NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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|
29124 |
1ajt   |
cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 378 |
data_1ajt_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1ajt
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1ajt 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1ajt
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1ajt "Master copy" parsed_1ajt
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1ajt
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1ajt.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1ajt 1
1 1ajt.mr . . XPLOR/CNS 2 distance "hydrogen bond" simple 25 parsed_1ajt 1
1 1ajt.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 193 parsed_1ajt 1
1 1ajt.mr . . n/a 4 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1ajt 1
1 1ajt.mr . . XPLOR/CNS 5 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 160 parsed_1ajt 1
1 1ajt.mr . . n/a 6 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1ajt 1
1 1ajt.mr . . "MR format" 7 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1ajt 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1ajt
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RIBONUCLEIC ACID 08-MAY-97 1AJT
*TITLE FIVE-NUCLEOTIDE BULGE LOOP FROM TETRAHYMENA THERMOPHILA
*TITLE 2 GROUP I INTRON, NMR, 1 STRUCTURE
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: FIVE-NUCLEOTIDE RNA BULGE;
*COMPND 3 CHAIN: A, B;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: IN VITRO TRANSCRIPT FROM OLIGONUCLEOTIDE
*SOURCE 3 TEMPLATE USING T7 RNA POLYMERASE
*KEYWDS RNA BULGE LOOP, GROUP I INTRON, RIBONUCLEIC ACID
*EXPDTA NMR, 1 STRUCTURE
*AUTHOR K.J.LUEBKE,S.M.LANDRY,I.TINOCO JUNIOR
*REVDAT 1 20-AUG-97 1AJT 0
{Distance Constraints}
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1ajt
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1ajt 1
2 1 . . . parsed_1ajt 1
3 1 . . . parsed_1ajt 1
4 1 . . . parsed_1ajt 1
5 1 . . . parsed_1ajt 1
6 1 . . . parsed_1ajt 1
7 1 . . . parsed_1ajt 1
8 1 . . . parsed_1ajt 1
9 1 . . . parsed_1ajt 1
10 1 . . . parsed_1ajt 1
11 1 . . . parsed_1ajt 1
12 1 . . . parsed_1ajt 1
13 1 . . . parsed_1ajt 1
14 1 . . . parsed_1ajt 1
15 1 . . . parsed_1ajt 1
16 1 . . . parsed_1ajt 1
17 1 . . . parsed_1ajt 1
18 1 . . . parsed_1ajt 1
19 1 . . . parsed_1ajt 1
20 1 . . . parsed_1ajt 1
21 1 . . . parsed_1ajt 1
22 1 . . . parsed_1ajt 1
23 1 . . . parsed_1ajt 1
24 1 . . . parsed_1ajt 1
25 1 . . . parsed_1ajt 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 2 . h1 parsed_1ajt 1
1 1 2 . . . . . . . . . 24 . n3 parsed_1ajt 1
2 1 1 . . . . . . . . . 2 . h21 parsed_1ajt 1
2 1 2 . . . . . . . . . 24 . o2 parsed_1ajt 1
3 1 1 . . . . . . . . . 2 . o6 parsed_1ajt 1
3 1 2 . . . . . . . . . 24 . h41 parsed_1ajt 1
4 1 1 . . . . . . . . . 2 . h21 parsed_1ajt 1
4 1 2 . . . . . . . . . 24 . n3 parsed_1ajt 1
5 1 1 . . . . . . . . . 3 . h1 parsed_1ajt 1
5 1 2 . . . . . . . . . 23 . n3 parsed_1ajt 1
6 1 1 . . . . . . . . . 3 . h21 parsed_1ajt 1
6 1 2 . . . . . . . . . 23 . o2 parsed_1ajt 1
7 1 1 . . . . . . . . . 3 . o6 parsed_1ajt 1
7 1 2 . . . . . . . . . 23 . h41 parsed_1ajt 1
8 1 1 . . . . . . . . . 3 . h21 parsed_1ajt 1
8 1 2 . . . . . . . . . 23 . n3 parsed_1ajt 1
9 1 1 . . . . . . . . . 11 . n3 parsed_1ajt 1
9 1 2 . . . . . . . . . 20 . h1 parsed_1ajt 1
10 1 1 . . . . . . . . . 11 . o2 parsed_1ajt 1
10 1 2 . . . . . . . . . 20 . h21 parsed_1ajt 1
11 1 1 . . . . . . . . . 11 . h41 parsed_1ajt 1
11 1 2 . . . . . . . . . 20 . o6 parsed_1ajt 1
12 1 1 . . . . . . . . . 11 . n3 parsed_1ajt 1
12 1 2 . . . . . . . . . 20 . h21 parsed_1ajt 1
13 1 1 . . . . . . . . . 13 . n3 parsed_1ajt 1
13 1 2 . . . . . . . . . 18 . h1 parsed_1ajt 1
14 1 1 . . . . . . . . . 13 . o2 parsed_1ajt 1
14 1 2 . . . . . . . . . 18 . h21 parsed_1ajt 1
15 1 1 . . . . . . . . . 13 . h41 parsed_1ajt 1
15 1 2 . . . . . . . . . 18 . o6 parsed_1ajt 1
16 1 1 . . . . . . . . . 13 . n3 parsed_1ajt 1
16 1 2 . . . . . . . . . 18 . h21 parsed_1ajt 1
17 1 1 . . . . . . . . . 12 . h3 parsed_1ajt 1
17 1 2 . . . . . . . . . 19 . n1 parsed_1ajt 1
18 1 1 . . . . . . . . . 12 . o4 parsed_1ajt 1
18 1 2 . . . . . . . . . 19 . h61 parsed_1ajt 1
19 1 1 . . . . . . . . . 12 . o2 parsed_1ajt 1
19 1 2 . . . . . . . . . 19 . h2 parsed_1ajt 1
20 1 1 . . . . . . . . . 12 . h3 parsed_1ajt 1
20 1 2 . . . . . . . . . 19 . h2 parsed_1ajt 1
21 1 1 . . . . . . . . . 10 . o6 parsed_1ajt 1
21 1 2 . . . . . . . . . 21 . h3 parsed_1ajt 1
22 1 1 . . . . . . . . . 10 . h1 parsed_1ajt 1
22 1 2 . . . . . . . . . 21 . o2 parsed_1ajt 1
23 1 1 . . . . . . . . . 10 . o6 parsed_1ajt 1
23 1 2 . . . . . . . . . 21 . o2 parsed_1ajt 1
24 1 1 . . . . . . . . . 10 . n1 parsed_1ajt 1
24 1 2 . . . . . . . . . 21 . n3 parsed_1ajt 1
25 1 1 . . . . . . . . . 10 . h1 parsed_1ajt 1
25 1 2 . . . . . . . . . 21 . h3 parsed_1ajt 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
_Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err
_Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err
_Dist_constraint_value.Distance_val
_Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val
_Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val
_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . . . 1.9 1.8 2.0 parsed_1ajt 1
2 1 . . . . . 2.0 1.9 2.1 parsed_1ajt 1
3 1 . . . . . 1.7 1.6 1.8 parsed_1ajt 1
4 1 . . . . . 3.0 2.9 3.1 parsed_1ajt 1
5 1 . . . . . 1.9 1.8 2.0 parsed_1ajt 1
6 1 . . . . . 2.0 1.9 2.1 parsed_1ajt 1
7 1 . . . . . 1.7 1.6 1.8 parsed_1ajt 1
8 1 . . . . . 3.0 2.9 3.1 parsed_1ajt 1
9 1 . . . . . 1.9 1.8 2.0 parsed_1ajt 1
10 1 . . . . . 2.0 1.9 2.1 parsed_1ajt 1
11 1 . . . . . 1.7 1.6 1.8 parsed_1ajt 1
12 1 . . . . . 3.0 2.9 3.1 parsed_1ajt 1
13 1 . . . . . 1.9 1.8 2.0 parsed_1ajt 1
14 1 . . . . . 2.0 1.9 2.1 parsed_1ajt 1
15 1 . . . . . 1.7 1.6 1.8 parsed_1ajt 1
16 1 . . . . . 3.0 2.9 3.1 parsed_1ajt 1
17 1 . . . . . 1.9 1.8 2.0 parsed_1ajt 1
18 1 . . . . . 1.8 1.7 1.9 parsed_1ajt 1
19 1 . . . . . 3.2 3.1 3.3 parsed_1ajt 1
20 1 . . . . . 2.9 2.8 3.0 parsed_1ajt 1
21 1 . . . . . 1.9 1.8 2.0 parsed_1ajt 1
22 1 . . . . . 1.8 1.7 1.9 parsed_1ajt 1
23 1 . . . . . 3.7 3.6 3.8 parsed_1ajt 1
24 1 . . . . . 3.7 3.6 3.8 parsed_1ajt 1
25 1 . . . . . 2.6 2.5 2.7 parsed_1ajt 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1 "constrain base pair hydrogen bonds" 1 1 1 1 parsed_1ajt 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1ajt
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1ajt 2
2 1 . . . parsed_1ajt 2
3 1 . . . parsed_1ajt 2
4 1 . . . parsed_1ajt 2
5 1 . . . parsed_1ajt 2
6 1 . . . parsed_1ajt 2
7 1 . . . parsed_1ajt 2
8 1 . . . parsed_1ajt 2
9 1 . . . parsed_1ajt 2
10 1 . . . parsed_1ajt 2
11 1 . . . parsed_1ajt 2
12 1 . . . parsed_1ajt 2
13 1 . . . parsed_1ajt 2
14 1 . . . parsed_1ajt 2
15 1 . . . parsed_1ajt 2
16 1 . . . parsed_1ajt 2
17 1 . . . parsed_1ajt 2
18 1 . . . parsed_1ajt 2
19 1 . . . parsed_1ajt 2
20 1 . . . parsed_1ajt 2
21 1 . . . parsed_1ajt 2
22 1 . . . parsed_1ajt 2
23 1 . . . parsed_1ajt 2
24 1 . . . parsed_1ajt 2
25 1 . . . parsed_1ajt 2
26 1 . . . parsed_1ajt 2
27 1 . . . parsed_1ajt 2
28 1 . . . parsed_1ajt 2
29 1 . . . parsed_1ajt 2
30 1 . . . parsed_1ajt 2
31 1 . . . parsed_1ajt 2
32 1 . . . parsed_1ajt 2
33 1 . . . parsed_1ajt 2
34 1 . . . parsed_1ajt 2
35 1 . . . parsed_1ajt 2
36 1 . . . parsed_1ajt 2
37 1 . . . parsed_1ajt 2
38 1 . . . parsed_1ajt 2
39 1 . . . parsed_1ajt 2
40 1 . . . parsed_1ajt 2
41 1 . . . parsed_1ajt 2
42 1 . . . parsed_1ajt 2
43 1 . . . parsed_1ajt 2
44 1 . . . parsed_1ajt 2
45 1 . . . parsed_1ajt 2
46 1 . . . parsed_1ajt 2
47 1 . . . parsed_1ajt 2
48 1 . . . parsed_1ajt 2
49 1 . . . parsed_1ajt 2
50 1 . . . parsed_1ajt 2
51 1 . . . parsed_1ajt 2
52 1 . . . parsed_1ajt 2
53 1 . . . parsed_1ajt 2
54 1 . . . parsed_1ajt 2
55 1 . . . parsed_1ajt 2
56 1 . . . parsed_1ajt 2
57 1 . . . parsed_1ajt 2
58 1 . . . parsed_1ajt 2
59 1 . . . parsed_1ajt 2
60 1 . . . parsed_1ajt 2
61 1 . . . parsed_1ajt 2
62 1 . . . parsed_1ajt 2
63 1 . . . parsed_1ajt 2
64 1 . . . parsed_1ajt 2
65 1 . . . parsed_1ajt 2
66 1 . . . parsed_1ajt 2
67 1 . . . parsed_1ajt 2
68 1 . . . parsed_1ajt 2
69 1 . . . parsed_1ajt 2
70 1 . . . parsed_1ajt 2
71 1 . . . parsed_1ajt 2
72 1 . . . parsed_1ajt 2
73 1 . . . parsed_1ajt 2
74 1 . . . parsed_1ajt 2
75 1 . . . parsed_1ajt 2
76 1 . . . parsed_1ajt 2
77 1 . . . parsed_1ajt 2
78 1 . . . parsed_1ajt 2
79 1 . . . parsed_1ajt 2
80 1 . . . parsed_1ajt 2
81 1 . . . parsed_1ajt 2
82 1 . . . parsed_1ajt 2
83 1 . . . parsed_1ajt 2
84 1 . . . parsed_1ajt 2
85 1 . . . parsed_1ajt 2
86 1 . . . parsed_1ajt 2
87 1 . . . parsed_1ajt 2
88 1 . . . parsed_1ajt 2
89 1 . . . parsed_1ajt 2
90 1 . . . parsed_1ajt 2
91 1 . . . parsed_1ajt 2
92 1 . . . parsed_1ajt 2
93 1 . . . parsed_1ajt 2
94 1 . . . parsed_1ajt 2
95 1 . . . parsed_1ajt 2
96 1 . . . parsed_1ajt 2
97 1 . . . parsed_1ajt 2
98 1 . . . parsed_1ajt 2
99 1 . . . parsed_1ajt 2
100 1 . . . parsed_1ajt 2
101 1 . . . parsed_1ajt 2
102 1 . . . parsed_1ajt 2
103 1 . . . parsed_1ajt 2
104 1 . . . parsed_1ajt 2
105 1 . . . parsed_1ajt 2
106 1 . . . parsed_1ajt 2
107 1 . . . parsed_1ajt 2
108 1 . . . parsed_1ajt 2
109 1 . . . parsed_1ajt 2
110 1 . . . parsed_1ajt 2
111 1 . . . parsed_1ajt 2
112 1 . . . parsed_1ajt 2
113 1 . . . parsed_1ajt 2
114 1 . . . parsed_1ajt 2
115 1 . . . parsed_1ajt 2
116 1 . . . parsed_1ajt 2
117 1 . . . parsed_1ajt 2
118 1 . . . parsed_1ajt 2
119 1 . . . parsed_1ajt 2
120 1 . . . parsed_1ajt 2
121 1 . . . parsed_1ajt 2
122 1 . . . parsed_1ajt 2
123 1 . . . parsed_1ajt 2
124 1 . . . parsed_1ajt 2
125 1 . . . parsed_1ajt 2
126 1 . . . parsed_1ajt 2
127 1 . . . parsed_1ajt 2
128 1 . . . parsed_1ajt 2
129 1 . . . parsed_1ajt 2
130 1 . . . parsed_1ajt 2
131 1 . . . parsed_1ajt 2
132 1 . . . parsed_1ajt 2
133 1 . . . parsed_1ajt 2
134 1 . . . parsed_1ajt 2
135 1 . . . parsed_1ajt 2
136 1 . . . parsed_1ajt 2
137 1 . . . parsed_1ajt 2
138 1 . . . parsed_1ajt 2
139 1 . . . parsed_1ajt 2
140 1 . . . parsed_1ajt 2
141 1 . . . parsed_1ajt 2
142 1 . . . parsed_1ajt 2
143 1 . . . parsed_1ajt 2
144 1 . . . parsed_1ajt 2
145 1 . . . parsed_1ajt 2
146 1 . . . parsed_1ajt 2
147 1 . . . parsed_1ajt 2
148 1 . . . parsed_1ajt 2
149 1 . . . parsed_1ajt 2
150 1 . . . parsed_1ajt 2
151 1 . . . parsed_1ajt 2
152 1 . . . parsed_1ajt 2
153 1 . . . parsed_1ajt 2
154 1 . . . parsed_1ajt 2
155 1 . . . parsed_1ajt 2
156 1 . . . parsed_1ajt 2
157 1 . . . parsed_1ajt 2
158 1 . . . parsed_1ajt 2
159 1 . . . parsed_1ajt 2
160 1 . . . parsed_1ajt 2
161 1 . . . parsed_1ajt 2
162 1 . . . parsed_1ajt 2
163 1 . . . parsed_1ajt 2
164 1 . . . parsed_1ajt 2
165 1 . . . parsed_1ajt 2
166 1 . . . parsed_1ajt 2
167 1 . . . parsed_1ajt 2
168 1 . . . parsed_1ajt 2
169 1 . . . parsed_1ajt 2
170 1 . . . parsed_1ajt 2
171 1 . . . parsed_1ajt 2
172 1 . . . parsed_1ajt 2
173 1 . . . parsed_1ajt 2
174 1 . . . parsed_1ajt 2
175 1 . . . parsed_1ajt 2
176 1 . . . parsed_1ajt 2
177 1 . . . parsed_1ajt 2
178 1 . . . parsed_1ajt 2
179 1 . . . parsed_1ajt 2
180 1 . . . parsed_1ajt 2
181 1 . . . parsed_1ajt 2
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1 "2ms4a.dihed beta, epsilon, delta, gamma and alpha and zeta" 1 1 1 1 parsed_1ajt 1
2 "keep amino groups in the plane of the base" 2 1 2 1 parsed_1ajt 1
3 "make some nucleotides 3'-endo" 36 1 36 1 parsed_1ajt 1
4 "modified to restrain vo, v1, v2, and v3 instead of delta" 37 1 37 1 parsed_1ajt 1
5 "restrain some nucleotides to be 2'-endo" 166 1 166 1 parsed_1ajt 1
6 "restrain nucleotides which are mixtures" 187 1 187 1 parsed_1ajt 1
7 "restrain them to be 2'-endo or 3'-endo or in between" 188 1 188 1 parsed_1ajt 1
8 "restrain some nucleotides to keep the bases anti" 218 1 218 1 parsed_1ajt 1
9 "backbone torsion angle beta" 257 1 257 1 parsed_1ajt 1
10 "used in refinement only" 258 1 258 1 parsed_1ajt 1
11 "backbone torsion angle gamma" 282 1 282 1 parsed_1ajt 1
12 "used in refinement only" 283 1 283 1 parsed_1ajt 1
13 "backbone torsion angle epsilon" 310 1 310 1 parsed_1ajt 1
14 "used in refinment only" 311 1 311 1 parsed_1ajt 1
15 "backbone torsion angle alpha" 334 1 334 1 parsed_1ajt 1
16 "used in refinement only" 335 1 335 1 parsed_1ajt 1
17 "backbone torsion angle zeta" 358 1 358 1 parsed_1ajt 1
18 "used in refinement only" 359 1 359 1 parsed_1ajt 1
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