NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
377948 | 1gjt | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1gjt save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 736 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 39 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 4.030 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.316 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0312 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0055 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.1033 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 4 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 5 PHE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 6 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 7 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 12 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 13 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 14 ALA 0.124 0.124 1 0 "[ ]" 1 15 VAL 0.124 0.124 1 0 "[ ]" 1 16 ASP 0.048 0.048 1 0 "[ ]" 1 17 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 18 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 19 SER 0.121 0.073 1 0 "[ ]" 1 20 LEU 0.082 0.037 1 0 "[ ]" 1 21 ALA 0.237 0.133 1 0 "[ ]" 1 22 GLU 0.310 0.156 1 0 "[ ]" 1 23 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 24 LYS 0.344 0.126 1 0 "[ ]" 1 25 VAL 0.156 0.156 1 0 "[ ]" 1 26 LEU 0.081 0.081 1 0 "[ ]" 1 27 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 28 ASN 0.059 0.024 1 0 "[ ]" 1 29 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 30 GLU 0.302 0.256 1 0 "[ ]" 1 31 LEU 0.438 0.316 1 0 "[ ]" 1 32 ASP 0.316 0.316 1 0 "[ ]" 1 33 LYS 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 34 TYR 0.311 0.256 1 0 "[ ]" 1 35 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 36 VAL 0.078 0.055 1 0 "[ ]" 1 37 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 38 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 39 TYR 0.120 0.120 1 0 "[ ]" 1 40 TYR 0.120 0.120 1 0 "[ ]" 1 41 LYS 0.572 0.309 1 0 "[ ]" 1 42 ASN 0.640 0.309 1 0 "[ ]" 1 43 LEU 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 44 ILE 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 45 ASN 0.109 0.085 1 0 "[ ]" 1 46 ASN 0.036 0.036 1 0 "[ ]" 1 47 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 48 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 49 THR 0.018 0.018 1 0 "[ ]" 1 50 VAL 0.126 0.126 1 0 "[ ]" 1 51 GLU 0.038 0.038 1 0 "[ ]" 1 52 GLY 0.055 0.038 1 0 "[ ]" 1 53 VAL 0.307 0.126 1 0 "[ ]" 1 54 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 55 ALA 0.146 0.146 1 0 "[ ]" 1 56 LEU 0.521 0.281 1 0 "[ ]" 1 57 ILE 0.343 0.261 1 0 "[ ]" 1 58 ASP 0.204 0.204 1 0 "[ ]" 1 59 GLU 0.786 0.281 1 0 "[ ]" 1 60 ILE 0.327 0.199 1 0 "[ ]" 1 61 LEU 0.292 0.261 1 0 "[ ]" 1 62 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 63 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 64 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 65 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 4 ILE H 1 4 ILE HB 4.000 . 5.000 2.458 2.458 2.458 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 4 ILE HA 1 5 PHE H 4.000 . 5.000 2.253 2.253 2.253 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 5 PHE HA 1 6 VAL H 4.000 . 5.000 2.258 2.258 2.258 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 6 VAL H 1 6 VAL HB 4.000 . 5.000 2.290 2.290 2.290 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 6 VAL H 1 6 VAL QG 4.000 . 5.500 2.496 2.496 2.496 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 6 VAL HA 1 6 VAL QG 3.000 . 3.800 2.232 2.232 2.232 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 6 VAL HA 1 7 LEU H 4.000 . 5.000 3.039 3.039 3.039 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 7 LEU HA 1 7 LEU QD 4.000 . 5.500 1.985 1.985 1.985 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 7 LEU HA 1 7 LEU HG 4.000 . 5.000 3.700 3.700 3.700 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 12 ASP HA 1 13 GLU H 4.000 . 5.000 2.541 2.541 2.541 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 13 GLU H 1 13 GLU QG 4.000 . 5.000 2.475 2.475 2.475 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 13 GLU HA 1 14 ALA H 4.000 . 5.000 2.989 2.989 2.989 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 14 ALA H 1 14 ALA MB 3.000 . 3.800 2.258 2.258 2.258 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 14 ALA HA 1 15 VAL H 3.000 . 3.300 3.424 3.424 3.424 0.124 1 0 "[ ]" 1 15 1 15 VAL H 1 15 VAL HB 4.000 . 5.000 2.562 2.562 2.562 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 15 VAL H 1 15 VAL QG 4.000 . 5.500 2.203 2.203 2.203 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 15 VAL HA 1 15 VAL QG 3.000 . 3.800 2.085 2.085 2.085 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 15 VAL HA 1 16 ASP H 4.000 . 5.000 2.220 2.220 2.220 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 15 VAL HB 1 16 ASP H 4.000 . 5.000 4.373 4.373 4.373 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 15 VAL QG 1 16 ASP H 4.000 . 5.500 3.120 3.120 3.120 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 16 ASP QB 1 19 SER QB 4.000 . 5.000 5.048 5.048 5.048 0.048 1 0 "[ ]" 1 22 1 17 ALA HA 1 20 LEU QB 4.000 . 5.000 2.621 2.621 2.621 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 18 ASN HA 1 21 ALA MB 3.000 . 3.300 3.042 3.042 3.042 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 18 ASN QB 1 19 SER H 4.000 . 5.000 2.535 2.535 2.535 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 18 ASN QB 1 19 SER HA 4.000 . 5.000 4.169 4.169 4.169 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 18 ASN QB 1 21 ALA MB 4.000 . 5.500 4.678 4.678 4.678 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 18 ASN QD 1 22 GLU H 4.000 . 5.000 4.782 4.782 4.782 . 0 0 "[ ]" 1 28 1 19 SER HA 1 19 SER QB 2.500 . 2.700 2.194 2.194 2.194 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 19 SER HA 1 22 GLU H 4.000 . 5.000 3.558 3.558 3.558 . 0 0 "[ ]" 1 30 1 19 SER HA 1 22 GLU QB 4.000 . 5.000 2.792 2.792 2.792 . 0 0 "[ ]" 1 31 1 19 SER HA 1 22 GLU QG 4.000 . 5.000 4.851 4.851 4.851 . 0 0 "[ ]" 1 32 1 19 SER QB 1 22 GLU H 4.000 . 5.000 5.073 5.073 5.073 0.073 1 0 "[ ]" 1 33 1 19 SER QB 1 22 GLU QB 4.000 . 5.000 4.252 4.252 4.252 . 0 0 "[ ]" 1 34 1 19 SER QB 1 50 VAL QG 4.000 . 5.500 3.731 3.731 3.731 . 0 0 "[ ]" 1 35 1 20 LEU HA 1 20 LEU QD 4.000 . 5.000 2.246 2.246 2.246 . 0 0 "[ ]" 1 36 1 20 LEU HA 1 20 LEU HG 4.000 . 5.000 2.557 2.557 2.557 . 0 0 "[ ]" 1 37 1 20 LEU HA 1 21 ALA H 4.000 . 5.000 3.571 3.571 3.571 . 0 0 "[ ]" 1 38 1 20 LEU HA 1 23 ALA MB 4.000 . 5.500 2.651 2.651 2.651 . 0 0 "[ ]" 1 39 1 20 LEU HA 1 50 VAL HA 4.000 . 5.000 4.926 4.926 4.926 . 0 0 "[ ]" 1 40 1 20 LEU HA 1 50 VAL QG 3.000 . 3.800 2.626 2.626 2.626 . 0 0 "[ ]" 1 41 1 20 LEU QB 1 20 LEU QD 2.500 . 2.700 1.930 1.930 1.930 . 0 0 "[ ]" 1 42 1 20 LEU QB 1 21 ALA H 3.000 . 3.300 2.464 2.464 2.464 . 0 0 "[ ]" 1 43 1 20 LEU QB 1 21 ALA HA 4.000 . 5.000 3.858 3.858 3.858 . 0 0 "[ ]" 1 44 1 20 LEU QB 1 22 GLU H 4.000 . 5.000 4.792 4.792 4.792 . 0 0 "[ ]" 1 45 1 20 LEU QB 1 50 VAL QG 4.000 . 5.500 3.866 3.866 3.866 . 0 0 "[ ]" 1 46 1 20 LEU QD 1 21 ALA H 4.000 . 5.500 4.015 4.015 4.015 . 0 0 "[ ]" 1 47 1 20 LEU QD 1 23 ALA MB 4.000 . 6.000 3.608 3.608 3.608 . 0 0 "[ ]" 1 48 1 20 LEU QD 1 24 LYS H 4.000 . 5.500 4.989 4.989 4.989 . 0 0 "[ ]" 1 49 1 20 LEU QD 1 24 LYS QD 4.000 . 5.500 4.379 4.379 4.379 . 0 0 "[ ]" 1 50 1 20 LEU QD 1 24 LYS QE 4.000 . 5.500 2.840 2.840 2.840 . 0 0 "[ ]" 1 51 1 20 LEU QD 1 24 LYS QG . . 3.800 3.825 3.825 3.825 0.025 1 0 "[ ]" 1 52 1 20 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