NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | in_recoord | stage | program | type | subtype | subsubtype |
|
|
384722 |
1koy   |
cing | recoord | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1koy
save_distance_constraint_statistics_1
_Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 652
_Distance_constraint_stats_list.Viol_count 43
_Distance_constraint_stats_list.Viol_total 4.750
_Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.289
_Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0351
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0073
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.1105
_Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500
_Distance_constraint_stats_list.Details
;
Description of the tags in this list:
* 1 * Administrative tag
* 2 * Administrative tag
* 3 * Administrative tag
* 4 * ID of the restraint list.
* 5 * Number of restraints in list.
* 6 * Number of violated restraints (each model violation is used).
* 7 * Sum of violations in Angstrom.
* 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way.
* 9 * Rms of violations over all restraints.
* 10 * Average violation over all restraints.
* 11 * Average violation over violated restraints.
This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated.
These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998).
* 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table.
* 13 * This tag
Description of the tags in the per residue table below:
* 1 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 2 * Residue number
* 3 * Residue name
* 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging)
* 5 * Model number with the maximum violation
* 6 * Number of models with a violation above cutoff
* 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff.
An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest
violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff.
For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'.
For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1.
* 8 * Administrative tag
* 9 * Administrative tag
Description of the tags in the per restraint table below:
* 1 * Restraint ID within restraint list.
First node, FIRST member, first atom's:
* 2 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 3 * Residue number
* 4 * Residue name
* 5 * Name of (pseudo-)atom
First node, SECOND member, first atom's:
* 6 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 7 * Residue number
* 8 * Residue name
* 9 * Name of (pseudo-)atom
FIRST node's:
* 10 * Target distance value (Angstrom)
* 11 * Lower bound distance (Angstrom)
* 12 * Upper bound distance (Angstrom)
* 13 * Average distance in ensemble of models
* 14 * Minimum distance in ensemble of models
* 15 * Maximum distance in ensemble of models
* 16 * Maximum violation (without any averaging)
* 17 * Model number with the maximum violation
* 18 * Number of models with a violation above cutoff
* 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above.
* 20 * Administrative tag
* 21 * Administrative tag
;
loop_
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model
1 1 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 2 HIS 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 3 ILE 0.025 0.025 1 0 "[ ]"
1 4 LEU 0.086 0.051 1 0 "[ ]"
1 5 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 6 ALA 0.203 0.203 1 0 "[ ]"
1 7 LEU 0.100 0.051 1 0 "[ ]"
1 8 ARG 0.295 0.148 1 0 "[ ]"
1 9 GLU 0.140 0.140 1 0 "[ ]"
1 10 LYS 0.257 0.203 1 0 "[ ]"
1 11 GLN 0.039 0.039 1 0 "[ ]"
1 12 ALA 0.266 0.124 1 0 "[ ]"
1 13 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 14 GLU 0.276 0.160 1 0 "[ ]"
1 15 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 16 SER 0.124 0.124 1 0 "[ ]"
1 17 LEU 0.160 0.160 1 0 "[ ]"
1 18 SER 0.208 0.204 1 0 "[ ]"
1 19 SER 0.204 0.204 1 0 "[ ]"
1 20 GLN 0.137 0.137 1 0 "[ ]"
1 21 ASP 0.004 0.004 1 0 "[ ]"
1 22 LEU 0.071 0.071 1 0 "[ ]"
1 23 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 24 LEU 0.034 0.034 1 0 "[ ]"
1 25 VAL 0.263 0.137 1 0 "[ ]"
1 26 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 27 LYS 0.361 0.261 1 0 "[ ]"
1 28 GLU 0.034 0.034 1 0 "[ ]"
1 29 ASP 0.316 0.261 1 0 "[ ]"
1 30 PRO 0.001 0.001 1 0 "[ ]"
1 31 LYS 0.055 0.055 1 0 "[ ]"
1 32 ALA 0.172 0.172 1 0 "[ ]"
1 33 LEU 0.128 0.127 1 0 "[ ]"
1 34 ALA 0.172 0.172 1 0 "[ ]"
1 35 VAL 0.155 0.094 1 0 "[ ]"
1 36 ALA 0.274 0.148 1 0 "[ ]"
1 37 LEU 0.829 0.278 1 0 "[ ]"
1 38 ASN 0.610 0.278 1 0 "[ ]"
1 39 TRP 1.100 0.245 1 0 "[ ]"
1 40 ASP 0.145 0.091 1 0 "[ ]"
1 41 ILE 0.552 0.289 1 0 "[ ]"
1 42 LYS 0.264 0.264 1 0 "[ ]"
1 43 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 44 THR 0.678 0.289 1 0 "[ ]"
1 45 GLU 0.090 0.090 1 0 "[ ]"
1 46 THR 0.008 0.008 1 0 "[ ]"
1 47 VAL 0.186 0.132 1 0 "[ ]"
1 48 GLN 0.190 0.132 1 0 "[ ]"
1 49 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 50 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 51 CYS 0.039 0.039 1 0 "[ ]"
1 52 GLU 0.018 0.018 1 0 "[ ]"
1 53 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 54 GLU 0.027 0.027 1 0 "[ ]"
1 55 LEU 0.008 0.008 1 0 "[ ]"
1 56 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 57 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 58 ARG 0.008 0.008 1 0 "[ ]"
1 59 LEU 0.024 0.024 1 0 "[ ]"
1 60 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 61 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
1 62 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]"
stop_
loop_
_Distance_constraint_stats.Restraint_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_ID
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val
_Distance_constraint_stats.Distance_average
_Distance_constraint_stats.Distance_minimum
_Distance_constraint_stats.Distance_maximum
_Distance_constraint_stats.Max_violation
_Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model
_Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID
1 1 1 SER HA 1 3 ILE H 3.500 . 5.000 4.087 4.087 4.087 . 0 0 "[ ]" 1
2 1 1 SER HA 1 4 LEU H 3.500 . 5.000 3.176 3.176 3.176 . 0 0 "[ ]" 1
3 1 2 HIS HA 1 3 ILE H 3.500 . 4.000 3.504 3.504 3.504 . 0 0 "[ ]" 1
4 1 2 HIS HA 1 5 THR H 3.500 . 5.000 3.771 3.771 3.771 . 0 0 "[ ]" 1
5 1 2 HIS HA 1 5 THR HB 3.500 . 5.000 3.851 3.851 3.851 . 0 0 "[ ]" 1
6 1 2 HIS HA 1 6 ALA H 3.500 . 5.000 4.462 4.462 4.462 . 0 0 "[ ]" 1
7 1 2 HIS QB 1 5 THR HB 3.500 . 6.000 5.711 5.711 5.711 . 0 0 "[ ]" 1
8 1 3 ILE H 1 3 ILE HA 3.000 . 3.500 2.898 2.898 2.898 . 0 0 "[ ]" 1
9 1 3 ILE H 1 3 ILE HB 3.000 . 3.500 2.631 2.631 2.631 . 0 0 "[ ]" 1
10 1 3 ILE H 1 3 ILE MD 3.500 . 6.000 1.928 1.928 1.928 . 0 0 "[ ]" 1
11 1 3 ILE H 1 3 ILE QG 3.500 . 5.000 2.794 2.794 2.794 . 0 0 "[ ]" 1
12 1 3 ILE H 1 3 ILE MG 3.500 . 6.000 3.805 3.805 3.805 . 0 0 "[ ]" 1
13 1 3 ILE H 1 4 LEU H 3.500 . 4.000 2.312 2.312 2.312 . 0 0 "[ ]" 1
14 1 3 ILE H 1 5 THR H 3.500 . 5.000 3.927 3.927 3.927 . 0 0 "[ ]" 1
15 1 3 ILE HA 1 3 ILE MD 3.500 . 5.000 3.511 3.511 3.511 . 0 0 "[ ]" 1
16 1 3 ILE HA 1 3 ILE QG 3.500 . 6.000 2.426 2.426 2.426 . 0 0 "[ ]" 1
17 1 3 ILE HA 1 3 ILE MG 3.500 . 5.000 2.313 2.313 2.313 . 0 0 "[ ]" 1
18 1 3 ILE HA 1 4 LEU H 3.500 . 4.000 3.508 3.508 3.508 . 0 0 "[ ]" 1
19 1 3 ILE HA 1 4 LEU HA 3.500 . 5.000 4.768 4.768 4.768 . 0 0 "[ ]" 1
20 1 3 ILE HA 1 5 THR H 3.500 . 5.000 4.480 4.480 4.480 . 0 0 "[ ]" 1
21 1 3 ILE HA 1 6 ALA H 3.500 . 4.000 3.805 3.805 3.805 . 0 0 "[ ]" 1
22 1 3 ILE HA 1 6 ALA MB 3.500 . 6.000 3.112 3.112 3.112 . 0 0 "[ ]" 1
23 1 3 ILE HA 1 7 LEU H 3.500 . 5.000 4.315 4.315 4.315 . 0 0 "[ ]" 1
24 1 3 ILE HA 1 7 LEU QB 3.500 . 6.000 4.640 4.640 4.640 . 0 0 "[ ]" 1
25 1 3 ILE HB 1 3 ILE MD 3.500 . 6.000 2.114 2.114 2.114 . 0 0 "[ ]" 1
26 1 3 ILE QG 1 21 ASP QB 3.500 . 7.000 6.690 6.690 6.690 . 0 0 "[ ]" 1
27 1 3 ILE MG 1 25 VAL HB 3.500 . 6.000 6.025 6.025 6.025 0.025 1 0 "[ ]" 1
28 1 4 LEU H 1 4 LEU HA 3.000 . 3.500 2.828 2.828 2.828 . 0 0 "[ ]" 1
29 1 4 LEU H 1 4 LEU QB 3.000 . 4.500 2.051 2.051 2.051 . 0 0 "[ ]" 1
30 1 4 LEU H 1 4 LEU QD 3.500 . 5.000 3.539 3.539 3.539 . 0 0 "[ ]" 1
31 1 4 LEU H 1 4 LEU HG 3.500 . 4.000 4.036 4.036 4.036 0.036 1 0 "[ ]" 1
32 1 4 LEU H 1 5 THR H 3.500 . 4.000 2.640 2.640 2.640 . 0 0 "[ ]" 1
33 1 4 LEU H 1 7 LEU H 3.500 . 5.000 4.518 4.518 4.518 . 0 0 "[ ]" 1
34 1 4 LEU H 1 7 LEU QB 3.500 . 7.000 4.243 4.243 4.243 . 0 0 "[ ]" 1
35 1 4 LEU H 1 36 ALA MB 3.500 . 6.000 5.390 5.390 5.390 . 0 0 "[ ]" 1
36 1 4 LEU HA 1 4 LEU QD 3.500 . 5.000 2.834 2.834 2.834 . 0 0 "[ ]" 1
37 1 4 LEU HA 1 4 LEU HG 3.500 . 4.000 2.151 2.151 2.151 . 0 0 "[ ]" 1
38 1 4 LEU HA 1 7 LEU H 3.500 . 4.000 3.153 3.153 3.153 . 0 0 "[ ]" 1
39 1 4 LEU HA 1 7 LEU HA 3.500 . 5.000 4.897 4.897 4.897 . 0 0 "[ ]" 1
40 1 4 LEU HA 1 7 LEU QB 3.500 . 5.000 2.080 2.080 2.080 . 0 0 "[ ]" 1
41 1 4 LEU QB 1 5 THR H 3.500 . 6.000 2.676 2.676 2.676 . 0 0 "[ ]" 1
42 1 4 LEU QB 1 7 LEU HG 3.500 . 6.000 6.051 6.051 6.051 0.051 1 0 "[ ]" 1
43 1 4 LEU QD 1 7 LEU H 3.500 . 5.000 4.589 4.589 4.589 . 0 0 "[ ]" 1
44 1 4 LEU QD 1 37 LEU QD 3.500 . 7.000 3.856 3.856 3.856 . 0 0 "[ ]" 1
45 1 4 LEU QD 1 37 LEU HG 3.500 . 6.000 4.628 4.628 4.628 . 0 0 "[ ]" 1
46 1 5 THR H 1 5 THR HA 3.000 . 3.500 2.800 2.800 2.800 . 0 0 "[ ]" 1
47 1 5 THR H 1 5 THR HB 3.000 . 3.500 2.518 2.518 2.518 . 0 0 "[ ]" 1
48 1 5 THR H 1 5 THR HG1 3.500 . 6.000 2.111 2.111 2.111 . 0 0 "[ ]" 1
49 1 5 THR H 1 6 ALA H 3.500 . 4.000 2.736 2.736 2.736 . 0 0 "[ ]" 1
50 1 5 THR H 1 6 ALA MB 3.500 . 6.000 4.334 4.334 4.334 . 0 0 "[ ]" 1
51 1 5 THR H 1 8 ARG H 3.500 . 5.000 4.690 4.690 4.690 . 0 0 "[ ]" 1
52 1 5 THR HA 1 5 THR HB 3.000 . 3.500 2.462 2.462 2.462 . 0 0 "[ ]" 1
53 1 5 THR HA 1 6 ALA H 3.500 . 5.000 3.533 3.533 3.533 . 0 0 "[ ]" 1
54 1 5 THR HA 1 8 ARG H 3.500 . 5.000 3.681 3.681 3.681 . 0 0 "[ ]" 1
55 1 5 THR HB 1 6 ALA H 3.500 . 5.000 3.820 3.820 3.820 . 0 0 "[ ]" 1
56 1 6 ALA H 1 6 ALA HA 3.000 . 3.500 2.839 2.839 2.839 . 0 0 "[ ]" 1
57 1 6 ALA H 1 6 ALA MB 3.000 . 4.500 2.088 2.088 2.088 . 0 0 "[ ]" 1
58 1 6 ALA H 1 7 LEU H 3.500 . 5.000 2.487 2.487 2.487 . 0 0 "[ ]" 1
59 1 6 ALA H 1 8 ARG H 3.500 . 5.000 4.244 4.244 4.244 . 0 0 "[ ]" 1
60 1 6 ALA H 1 9 GLU H 3.500 . 5.000 4.740 4.740 4.740 . 0 0 "[ ]" 1
61 1 6 ALA H 1 10 LYS H 3.500 . 5.000 5.203 5.203 5.203 0.203 1 0 "[ ]" 1
62 1 6 ALA HA 1 7 LEU H 3.500 . 4.000 3.519 3.519 3.519 . 0 0 "[ ]" 1
63 1 6 ALA MB 1 7 LEU H 3.500 . 6.000 2.884 2.884 2.884 . 0 0 "[ ]" 1
64 1 6 ALA MB 1 7 LEU QD 3.500 . 6.000 4.440 4.440 4.440 . 0 0 "[ ]" 1
65 1 7 LEU H 1 7 LEU HA 3.000 . 3.500 2.839 2.839 2.839 . 0 0 "[ ]" 1
66 1 7 LEU H 1 7 LEU QB 3.000 . 3.500 2.035 2.035 2.035 . 0 0 "[ ]" 1
67 1 7 LEU H 1 7 LEU MD1 3.500 . 5.000 4.210 4.210 4.210 . 0 0 "[ ]" 1
68 1 7 LEU H 1 7 LEU MD2 3.500 . 5.000 4.045 4.045 4.045 . 0 0 "[ ]" 1
69 1 7 LEU H 1 7 LEU HG 3.500 . 4.000 3.708 3.708 3.708 . 0 0 "[ ]" 1
70 1 7 LEU H 1 8 ARG H 3.500 . 4.000 2.582 2.582 2.582 . 0 0 "[ ]" 1
71 1 7 LEU H 1 9 GLU H 3.500 . 5.000 3.645 3.645 3.645 . 0 0 "[ ]" 1
72 1 7 LEU H 1 37 LEU QD 3.500 . 6.000 4.792 4.792 4.792 . 0 0 "[ ]" 1
73 1 7 LEU HA 1 7 LEU MD1 3.000 . 4.500 3.755 3.755 3.755 . 0 0 "[ ]" 1
74 1 7 LEU HA 1 7 LEU MD2 3.000 . 4.500 2.009 2.009 2.009 . 0 0 "[ ]" 1
75 1 7 LEU HA 1 7 LEU HG 3.500 . 4.000 2.778 2.778 2.778 . 0 0 "[ ]" 1
76 1 7 LEU HA 1 8 ARG H 3.500 . 5.000 3.535 3.535 3.535 . 0 0 "[ ]" 1
77 1 7 LEU QB 1 13 PRO QD 3.500 . 7.000 6.672 6.672 6.672 . 0 0 "[ ]" 1
78 1 7 LEU QB 1 37 LEU HG 3.500 . 6.000 2.575 2.575 2.575 . 0 0 "[ ]" 1
79 1 7 LEU QD 1 13 PRO HA 3.500 . 6.000 5.466 5.466 5.466 . 0 0 "[ ]" 1
80 1 7 LEU QD 1 13 PRO QB 3.500 . 7.000 3.865 3.865 3.865 . 0 0 "[ ]" 1
81 1 7 LEU QD 1 13 PRO QD 3.500 . 7.000 3.889 3.889 3.889 . 0 0 "[ ]" 1
82 1 7 LEU QD 1 13 PRO QG 3.500 . 7.000 2.910 2.910 2.910 . 0 0 "[ ]" 1
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