NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | in_recoord | stage | program | type | subtype | subsubtype |
377656 | 1gd3 | 4827 | cing | recoord | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1gd3 save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1761 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 209 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 22.895 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.484 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0499 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0130 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.1095 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 3 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 4 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 5 GLY 0.019 0.019 1 0 "[ ]" 1 6 LEU 0.034 0.034 1 0 "[ ]" 1 7 SER 0.624 0.314 1 0 "[ ]" 1 8 GLU 0.683 0.348 1 0 "[ ]" 1 9 ALA 0.573 0.348 1 0 "[ ]" 1 10 LYS 0.095 0.081 1 0 "[ ]" 1 11 PRO 0.077 0.077 1 0 "[ ]" 1 12 ALA 0.077 0.077 1 0 "[ ]" 1 13 THR 0.001 0.001 1 0 "[ ]" 1 14 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 15 GLU 0.751 0.300 1 0 "[ ]" 1 16 ILE 0.702 0.268 1 0 "[ ]" 1 17 GLN 0.438 0.266 1 0 "[ ]" 1 18 GLU 0.770 0.275 1 0 "[ ]" 1 19 ILE 0.435 0.167 1 0 "[ ]" 1 20 VAL 0.316 0.154 1 0 "[ ]" 1 21 ASP 0.913 0.352 1 0 "[ ]" 1 22 LYS 0.950 0.384 1 0 "[ ]" 1 23 VAL 0.477 0.214 1 0 "[ ]" 1 24 LYS 0.512 0.384 1 0 "[ ]" 1 25 PRO 0.330 0.330 1 0 "[ ]" 1 26 GLN 0.709 0.330 1 0 "[ ]" 1 27 LEU 0.161 0.047 1 0 "[ ]" 1 28 GLU 0.780 0.391 1 0 "[ ]" 1 29 GLU 0.236 0.126 1 0 "[ ]" 1 30 LYS 0.679 0.337 1 0 "[ ]" 1 31 THR 0.324 0.138 1 0 "[ ]" 1 32 ASN 0.884 0.328 1 0 "[ ]" 1 33 GLU 0.484 0.328 1 0 "[ ]" 1 34 THR 0.034 0.025 1 0 "[ ]" 1 35 TYR 0.149 0.076 1 0 "[ ]" 1 36 GLY 0.431 0.272 1 0 "[ ]" 1 37 LYS 0.272 0.272 1 0 "[ ]" 1 38 LEU 0.471 0.146 1 0 "[ ]" 1 39 GLU 0.455 0.232 1 0 "[ ]" 1 40 ALA 0.094 0.090 1 0 "[ ]" 1 41 VAL 0.023 0.015 1 0 "[ ]" 1 42 GLN 0.128 0.090 1 0 "[ ]" 1 43 TYR 0.208 0.174 1 0 "[ ]" 1 44 LYS 0.513 0.239 1 0 "[ ]" 1 45 THR 0.114 0.114 1 0 "[ ]" 1 46 GLN 0.655 0.239 1 0 "[ ]" 1 47 VAL 0.157 0.075 1 0 "[ ]" 1 48 VAL 0.501 0.252 1 0 "[ ]" 1 49 ALA 0.436 0.252 1 0 "[ ]" 1 50 GLY 0.466 0.323 1 0 "[ ]" 1 51 THR 0.493 0.323 1 0 "[ ]" 1 52 ASN 0.223 0.071 1 0 "[ ]" 1 53 TYR 0.476 0.172 1 0 "[ ]" 1 54 TYR 0.147 0.147 1 0 "[ ]" 1 55 ILE 0.293 0.173 1 0 "[ ]" 1 56 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 VAL 0.325 0.187 1 0 "[ ]" 1 58 ARG 0.688 0.271 1 0 "[ ]" 1 59 ALA 0.763 0.271 1 0 "[ ]" 1 60 GLY 0.720 0.484 1 0 "[ ]" 1 61 ASP 0.695 0.484 1 0 "[ ]" 1 62 ASN 0.667 0.221 1 0 "[ ]" 1 63 LYS 0.410 0.117 1 0 "[ ]" 1 64 TYR 0.566 0.205 1 0 "[ ]" 1 65 LEU 0.629 0.159 1 0 "[ ]" 1 66 HIS 0.321 0.159 1 0 "[ ]" 1 67 LEU 1.366 0.470 1 0 "[ ]" 1 68 LYS 0.697 0.196 1 0 "[ ]" 1 69 VAL 0.056 0.033 1 0 "[ ]" 1 70 PHE 0.069 0.069 1 0 "[ ]" 1 71 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 72 SER 0.273 0.273 1 0 "[ ]" 1 73 LEU 0.735 0.273 1 0 "[ ]" 1 74 PRO 0.437 0.311 1 0 "[ ]" 1 75 GLY 0.589 0.311 1 0 "[ ]" 1 76 GLN 0.406 0.198 1 0 "[ ]" 1 77 ASN 0.455 0.152 1 0 "[ ]" 1 78 GLU 1.100 0.362 1 0 "[ ]" 1 79 ASP 0.846 0.362 1 0 "[ ]" 1 80 LEU 0.181 0.094 1 0 "[ ]" 1 81 VAL 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 82 LEU 0.274 0.094 1 0 "[ ]" 1 83 THR 0.242 0.101 1 0 "[ ]" 1 84 GLY 0.454 0.183 1 0 "[ ]" 1 85 TYR 0.536 0.204 1 0 "[ ]" 1 86 GLN 0.628 0.470 1 0 "[ ]" 1 87 VAL 0.690 0.250 1 0 "[ ]" 1 88 ASP 0.561 0.250 1 0 "[ ]" 1 89 LYS 0.098 0.064 1 0 "[ ]" 1 90 ASN 0.037 0.035 1 0 "[ ]" 1 91 LYS 0.075 0.046 1 0 "[ ]" 1 92 ASP 0.382 0.333 1 0 "[ ]" 1 93 ASP 0.339 0.328 1 0 "[ ]" 1 94 GLU 0.028 0.022 1 0 "[ ]" 1 95 LEU 0.106 0.058 1 0 "[ ]" 1 96 THR 0.089 0.049 1 0 "[ ]" 1 97 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 98 PHE 0.042 0.042 1 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 3 PRO HA 1 4 GLY H 2.700 . 2.900 2.608 2.608 2.608 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 3 PRO HB2 1 4 GLY H 4.000 . 5.000 2.308 2.308 2.308 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 3 PRO HB3 1 4 GLY H 4.000 . 5.000 3.371 3.371 3.371 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 3 PRO QB 1 4 GLY H 4.000 . 6.000 2.270 2.270 2.270 . 0 0 "[ ]" 1 5 1 4 GLY H 1 5 GLY H 3.000 . 3.500 3.338 3.338 3.338 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 4 GLY H 1 5 GLY QA 4.000 . 6.000 4.133 4.133 4.133 . 0 0 "[ ]" 1 7 1 5 GLY H 1 5 GLY HA2 2.700 . 2.900 2.745 2.745 2.745 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 5 GLY H 1 5 GLY HA3 2.700 . 2.900 2.919 2.919 2.919 0.019 1 0 "[ ]" 1 9 1 5 GLY HA2 1 6 LEU H 2.700 . 2.900 2.805 2.805 2.805 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 5 GLY HA3 1 6 LEU H 2.700 . 2.900 2.450 2.450 2.450 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 5 GLY QA 1 6 LEU H 2.700 . 3.900 2.305 2.305 2.305 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 5 GLY QA 1 46 GLN QE 5.000 . 8.000 5.997 5.997 5.997 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 6 LEU H 1 6 LEU HB2 2.700 . 2.900 2.154 2.154 2.154 . 0 0 "[ ]" 1 14 1 6 LEU H 1 6 LEU HB3 3.000 . 3.500 3.490 3.490 3.490 . 0 0 "[ ]" 1 15 1 6 LEU H 1 6 LEU HG 2.700 . 2.900 2.671 2.671 2.671 . 0 0 "[ ]" 1 16 1 6 LEU H 1 6 LEU MD1 5.000 . 8.500 3.339 3.339 3.339 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 6 LEU H 1 6 LEU MD2 5.000 . 8.500 3.908 3.908 3.908 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 6 LEU H 1 6 LEU QD 4.000 . 7.500 3.161 3.161 3.161 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 6 LEU H 1 7 SER H 4.000 . 5.000 4.559 4.559 4.559 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 6 LEU H 1 46 GLN QE 5.000 . 7.000 6.098 6.098 6.098 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 6 LEU HA 1 6 LEU HB3 2.700 . 2.900 2.610 2.610 2.610 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 6 LEU HA 1 7 SER H 2.700 . 2.900 2.640 2.640 2.640 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 6 LEU HB2 1 7 SER H 3.000 . 3.500 3.534 3.534 3.534 0.034 1 0 "[ ]" 1 24 1 6 LEU HB2 1 45 THR H 5.000 . 7.000 6.800 6.800 6.800 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 6 LEU HB3 1 7 SER H 3.000 . 3.500 2.158 2.158 2.158 . 0 0 "[ ]" 1 26 1 6 LEU HG 1 7 SER H 4.000 . 5.000 4.483 4.483 4.483 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 6 LEU MD1 1 7 SER H 5.000 . 8.500 4.308 4.308 4.308 . 0 0 "[ ]" 1 28 1 6 LEU MD1 1 46 GLN HE21 5.000 . 8.500 5.531 5.531 5.531 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 6 LEU MD1 1 46 GLN HE22 5.000 . 8.500 6.120 6.120 6.120 . 0 0 "[ ]" 1 30 1 6 LEU MD1 1 54 TYR QD 5.000 . 10.500 3.497 3.497 3.497 . 0 0 "[ ]" 1 31 1 6 LEU MD1 1 54 TYR QE 5.000 . 11.500 3.441 3.441 3.441 . 0 0 "[ ]" 1 32 1 6 LEU MD1 1 97 GLY H 4.000 . 6.500 4.197 4.197 4.197 . 0 0 "[ ]" 1 33 1 6 LEU MD1 1 98 PHE H 5.000 . 8.500 4.751 4.751 4.751 . 0 0 "[ ]" 1 34 1 6 LEU MD2 1 7 SER H 5.000 . 8.500 2.927 2.927 2.927 . 0 0 "[ ]" 1 35 1 6 LEU MD2 1 46 GLN HE21 5.000 . 8.500 2.821 2.821 2.821 . 0 0 "[ ]" 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