NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | in_recoord | stage | program | type | subtype | subsubtype |
390617 | 1op1 | 5598 | cing | recoord | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1op1 save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 989 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 72 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 4.025 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.200 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0187 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0041 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0559 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 1 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 2 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 3 GLU 0.137 0.050 1 0 "[ ]" 1 4 PHE 0.165 0.050 1 0 "[ ]" 1 5 ARG 0.020 0.013 1 0 "[ ]" 1 6 MET 0.007 0.007 1 0 "[ ]" 1 7 GLU 0.024 0.024 1 0 "[ ]" 1 8 LYS 0.184 0.127 1 0 "[ ]" 1 9 LEU 0.184 0.127 1 0 "[ ]" 1 10 ASN 0.050 0.026 1 0 "[ ]" 1 11 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 12 LEU 0.040 0.040 1 0 "[ ]" 1 13 TRP 0.445 0.152 1 0 "[ ]" 1 14 GLU 0.128 0.070 1 0 "[ ]" 1 15 LYS 0.026 0.026 1 0 "[ ]" 1 16 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 17 GLN 0.017 0.017 1 0 "[ ]" 1 18 ARG 0.146 0.055 1 0 "[ ]" 1 19 LEU 0.158 0.060 1 0 "[ ]" 1 20 HIS 0.151 0.060 1 0 "[ ]" 1 21 LEU 0.152 0.152 1 0 "[ ]" 1 22 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 23 PRO 0.002 0.002 1 0 "[ ]" 1 24 VAL 0.324 0.194 1 0 "[ ]" 1 25 ARG 0.272 0.194 1 0 "[ ]" 1 26 LEU 0.120 0.069 1 0 "[ ]" 1 27 ALA 0.059 0.059 1 0 "[ ]" 1 28 GLU 0.042 0.042 1 0 "[ ]" 1 29 LEU 0.042 0.042 1 0 "[ ]" 1 30 HIS 0.167 0.069 1 0 "[ ]" 1 31 ALA 0.074 0.074 1 0 "[ ]" 1 32 ASP 0.074 0.074 1 0 "[ ]" 1 33 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 34 LYS 0.034 0.034 1 0 "[ ]" 1 35 ILE 0.048 0.048 1 0 "[ ]" 1 36 GLN 0.200 0.200 1 0 "[ ]" 1 37 GLU 0.034 0.034 1 0 "[ ]" 1 38 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 39 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 40 GLU 0.088 0.088 1 0 "[ ]" 1 41 LEU 0.246 0.098 1 0 "[ ]" 1 42 ALA 0.060 0.060 1 0 "[ ]" 1 43 TRP 0.209 0.064 1 0 "[ ]" 1 44 LYS 0.130 0.098 1 0 "[ ]" 1 45 LYS 0.153 0.085 1 0 "[ ]" 1 46 LEU 0.056 0.056 1 0 "[ ]" 1 47 LYS 0.067 0.056 1 0 "[ ]" 1 48 LEU 0.212 0.085 1 0 "[ ]" 1 49 ASP 0.059 0.059 1 0 "[ ]" 1 50 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 51 LEU 0.050 0.050 1 0 "[ ]" 1 52 ASP 0.164 0.064 1 0 "[ ]" 1 53 GLU 0.003 0.003 1 0 "[ ]" 1 54 ASP 0.042 0.039 1 0 "[ ]" 1 55 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 56 GLU 0.001 0.001 1 0 "[ ]" 1 57 LYS 0.065 0.064 1 0 "[ ]" 1 58 GLU 0.049 0.049 1 0 "[ ]" 1 59 ALA 0.104 0.104 1 0 "[ ]" 1 60 ARG 0.150 0.094 1 0 "[ ]" 1 61 LEU 0.311 0.200 1 0 "[ ]" 1 62 ILE 0.127 0.063 1 0 "[ ]" 1 63 ARG 0.371 0.156 1 0 "[ ]" 1 64 ASN 0.219 0.133 1 0 "[ ]" 1 65 LEU 0.143 0.086 1 0 "[ ]" 1 66 ASN 0.378 0.156 1 0 "[ ]" 1 67 VAL 0.056 0.056 1 0 "[ ]" 1 68 ILE 0.197 0.133 1 0 "[ ]" 1 69 LEU 0.102 0.087 1 0 "[ ]" 1 70 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 71 LYS 0.131 0.070 1 0 "[ ]" 1 72 TYR 0.085 0.070 1 0 "[ ]" 1 73 GLY 0.055 0.055 1 0 "[ ]" 1 74 LEU 0.009 0.009 1 0 "[ ]" 1 75 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 76 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 80 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 81 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 1 GLY QA 1 2 GLU H 2.500 . 3.900 2.840 2.840 2.840 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 2 GLU HA 1 3 GLU H 2.500 . 2.900 2.194 2.194 2.194 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 2 GLU QG 1 3 GLU H 4.000 . 6.000 4.168 4.168 4.168 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 2 GLU QB 1 3 GLU H 3.000 . 4.500 3.248 3.248 3.248 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 2 GLU H 1 3 GLU H 4.000 . 5.000 4.540 4.540 4.540 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 2 GLU QB 1 4 PHE H 4.000 . 6.000 2.787 2.787 2.787 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 2 GLU HA 1 4 PHE H 4.000 . 5.000 3.966 3.966 3.966 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 2 GLU QB 1 10 ASN QD 3.000 . 5.300 2.741 2.741 2.741 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 2 GLU QG 1 10 ASN QD 3.000 . 5.300 3.950 3.950 3.950 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 3 GLU HB3 1 4 PHE QD 4.000 . 7.400 4.749 4.749 4.749 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 3 GLU HB3 1 4 PHE H 4.000 . 6.000 3.993 3.993 3.993 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 3 GLU HA 1 4 PHE H 3.000 . 3.500 3.542 3.542 3.542 0.042 1 0 "[ ]" 1 13 1 3 GLU HB2 1 4 PHE H 3.000 . 3.500 3.518 3.518 3.518 0.018 1 0 "[ ]" 1 14 1 3 GLU QG 1 4 PHE H 4.000 . 6.000 1.750 1.750 1.750 0.050 1 0 "[ ]" 1 15 1 3 GLU H 1 10 ASN QD 4.000 . 6.000 5.319 5.319 5.319 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 3 GLU QG 1 13 TRP HD1 4.000 . 6.000 2.172 2.172 2.172 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 3 GLU HB3 1 13 TRP HD1 3.000 . 3.300 3.327 3.327 3.327 0.027 1 0 "[ ]" 1 18 1 3 GLU HB2 1 13 TRP HD1 4.000 . 5.000 4.104 4.104 4.104 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 3 GLU H 1 13 TRP HD1 5.000 . 6.000 4.164 4.164 4.164 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 3 GLU HB3 1 13 TRP HE1 4.000 . 5.000 2.936 2.936 2.936 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 3 GLU QG 1 13 TRP HE1 3.000 . 4.300 3.603 3.603 3.603 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 4 PHE HB3 1 4 PHE QD 2.500 . 5.100 2.614 2.614 2.614 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 4 PHE HA 1 4 PHE QD 2.500 . 5.100 2.410 2.410 2.410 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 4 PHE HB2 1 4 PHE QD 2.500 . 5.100 2.299 2.299 2.299 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 4 PHE HA 1 5 ARG HA 5.000 . 6.000 4.559 4.559 4.559 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 4 PHE HA 1 5 ARG QG 4.000 . 6.000 3.211 3.211 3.211 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 4 PHE HA 1 5 ARG H 2.500 . 2.900 2.913 2.913 2.913 0.013 1 0 "[ ]" 1 28 1 4 PHE HB2 1 5 ARG H 3.000 . 3.500 2.504 2.504 2.504 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 4 PHE H 1 5 ARG H 4.000 . 5.000 4.220 4.220 4.220 . 0 0 "[ ]" 1 30 1 4 PHE QD 1 5 ARG H 2.500 . 5.300 4.009 4.009 4.009 . 0 0 "[ ]" 1 31 1 4 PHE HB2 1 6 MET H 3.000 . 3.500 2.672 2.672 2.672 . 0 0 "[ ]" 1 32 1 4 PHE H 1 6 MET H 4.000 . 5.000 4.886 4.886 4.886 . 0 0 "[ ]" 1 33 1 4 PHE HB3 1 6 MET H 3.000 . 3.500 2.878 2.878 2.878 . 0 0 "[ ]" 1 34 1 4 PHE HA 1 6 MET H 4.000 . 5.000 4.464 4.464 4.464 . 0 0 "[ ]" 1 35 1 4 PHE QD 1 9 LEU QD 3.000 . 7.700 3.130 3.130 3.130 . 0 0 "[ ]" 1 36 1 4 PHE HB2 1 9 LEU HB2 5.000 . 6.000 3.042 3.042 3.042 . 0 0 "[ ]" 1 37 1 4 PHE HB3 1 9 LEU HB3 5.000 . 6.000 3.681 3.681 3.681 . 0 0 "[ ]" 1 38 1 4 PHE QD 1 9 LEU HB2 5.000 . 8.400 3.287 3.287 3.287 . 0 0 "[ ]" 1 39 1 4 PHE HB3 1 9 LEU HB2 5.000 . 6.000 3.620 3.620 3.620 . 0 0 "[ ]" 1 40 1 4 PHE HB2 1 9 LEU HB3 5.000 . 6.000 3.082 3.082 3.082 . 0 0 "[ ]" 1 41 1 4 PHE QD 1 10 ASN HA 4.000 . 7.400 2.921 2.921 2.921 . 0 0 "[ ]" 1 42 1 4 PHE HB3 1 10 ASN HA 5.000 . 6.000 5.892 5.892 5.892 . 0 0 "[ ]" 1 43 1 4 PHE QE 1 10 ASN HA 5.000 . 8.400 4.168 4.168 4.168 . 0 0 "[ ]" 1 44 1 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