NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
429193 | 2j4m | 7285 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_2j4m save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1410 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 910 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 164.134 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.259 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0141 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0032 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0301 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 2 MET 0.521 0.054 3 0 "[ . ]" 1 3 ALA 1.098 0.137 3 0 "[ . ]" 1 4 CYS 0.086 0.021 3 0 "[ . ]" 1 5 TRP 0.384 0.045 4 0 "[ . ]" 1 6 ALA 0.418 0.066 5 0 "[ . ]" 1 7 GLN 0.459 0.043 5 0 "[ . ]" 1 8 SER 0.014 0.014 5 0 "[ . ]" 1 9 GLN 0.174 0.025 6 0 "[ . ]" 1 10 GLY 0.120 0.023 2 0 "[ . ]" 1 11 TYR 0.490 0.058 5 0 "[ . ]" 1 12 ASN 0.092 0.060 4 0 "[ . ]" 1 13 CYS 0.349 0.064 3 0 "[ . ]" 1 14 CYS 0.942 0.156 4 0 "[ . ]" 1 15 ASN 0.798 0.136 1 0 "[ . ]" 1 16 ASN 0.449 0.058 5 0 "[ . ]" 1 17 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ . ]" 1 18 SER 0.434 0.058 4 0 "[ . ]" 1 19 SER 0.393 0.055 6 0 "[ . ]" 1 20 THR 1.658 0.138 2 0 "[ . ]" 1 21 LYS 0.084 0.016 5 0 "[ . ]" 1 22 VAL 1.738 0.252 6 0 "[ . ]" 1 23 GLU 0.364 0.040 3 0 "[ . ]" 1 24 TYR 1.554 0.252 6 0 "[ . ]" 1 25 THR 0.318 0.043 6 0 "[ . ]" 1 26 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ . ]" 1 27 ALA 0.382 0.055 5 0 "[ . ]" 1 28 SER 0.209 0.043 6 0 "[ . ]" 1 29 GLY 0.253 0.055 5 0 "[ . ]" 1 30 GLN 0.431 0.057 6 0 "[ . ]" 1 31 TRP 0.265 0.033 3 0 "[ . ]" 1 32 GLY 0.267 0.057 2 0 "[ . ]" 1 33 VAL 0.419 0.057 2 0 "[ . ]" 1 34 GLN 0.999 0.058 4 0 "[ . ]" 1 35 ASN 0.571 0.050 4 0 "[ . ]" 1 36 GLY 0.002 0.002 2 0 "[ . ]" 1 37 GLN 0.164 0.023 4 0 "[ . ]" 1 38 TRP 0.292 0.046 5 0 "[ . ]" 1 39 CYS 0.445 0.156 4 0 "[ . ]" 1 40 GLY 0.001 0.001 2 0 "[ . ]" 1 41 ILE 1.569 0.073 3 0 "[ . ]" 1 42 ASP 0.249 0.066 5 0 "[ . ]" 1 43 TYR 0.641 0.073 3 0 "[ . ]" 1 44 SER 0.506 0.074 3 0 "[ . ]" 1 45 TYR 1.956 0.137 3 0 "[ . ]" 1 46 GLY 0.448 0.082 5 0 "[ . ]" 1 47 GLN 0.330 0.054 3 0 "[ . ]" 1 48 ASN 0.030 0.017 4 0 "[ . ]" 1 49 GLN 1.245 0.259 2 0 "[ . ]" 1 50 GLY 0.456 0.259 2 0 "[ . ]" 1 51 ASN 0.203 0.055 4 0 "[ . ]" 1 52 GLU 0.049 0.017 4 0 "[ . ]" 1 53 SER 0.049 0.025 3 0 "[ . ]" 1 54 CYS 0.423 0.136 4 0 "[ . ]" 1 55 THR 1.600 0.136 4 0 "[ . ]" 1 56 GLY 0.072 0.020 1 0 "[ . ]" 1 57 ASN 0.591 0.116 3 0 "[ . ]" 1 58 GLY 0.532 0.082 4 0 "[ . ]" 1 59 SER 0.240 0.074 5 0 "[ . ]" 1 60 TYR 0.339 0.053 4 0 "[ . ]" 1 61 PRO 0.202 0.046 6 0 "[ . ]" 1 62 CYS 0.161 0.042 2 0 "[ . ]" 1 63 CYS 0.330 0.042 5 0 "[ . ]" 1 64 ASN 0.750 0.066 4 0 "[ . ]" 1 65 THR 1.002 0.082 3 0 "[ . ]" 1 66 CYS 0.731 0.102 3 0 "[ . ]" 1 67 GLN 0.639 0.074 5 0 "[ . ]" 1 68 ALA 1.544 0.140 5 0 "[ . ]" 1 69 THR 1.886 0.165 6 0 "[ . ]" 1 70 TYR 0.958 0.074 3 0 "[ . ]" 1 71 THR 0.744 0.055 1 0 "[ . ]" 1 72 ASP 0.306 0.094 4 0 "[ . ]" 1 73 GLY 0.053 0.039 4 0 "[ . ]" 1 74 ASP 0.489 0.080 5 0 "[ . ]" 1 75 GLY 0.136 0.036 6 0 "[ . ]" 1 76 ASP 0.551 0.094 4 0 "[ . ]" 1 77 TRP 1.600 0.165 6 0 "[ . ]" 1 78 ALA 1.749 0.079 4 0 "[ . ]" 1 79 PHE 0.001 0.001 1 0 "[ . ]" 1 80 GLU 0.365 0.054 6 0 "[ . ]" 1 81 ASN 0.070 0.019 3 0 "[ . ]" 1 82 GLY 0.015 0.011 6 0 "[ . ]" 1 83 ASN 0.234 0.054 6 0 "[ . ]" 1 84 TRP 0.161 0.040 6 0 "[ . ]" 1 85 CYS 0.325 0.046 6 0 "[ . ]" 1 86 GLY 0.387 0.053 4 0 "[ . ]" 1 87 ILE 2.010 0.184 5 0 "[ . ]" 1 88 LYS 0.684 0.091 6 0 "[ . ]" 1 89 ASN 0.400 0.080 5 0 "[ . ]" 1 90 SER 0.554 0.085 4 0 "[ . ]" 1 91 CYS 0.761 0.091 4 0 "[ . ]" 1 92 LYS 2.042 0.184 5 0 "[ . ]" 1 93 GLN 0.586 0.086 2 0 "[ . ]" 1 94 GLN 0.707 0.176 6 0 "[ . ]" 1 95 PRO 0.640 0.176 6 0 "[ . ]" 1 96 GLN 0.478 0.128 4 0 "[ . ]" 1 97 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ . ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 2 MET HA 1 2 MET ME 5.000 . 5.000 3.411 3.055 4.013 . 0 0 "[ . ]" 1 2 1 2 MET HA 1 3 ALA MB 5.000 . 5.000 4.141 4.098 4.166 . 0 0 "[ . ]" 1 3 1 2 MET HA 1 3 ALA H 3.500 . 3.500 2.234 2.183 2.265 . 0 0 "[ . ]" 1 4 1 2 MET QB 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 3.868 3.660 4.017 . 0 0 "[ . ]" 1 5 1 2 MET ME 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 4.825 4.124 5.036 0.036 3 0 "[ . ]" 1 6 1 2 MET QG 1 3 ALA MB 5.000 . 5.000 4.767 4.153 5.027 0.027 5 0 "[ . ]" 1 7 1 2 MET QG 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 3.958 3.582 4.875 . 0 0 "[ . ]" 1 8 1 2 MET HA 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 3.514 3.453 3.578 . 0 0 "[ . ]" 1 9 1 2 MET QB 1 7 GLN QE 5.000 . 5.000 4.709 4.128 5.016 0.016 4 0 "[ . ]" 1 10 1 2 MET QB 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 4.805 4.437 5.046 0.046 6 0 "[ . ]" 1 11 1 2 MET QB 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 4.072 3.330 4.460 . 0 0 "[ . ]" 1 12 1 2 MET ME 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 3.872 2.824 5.012 0.012 5 0 "[ . ]" 1 13 1 2 MET QG 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 4.046 3.294 4.793 . 0 0 "[ . ]" 1 14 1 2 MET H 1 47 GLN HA 5.000 . 5.000 4.945 4.588 5.034 0.034 3 0 "[ . ]" 1 15 1 2 MET H 1 47 GLN QG 5.000 . 5.000 5.028 5.006 5.054 0.054 3 0 "[ . ]" 1 16 1 3 ALA H 1 3 ALA MB 3.500 . 3.500 2.758 2.747 2.773 . 0 0 "[ . ]" 1 17 1 3 ALA HA 1 4 CYS HA 5.000 . 5.000 4.711 4.685 4.743 . 0 0 "[ . ]" 1 18 1 3 ALA HA 1 4 CYS H 3.500 . 3.500 2.898 2.881 2.925 . 0 0 "[ . ]" 1 19 1 3 ALA MB 1 4 CYS HA 5.000 . 5.000 4.164 4.147 4.195 . 0 0 "[ . ]" 1 20 1 3 ALA MB 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 3.626 3.616 3.635 . 0 0 "[ . ]" 1 21 1 3 ALA H 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 2.067 2.037 2.111 . 0 0 "[ . ]" 1 22 1 3 ALA MB 1 7 GLN QE 5.000 . 5.000 4.973 4.898 5.016 0.016 4 0 "[ . ]" 1 23 1 3 ALA MB 1 7 GLN QG 5.000 . 5.000 5.023 4.982 5.043 0.043 5 0 "[ . ]" 1 24 1 3 ALA MB 1 44 SER QB 5.000 . 5.000 5.043 5.021 5.062 0.062 3 0 "[ . ]" 1 25 1 3 ALA MB 1 45 TYR QB 5.000 . 5.000 3.430 2.969 4.275 . 0 0 "[ . ]" 1 26 1 3 ALA MB 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 3.984 3.913 4.072 . 0 0 "[ . ]" 1 27 1 3 ALA MB 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 5.093 5.061 5.137 0.137 3 0 "[ . ]" 1 28 1 3 ALA H 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 2.407 1.796 2.710 0.004 3 0 "[ . ]" 1 29 1 4 CYS HA 1 5 TRP HD1 5.000 . 5.000 4.011 3.750 4.272 . 0 0 "[ . ]" 1 30 1 4 CYS HA 1 5 TRP H 5.000 . 5.000 2.250 2.145 2.376 . 0 0 "[ . ]" 1 31 1 4 CYS H 1 5 TRP H 5.000 . 5.000 4.587 4.505 4.628 . 0 0 "[ . ]" 1 32 1 4 CYS HA 1 6 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