NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
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401938 |
1w7e   |
cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1w7e
save_distance_constraint_statistics_1
_Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1194
_Distance_constraint_stats_list.Viol_count 798
_Distance_constraint_stats_list.Viol_total 180.585
_Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.240
_Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0179
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0042
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0377
_Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500
_Distance_constraint_stats_list.Details
;
Description of the tags in this list:
* 1 * Administrative tag
* 2 * Administrative tag
* 3 * Administrative tag
* 4 * ID of the restraint list.
* 5 * Number of restraints in list.
* 6 * Number of violated restraints (each model violation is used).
* 7 * Sum of violations in Angstrom.
* 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way.
* 9 * Rms of violations over all restraints.
* 10 * Average violation over all restraints.
* 11 * Average violation over violated restraints.
This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated.
These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998).
* 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table.
* 13 * This tag
Description of the tags in the per residue table below:
* 1 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 2 * Residue number
* 3 * Residue name
* 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging)
* 5 * Model number with the maximum violation
* 6 * Number of models with a violation above cutoff
* 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff.
An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest
violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff.
For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'.
For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1.
* 8 * Administrative tag
* 9 * Administrative tag
Description of the tags in the per restraint table below:
* 1 * Restraint ID within restraint list.
First node, FIRST member, first atom's:
* 2 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 3 * Residue number
* 4 * Residue name
* 5 * Name of (pseudo-)atom
First node, SECOND member, first atom's:
* 6 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 7 * Residue number
* 8 * Residue name
* 9 * Name of (pseudo-)atom
FIRST node's:
* 10 * Target distance value (Angstrom)
* 11 * Lower bound distance (Angstrom)
* 12 * Upper bound distance (Angstrom)
* 13 * Average distance in ensemble of models
* 14 * Minimum distance in ensemble of models
* 15 * Maximum distance in ensemble of models
* 16 * Maximum violation (without any averaging)
* 17 * Model number with the maximum violation
* 18 * Number of models with a violation above cutoff
* 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above.
* 20 * Administrative tag
* 21 * Administrative tag
;
loop_
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model
1 4 ASP 0.350 0.076 2 0 "[ . ]"
1 5 ILE 1.958 0.147 3 0 "[ . ]"
1 6 VAL 2.012 0.235 5 0 "[ . ]"
1 7 GLU 0.702 0.118 6 0 "[ . ]"
1 8 THR 0.091 0.056 4 0 "[ . ]"
1 9 ALA 1.755 0.209 2 0 "[ . ]"
1 10 THR 0.118 0.031 3 0 "[ . ]"
1 11 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 12 ALA 1.030 0.121 4 0 "[ . ]"
1 13 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 14 SER 0.182 0.076 3 0 "[ . ]"
1 15 PHE 2.256 0.222 6 0 "[ . ]"
1 16 THR 0.739 0.153 6 0 "[ . ]"
1 17 THR 0.668 0.124 6 0 "[ . ]"
1 18 LEU 0.201 0.051 3 0 "[ . ]"
1 19 LEU 0.985 0.132 2 0 "[ . ]"
1 20 THR 1.840 0.132 2 0 "[ . ]"
1 21 ALA 0.607 0.086 5 0 "[ . ]"
1 22 ALA 2.450 0.240 5 0 "[ . ]"
1 23 GLU 0.417 0.086 5 0 "[ . ]"
1 24 ALA 1.658 0.209 2 0 "[ . ]"
1 25 ALA 0.648 0.123 6 0 "[ . ]"
1 26 GLY 0.048 0.029 5 0 "[ . ]"
1 27 LEU 1.957 0.235 5 0 "[ . ]"
1 28 VAL 2.538 0.240 5 0 "[ . ]"
1 29 ASP 0.225 0.049 6 0 "[ . ]"
1 30 THR 0.957 0.207 4 0 "[ . ]"
1 31 LEU 0.363 0.058 6 0 "[ . ]"
1 32 LYS 1.160 0.131 5 0 "[ . ]"
1 33 GLY 0.716 0.114 4 0 "[ . ]"
1 34 ASP 0.881 0.140 6 0 "[ . ]"
1 35 GLY 1.030 0.110 3 0 "[ . ]"
1 36 PRO 0.367 0.110 3 0 "[ . ]"
1 37 PHE 1.828 0.111 4 0 "[ . ]"
1 38 THR 0.686 0.099 4 0 "[ . ]"
1 39 VAL 0.802 0.141 1 0 "[ . ]"
1 40 PHE 0.948 0.080 4 0 "[ . ]"
1 41 ALA 0.679 0.141 1 0 "[ . ]"
1 42 PRO 0.296 0.069 2 0 "[ . ]"
1 43 THR 0.112 0.019 1 0 "[ . ]"
1 44 ASP 0.127 0.027 2 0 "[ . ]"
1 45 ALA 0.221 0.040 1 0 "[ . ]"
1 46 ALA 0.142 0.040 1 0 "[ . ]"
1 47 PHE 0.601 0.053 2 0 "[ . ]"
1 48 ALA 0.197 0.040 4 0 "[ . ]"
1 49 ALA 0.191 0.040 4 0 "[ . ]"
1 50 LEU 0.393 0.053 2 0 "[ . ]"
1 51 PRO 0.022 0.017 1 0 "[ . ]"
1 52 GLU 0.022 0.017 1 0 "[ . ]"
1 53 GLY 0.125 0.021 4 0 "[ . ]"
1 54 THR 0.844 0.071 2 0 "[ . ]"
1 55 VAL 1.021 0.072 1 0 "[ . ]"
1 56 GLU 0.818 0.072 1 0 "[ . ]"
1 57 ASP 0.315 0.056 1 0 "[ . ]"
1 58 LEU 0.467 0.054 2 0 "[ . ]"
1 59 LEU 0.320 0.052 6 0 "[ . ]"
1 60 LYS 0.078 0.019 5 0 "[ . ]"
1 61 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 62 GLU 0.022 0.012 4 0 "[ . ]"
1 63 ASN 0.341 0.042 5 0 "[ . ]"
1 64 LYS 0.312 0.035 1 0 "[ . ]"
1 65 GLU 0.089 0.029 3 0 "[ . ]"
1 66 LYS 0.182 0.041 6 0 "[ . ]"
1 67 LEU 0.080 0.042 5 0 "[ . ]"
1 68 THR 0.102 0.036 4 0 "[ . ]"
1 69 GLU 0.253 0.041 6 0 "[ . ]"
1 70 ILE 0.335 0.050 6 0 "[ . ]"
1 71 LEU 0.092 0.051 2 0 "[ . ]"
1 72 THR 0.217 0.043 2 0 "[ . ]"
1 73 TYR 0.763 0.066 6 0 "[ . ]"
1 74 HIS 0.180 0.094 4 0 "[ . ]"
1 75 VAL 0.476 0.069 3 0 "[ . ]"
1 76 VAL 0.458 0.094 4 0 "[ . ]"
1 77 PRO 0.035 0.016 3 0 "[ . ]"
1 78 GLY 0.080 0.021 2 0 "[ . ]"
1 79 GLU 0.095 0.026 2 0 "[ . ]"
1 80 VAL 0.081 0.033 3 0 "[ . ]"
1 81 MET 0.090 0.024 3 0 "[ . ]"
1 82 SER 0.012 0.012 2 0 "[ . ]"
1 83 SER 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 84 ASP 0.283 0.039 1 0 "[ . ]"
1 85 LEU 0.240 0.058 2 0 "[ . ]"
1 86 THR 0.319 0.058 2 0 "[ . ]"
1 87 GLU 0.000 0.000 5 0 "[ . ]"
1 88 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 89 MET 0.434 0.056 3 0 "[ . ]"
1 90 THR 0.834 0.144 2 0 "[ . ]"
1 91 ALA 0.801 0.144 2 0 "[ . ]"
1 92 GLU 0.203 0.039 1 0 "[ . ]"
1 93 THR 0.559 0.066 6 0 "[ . ]"
1 94 VAL 0.219 0.049 2 0 "[ . ]"
1 95 GLU 0.363 0.069 3 0 "[ . ]"
1 96 GLY 0.348 0.040 2 0 "[ . ]"
1 97 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 98 ALA 0.055 0.019 6 0 "[ . ]"
1 99 LEU 0.080 0.057 4 0 "[ . ]"
1 100 THR 0.222 0.023 1 0 "[ . ]"
1 101 VAL 0.007 0.007 3 0 "[ . ]"
1 102 THR 0.103 0.023 1 0 "[ . ]"
1 103 LEU 0.085 0.017 3 0 "[ . ]"
1 104 GLU 0.008 0.003 3 0 "[ . ]"
1 106 GLY 0.068 0.017 6 0 "[ . ]"
1 107 PRO 0.060 0.017 6 0 "[ . ]"
1 108 LYS 0.028 0.013 2 0 "[ . ]"
1 109 VAL 0.083 0.027 2 0 "[ . ]"
1 110 ASN 0.050 0.024 4 0 "[ . ]"
1 111 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 112 VAL 0.203 0.055 4 0 "[ . ]"
1 113 SER 0.663 0.078 6 0 "[ . ]"
1 114 ILE 0.637 0.069 3 0 "[ . ]"
1 115 SER 0.450 0.078 6 0 "[ . ]"
1 116 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 117 PRO 0.153 0.071 4 0 "[ . ]"
1 118 ASP 0.167 0.071 4 0 "[ . ]"
1 119 VAL 0.594 0.097 2 0 "[ . ]"
1 120 ASP 0.499 0.097 2 0 "[ . ]"
1 121 ALA 0.315 0.122 3 0 "[ . ]"
1 122 SER 0.327 0.112 5 0 "[ . ]"
1 123 ASN 0.733 0.140 6 0 "[ . ]"
1 124 GLY 0.238 0.147 3 0 "[ . ]"
1 125 VAL 0.277 0.052 3 0 "[ . ]"
1 126 ILE 0.017 0.014 4 0 "[ . ]"
1 127 HIS 0.043 0.014 6 0 "[ . ]"
1 128 VAL 0.966 0.124 4 0 "[ . ]"
1 129 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 130 ASP 0.521 0.124 4 0 "[ . ]"
1 131 GLY 0.109 0.029 5 0 "[ . ]"
1 132 VAL 0.123 0.033 2 0 "[ . ]"
1 133 LEU 0.188 0.055 4 0 "[ . ]"
1 134 MET 0.493 0.080 4 0 "[ . ]"
1 135 PRO 0.250 0.044 4 0 "[ . ]"
1 136 GLY 0.021 0.021 5 0 "[ . ]"
stop_
loop_
_Distance_constraint_stats.Restraint_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_ID
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val
_Distance_constraint_stats.Distance_average
_Distance_constraint_stats.Distance_minimum
_Distance_constraint_stats.Distance_maximum
_Distance_constraint_stats.Max_violation
_Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model
_Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID
1 1 4 ASP QB 1 5 ILE H 5.000 . 5.000 1.980 1.812 2.116 . 0 0 "[ . ]" 1
2 1 4 ASP H 1 5 ILE MD 5.000 . 5.000 4.600 3.877 5.042 0.042 5 0 "[ . ]" 1
3 1 4 ASP H 1 5 ILE H 5.000 . 5.000 2.940 2.386 3.566 . 0 0 "[ . ]" 1
4 1 4 ASP QB 1 6 VAL QG 5.000 . 5.000 3.983 3.058 5.057 0.057 6 0 "[ . ]" 1
5 1 4 ASP QB 1 6 VAL H 5.000 . 5.000 3.891 3.166 4.153 . 0 0 "[ . ]" 1
6 1 4 ASP H 1 6 VAL H 5.000 . 5.000 2.702 2.565 2.809 . 0 0 "[ . ]" 1
7 1 4 ASP H 1 7 GLU HA 5.000 . 5.000 4.760 4.439 5.023 0.023 1 0 "[ . ]" 1
8 1 4 ASP H 1 7 GLU QB 5.000 . 5.000 3.021 2.737 3.301 . 0 0 "[ . ]" 1
9 1 4 ASP H 1 7 GLU QG 5.000 . 5.000 3.812 3.208 4.608 . 0 0 "[ . ]" 1
10 1 4 ASP H 1 7 GLU H 5.000 . 5.000 2.531 2.291 2.725 . 0 0 "[ . ]" 1
11 1 4 ASP H 1 8 THR H 5.000 . 5.000 4.806 4.523 5.004 0.004 1 0 "[ . ]" 1
12 1 4 ASP QB 1 32 LYS QG 3.500 . 3.500 3.371 2.616 3.576 0.076 2 0 "[ . ]" 1
13 1 5 ILE HA 1 5 ILE MG 3.500 . 3.500 2.355 2.221 2.437 . 0 0 "[ . ]" 1
14 1 5 ILE H 1 5 ILE MD 5.000 . 5.000 2.365 1.922 2.739 . 0 0 "[ . ]" 1
15 1 5 ILE H 1 5 ILE QG 5.000 . 5.000 2.471 2.160 2.730 . 0 0 "[ . ]" 1
16 1 5 ILE HA 1 6 VAL H 5.000 . 5.000 3.496 3.452 3.525 . 0 0 "[ . ]" 1
17 1 5 ILE HB 1 6 VAL H 5.000 . 5.000 2.580 2.477 2.792 . 0 0 "[ . ]" 1
18 1 5 ILE MD 1 6 VAL H 5.000 . 5.000 3.756 3.408 4.078 . 0 0 "[ . ]" 1
19 1 5 ILE QG 1 6 VAL QG 5.000 . 5.000 4.566 4.356 4.977 . 0 0 "[ . ]" 1
20 1 5 ILE MG 1 6 VAL QG 3.500 . 3.500 3.456 3.124 3.546 0.046 2 0 "[ . ]" 1
21 1 5 ILE MG 1 6 VAL H 5.000 . 5.000 3.502 3.327 3.597 . 0 0 "[ . ]" 1
22 1 5 ILE H 1 6 VAL H 5.000 . 5.000 2.574 2.441 2.709 . 0 0 "[ . ]" 1
23 1 5 ILE MG 1 7 GLU H 5.000 . 5.000 4.814 4.624 5.008 0.008 6 0 "[ . ]" 1
24 1 5 ILE HA 1 8 THR HB 5.000 . 5.000 3.664 3.432 4.135 . 0 0 "[ . ]" 1
25 1 5 ILE HA 1 8 THR MG 5.000 . 5.000 4.254 3.869 4.699 . 0 0 "[ . ]" 1
26 1 5 ILE HA 1 8 THR H 5.000 . 5.000 3.400 3.253 3.518 . 0 0 "[ . ]" 1
27 1 5 ILE MG 1 8 THR H 5.000 . 5.000 4.152 3.922 4.277 . 0 0 "[ . ]" 1
28 1 5 ILE HB 1 31 LEU QB 5.000 . 5.000 2.881 2.536 3.418 . 0 0 "[ . ]" 1
29 1 5 ILE MD 1 31 LEU QB 5.000 . 5.000 2.539 2.034 2.879 . 0 0 "[ . ]" 1
30 1 5 ILE H 1 32 LYS HA 5.000 . 5.000 5.079 5.041 5.131 0.131 5 0 "[ . ]" 1
31 1 5 ILE MD 1 37 PHE HA 5.000 . 5.000 5.048 5.023 5.061 0.061 2 0 "[ . ]" 1
32 1 5 ILE MD 1 37 PHE QB 5.000 . 5.000 2.901 2.768 3.029 . 0 0 "[ . ]" 1
33 1 5 ILE MD 1 37 PHE QD 5.000 . 5.000 4.393 4.097 4.652 . 0 0 "[ . ]" 1
34 1 5 ILE H 1 121 ALA MB 5.000 . 5.000 4.612 4.160 5.122 0.122 3 0 "[ . ]" 1
35 1 5 ILE H 1 122 SER H 5.000 . 5.000 4.853 3.793 5.112 0.112 5 0 "[ . ]" 1
36 1 5 ILE MD 1 123 ASN QD 5.000 . 5.000 4.155 3.615 4.552 . 0 0 "[ . ]" 1
37 1 5 ILE H 1 123 ASN QD 5.000 . 5.000 5.035 4.965 5.119 0.119 3 0 "[ . ]" 1
38 1 5 ILE H 1 123 ASN H 5.000 . 5.000 4.756 4.033 5.088 0.088 6 0 "[ . ]" 1
39 1 5 ILE MD 1 124 GLY QA 5.000 . 5.000 4.840 4.477 5.147 0.147 3 0 "[ . ]" 1
40 1 6 VAL H 1 6 VAL QG 3.500 . 3.500 1.919 1.762 2.450 0.038 4 0 "[ . ]" 1
41 1 6 VAL HA 1 7 GLU H 5.000 . 5.000 3.471 3.401 3.522 . 0 0 "[ . ]" 1
42 1 6 VAL HB 1 7 GLU HA 5.000 . 5.000 4.700 4.456 4.807 . 0 0 "[ . ]" 1
43 1 6 VAL HB 1 7 GLU H 5.000 . 5.000 3.756 2.550 4.175 . 0 0 "[ . ]" 1
44 1 6 VAL QG 1 7 GLU QG 5.000 . 5.000 3.726 2.800 4.665 . 0 0 "[ . ]" 1
45 1 6 VAL QG 1 7 GLU HA 5.000 . 5.000 3.125 2.996 3.307 . 0 0 "[ . ]" 1
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299 1 31 LEU HA 1 37 PHE QD 5.000 . 5.000 3.874 2.928 4.948 . 0 0 "[ . ]" 1
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301 1 31 LEU QD 1 37 PHE QD 5.000 . 5.000 3.699 2.468 4.397 . 0 0 "[ . ]" 1
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310 1 32 LYS H 1 33 GLY H 5.000 . 5.000 2.799 2.454 3.082 . 0 0 "[ . ]" 1
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1169 1 131 GLY QA 1 132 VAL QG 5.000 . 5.000 3.079 3.032 3.137 . 0 0 "[ . ]" 1
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1171 1 131 GLY H 1 132 VAL QG 5.000 . 5.000 4.745 4.646 4.892 . 0 0 "[ . ]" 1
1172 1 131 GLY H 1 132 VAL H 5.000 . 5.000 3.960 3.779 4.118 . 0 0 "[ . ]" 1
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1185 1 133 LEU H 1 134 MET H 5.000 . 5.000 4.378 4.308 4.432 . 0 0 "[ . ]" 1
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1193 1 134 MET H 1 135 PRO QD 5.000 . 5.000 4.074 3.921 4.386 . 0 0 "[ . ]" 1
1194 1 135 PRO QG 1 136 GLY QA 5.000 . 5.000 4.402 3.948 5.021 0.021 5 0 "[ . ]" 1
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save_
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loop_
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6 1 119 VAL N 1 126 ILE O 2.300 . 2.500 2.562 2.524 2.593 0.093 4 0 "[ . ]" 2
7 1 91 ALA H 1 99 LEU O 2.300 . 2.500 2.261 1.815 2.497 . 0 0 "[ . ]" 2
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28 1 39 VAL N 1 125 VAL O 3.300 2.500 3.500 3.392 3.380 3.415 . 0 0 "[ . ]" 2
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40 1 45 ALA O 1 49 ALA H 1.800 . 2.500 1.943 1.852 2.029 . 0 0 "[ . ]" 2
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48 1 63 ASN O 1 67 LEU H 1.800 . 2.500 2.032 1.866 2.278 . 0 0 "[ . ]" 2
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save_
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