214 1575 2 1575 6 parsed_2ihx 1
314 G215 1585 1 1585 5 parsed_2ihx 1
315 C216 1596 1 1596 5 parsed_2ihx 1
316 "-----------------------Begin SL-C UGCG tetraloop------------------" 1609 1 1609 67 parsed_2ihx 1
317 U217 1610 1 1610 5 parsed_2ihx 1
318 "{NOTE: U217 H2' exhibits upfield shift @ 4.005 ppm}" 1611 1 1611 52 parsed_2ihx 1
319 G218 1621 1 1621 5 parsed_2ihx 1
320 "stronger than H2'" 1627 66 1627 83 parsed_2ihx 1
321 "stronger than H2'" 1628 66 1628 83 parsed_2ihx 1
322 C219 1631 1 1631 5 parsed_2ihx 1
323 "Ribose pucker" 1633 52 1633 65 parsed_2ihx 1
324 "219 RCYT H4' 220 RGUA H8 5.00 1.00E+00 #SD via H1'" 1636 1 1636 62 parsed_2ihx 1
325 G220 1638 1 1638 6 parsed_2ihx 1
326 "This residue is in the SYN conformation, H3' exhibits large downfield shift @5,761 ppm" 1639 1 1639 88 parsed_2ihx 1
327 "VERY INTENSE" 1640 68 1640 81 parsed_2ihx 1
328 "-----------------------End SL-C UGCG tetraloop--------------------" 1646 1 1646 67 parsed_2ihx 1
329 G221 1648 1 1648 5 parsed_2ihx 1
330 C222 1659 1 1659 5 parsed_2ihx 1
331 U223 1669 1 1669 5 parsed_2ihx 1
332 Kink 1676 67 1676 71 parsed_2ihx 1
333 Kink 1677 67 1677 71 parsed_2ihx 1
334 linker-3 1679 1 1679 9 parsed_2ihx 1
335 U224 1680 2 1680 6 parsed_2ihx 1
336 A225 1691 1 1691 5 parsed_2ihx 1
337 "weaker than usual" 1698 66 1698 83 parsed_2ihx 1
338 "Long range" 1703 66 1703 77 parsed_2ihx 1
339 G226 1705 1 1705 5 parsed_2ihx 1
340 "G226-H8 OVERLAPS with G227-H8. It is therefore impossible to" 1712 1 1712 63 parsed_2ihx 1
341 "distinguish intermolecular from intramolecular NOEs." 1713 1 1713 54 parsed_2ihx 1
342 "----End intraresidue and interresidue NOEs for SL-C and linker-3---" 1714 1 1714 68 parsed_2ihx 1
343 "##################################################################" 1716 1 1716 68 parsed_2ihx 1
344 "## End SL-C and linker-3" 1717 1 1717 26 parsed_2ihx 1
345 "##################################################################" 1718 1 1718 68 parsed_2ihx 1
346 "##################################################################" 1721 1 1721 68 parsed_2ihx 1
347 "### Begin intermolecular interactions" 1722 1 1722 39 parsed_2ihx 1
348 "##################################################################" 1723 1 1723 68 parsed_2ihx 1
349 ------------------------------------------------------------------- 1725 1 1725 68 parsed_2ihx 1
350 "Intermolecular Hydrogen Bonds (H-bonds)" 1726 1 1726 41 parsed_2ihx 1
351 ------------------------------------------------------------------- 1727 1 1727 68 parsed_2ihx 1
352 "GUA 218" 1728 1 1728 10 parsed_2ihx 1
353 ------------------------------------------------------------------- 1739 1 1739 68 parsed_2ihx 1
354 "Potential Salt Bridges" 1740 1 1740 24 parsed_2ihx 1
355 ------------------------------------------------------------------- 1741 1 1741 68 parsed_2ihx 1
356 ------------------------------------------------------------------ 1744 1 1744 68 parsed_2ihx 1
357 "Intermolecular NOEs" 1745 1 1745 23 parsed_2ihx 1
358 ------------------------------------------------------------------ 1746 1 1746 68 parsed_2ihx 1
359 "RCTY 216" 1747 1 1747 9 parsed_2ihx 1
360 "similar intensity to H1', but broader" 1749 50 1749 87 parsed_2ihx 1
361 "URA 217" 1751 1 1751 9 parsed_2ihx 1
362 "RGUA 218" 1754 1 1754 10 parsed_2ihx 1
363 "RGUA 220" 1763 1 1763 9 parsed_2ihx 1
364 "stronter than 35TRY QE,22HA" 1766 50 1766 77 parsed_2ihx 1
365 "RADE 225" 1770 1 1770 9 parsed_2ihx 1
366 "RGUA 226" 1773 1 1773 9 parsed_2ihx 1
367 "##################################################################" 1777 1 1777 68 parsed_2ihx 1
368 "## End intermolecular interactions" 1778 1 1778 36 parsed_2ihx 1
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521 1 2 . . . . . . . . . 224 URA P parsed_2ihx 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
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33 "##################################################################" 122 1 122 68 parsed_2ihx 2
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37 "# C5' to C3'" 161 1 161 14 parsed_2ihx 2
38 "--------------------End C4'-O4' bond for O3------------------------" 178 1 178 68 parsed_2ihx 2
39 "--------------------Begin H-bonds for O3---------------------------" 180 1 180 68 parsed_2ihx 2
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47 C167-G227 233 1 233 10 parsed_2ihx 2
48 "----------------------End H-bonds for O3----------------------------" 240 1 240 69 parsed_2ihx 2
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51 "##################################################################" 258 1 258 68 parsed_2ihx 2
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56 "##################################################################" 265 1 265 68 parsed_2ihx 2
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107 linker-2 547 1 547 9 parsed_2ihx 2
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109 "---------------End C4'-O4' bond for linker-2 and SL-B-------------" 567 1 567 67 parsed_2ihx 2
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112 C202-G212 578 1 578 10 parsed_2ihx 2
113 C203-G211 586 1 586 10 parsed_2ihx 2
114 U204-A210 594 1 594 10 parsed_2ihx 2
115 A205-G209 600 1 600 37 parsed_2ihx 2
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117 "##################################################################" 607 1 607 68 parsed_2ihx 2
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119 "##################################################################" 609 1 609 68 parsed_2ihx 2
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122 "##################################################################" 614 1 614 68 parsed_2ihx 2
123 "---------------Begin C4'-O4' bond for SL-C and linker-3------------" 616 1 616 68 parsed_2ihx 2
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125 SL-C 618 1 618 5 parsed_2ihx 2
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127 "# C5' to O4'" 635 1 635 14 parsed_2ihx 2
128 SL-C 636 1 636 5 parsed_2ihx 2
129 linker-3 648 1 648 9 parsed_2ihx 2
130 "# C5' to C3'" 653 1 653 14 parsed_2ihx 2
131 SL-C 654 1 654 5 parsed_2ihx 2
132 linker-3 666 1 666 9 parsed_2ihx 2
133 "---------------End C4'-O4' bond for SL-C and linker-3---------------" 670 1 670 69 parsed_2ihx 2
134 "-------------Begin H-bonds for SL-C---------------------------------" 672 1 672 69 parsed_2ihx 2
135 G214-U223 673 1 673 10 parsed_2ihx 2
136 G215-C222 679 1 679 10 parsed_2ihx 2
137 C216-G221 687 1 687 10 parsed_2ihx 2
138 "U217-G220 #Reverse G*U Wobble" 695 1 695 68 parsed_2ihx 2
139 "Ribose H-bond" 702 50 702 63 parsed_2ihx 2
140 "Other H-bonds" 705 1 705 15 parsed_2ihx 2
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142 "--------------END H-bonds for SL-C-------------------------------" 712 1 712 66 parsed_2ihx 2
143 "##################################################################" 715 1 715 68 parsed_2ihx 2
144 "## End SL-C and linker-3" 716 1 716 26 parsed_2ihx 2
145 "##################################################################" 717 1 717 68 parsed_2ihx 2
146 "################################################################" 719 1 719 66 parsed_2ihx 2
147 "## Begin Intermolecular NC-F1+ RNA H-bond Restraints" 720 1 720 54 parsed_2ihx 2
148 "################################################################" 721 1 721 66 parsed_2ihx 2
149 "GUA 218" 723 1 723 9 parsed_2ihx 2
150 "################################################################" 734 1 734 66 parsed_2ihx 2
151 "#### End Intermolecular NC-F1+ RNA H-bond Restraints" 735 1 735 55 parsed_2ihx 2
152 "################################################################" 736 1 736 66 parsed_2ihx 2
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243 GAMMA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.0 104.0 . . 226 RGUA . . . . . . . . . . . . . parsed_2ihx 1
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stop_
loop_
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1 ---------------------------------------------------------------- 2 1 2 65 parsed_2ihx 1
2 "Angle Constraints for RNA Phosphodiester Linkages" 3 1 3 51 parsed_2ihx 1
3 "Note: alpha, beta, gamma, zeta define torsion angles" 4 1 4 55 parsed_2ihx 1
4 "associated with the 5' phosphodiester linkage" 5 1 5 54 parsed_2ihx 1
5 "and epsi is associated with the 3'linkage." 6 1 6 51 parsed_2ihx 1
6 ---------------------------------------------------------------- 7 1 7 65 parsed_2ihx 1
7 "------------------Begin O3--------------------------------------" 9 1 9 65 parsed_2ihx 1
8 "RCYT 160" 10 1 10 9 parsed_2ihx 1
9 "160 RCYT ZETA -121.0 -1.0 1.00E+00" 15 1 15 43 parsed_2ihx 1
10 "URA 161" 17 1 17 8 parsed_2ihx 1
11 "RGUA 162" 24 1 24 10 parsed_2ihx 1
12 "RCYT 163" 31 1 31 9 parsed_2ihx 1
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14 "RCYT 165" 45 1 45 9 parsed_2ihx 1
15 "URA 166" 52 1 52 8 parsed_2ihx 1
16 "RCYT 167" 59 1 59 9 parsed_2ihx 1
17 "167 RCYT EPSI -203.0 -103.0 1.00E+00" 63 1 63 44 parsed_2ihx 1
18 "RGUA 227" 66 1 66 10 parsed_2ihx 1
19 "227 RGUA ZETA -121.0 -1.0 1.00E+00" 67 1 67 42 parsed_2ihx 1
20 "227 RGUA ALPHA -118.0 -18.0 1.00E+00" 68 1 68 42 parsed_2ihx 1
21 "227 RGUA BETA 118.0 218.0 1.00E+00" 69 1 69 42 parsed_2ihx 1
22 "227 RGUA GAMMA 4.0 104.0 1.00E+00" 70 1 70 41 parsed_2ihx 1
23 "RADE 228" 73 1 73 9 parsed_2ihx 1
24 "RGUA 229" 80 1 80 10 parsed_2ihx 1
25 "RGUA 230" 87 1 87 10 parsed_2ihx 1
26 "RGUA 231" 94 1 94 10 parsed_2ihx 1
27 "RCYT 232" 101 1 101 9 parsed_2ihx 1
28 "RADE 233" 108 1 108 9 parsed_2ihx 1
29 "RGUA 234" 115 1 115 12 parsed_2ihx 1
30 "234 RGUA EPSI -203.0 -103.0 1.00E+00" 120 1 120 43 parsed_2ihx 1
31 "----------------End O3-------------------------------------------" 121 1 121 66 parsed_2ihx 1
32 "----------------Begin linker-1 and SL-A--------------------------" 123 1 123 66 parsed_2ihx 1
33 "RADE 168" 124 1 124 9 parsed_2ihx 1
34 "URA 169" 126 1 126 9 parsed_2ihx 1
35 "RCYT 170" 128 1 128 9 parsed_2ihx 1
36 "RCYT 171" 130 1 130 9 parsed_2ihx 1
37 "171 RCYT ALPHA -118.0 -18.0 1.00E+00" 131 1 131 44 parsed_2ihx 1
38 "171 RCYT BETA 118.0 218.0 1.00E+00" 132 1 132 43 parsed_2ihx 1
39 "171 RCYT GAMMA 4.0 104.0 1.00E+00" 133 1 133 43 parsed_2ihx 1
40 "171 RCYT ZETA -121.0 -1.0 1.00E+00" 135 1 135 43 parsed_2ihx 1
41 "RGUA 172" 137 1 137 10 parsed_2ihx 1
42 "URA 173" 144 1 144 8 parsed_2ihx 1
43 "RCYT 174" 151 1 151 9 parsed_2ihx 1
44 "174 RCYT EPSI -203.0 -103.0 1.00E+00" 156 1 156 44 parsed_2ihx 1
45 "URA 175 Bulge" 158 1 158 50 parsed_2ihx 1
46 "175 URA ALPHA -118.0 -18.0 1.00E+00" 159 1 159 43 parsed_2ihx 1
47 "175 URA BETA 118.0 218.0 1.00E+00" 160 1 160 42 parsed_2ihx 1
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50 "175 URA ZETA -121.0 -1.0 1.00E+00" 163 1 163 42 parsed_2ihx 1
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52 "176 RCYT ZETA -121.0 -1.0 1.00E+00" 166 1 166 43 parsed_2ihx 1
53 "176 RCYT ALPHA -118.0 -18.0 1.00E+00" 167 1 167 45 parsed_2ihx 1
54 "176 RCYT BETA 118.0 218.0 1.00E+00" 168 1 168 43 parsed_2ihx 1
55 "176 RCYT GAMMA 4.0 104.0 1.00E+00" 169 1 169 43 parsed_2ihx 1
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57 "RCYT 178" 179 1 179 9 parsed_2ihx 1
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