NMR Restraints Grid |
Result table
image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
376965 | 1fyc | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_1fyc save_distance_constraint_statistics_1 _Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics _Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1 _Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 691 _Distance_constraint_stats_list.Viol_count 48 _Distance_constraint_stats_list.Viol_total 2.289 _Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.197 _Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0172 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0033 _Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0477 _Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500 _Distance_constraint_stats_list.Details ; Description of the tags in this list: * 1 * Administrative tag * 2 * Administrative tag * 3 * Administrative tag * 4 * ID of the restraint list. * 5 * Number of restraints in list. * 6 * Number of violated restraints (each model violation is used). * 7 * Sum of violations in Angstrom. * 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way. * 9 * Rms of violations over all restraints. * 10 * Average violation over all restraints. * 11 * Average violation over violated restraints. This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated. These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998). * 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table. * 13 * This tag Description of the tags in the per residue table below: * 1 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 2 * Residue number * 3 * Residue name * 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging) * 5 * Model number with the maximum violation * 6 * Number of models with a violation above cutoff * 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff. An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff. For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'. For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1. * 8 * Administrative tag * 9 * Administrative tag Description of the tags in the per restraint table below: * 1 * Restraint ID within restraint list. First node, FIRST member, first atom's: * 2 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 3 * Residue number * 4 * Residue name * 5 * Name of (pseudo-)atom First node, SECOND member, first atom's: * 6 * Chain identifier (can be absent if none defined) * 7 * Residue number * 8 * Residue name * 9 * Name of (pseudo-)atom FIRST node's: * 10 * Target distance value (Angstrom) * 11 * Lower bound distance (Angstrom) * 12 * Upper bound distance (Angstrom) * 13 * Average distance in ensemble of models * 14 * Minimum distance in ensemble of models * 15 * Maximum distance in ensemble of models * 16 * Maximum violation (without any averaging) * 17 * Model number with the maximum violation * 18 * Number of models with a violation above cutoff * 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above. * 20 * Administrative tag * 21 * Administrative tag ; loop_ _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID _Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation _Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count _Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model 1 4 MET 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 9 HIS 0.044 0.040 1 0 "[ ]" 1 10 MET 0.268 0.197 1 0 "[ ]" 1 11 GLN 0.233 0.131 1 0 "[ ]" 1 12 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 13 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 14 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 15 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 16 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 17 LEU 0.024 0.024 1 0 "[ ]" 1 18 SER 0.046 0.046 1 0 "[ ]" 1 20 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 21 MET 0.059 0.046 1 0 "[ ]" 1 22 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 23 MET 0.015 0.015 1 0 "[ ]" 1 24 GLY 0.014 0.007 1 0 "[ ]" 1 25 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 26 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 27 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 28 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 29 TRP 0.857 0.151 1 0 "[ ]" 1 30 GLU 0.011 0.011 1 0 "[ ]" 1 31 LYS 0.127 0.097 1 0 "[ ]" 1 32 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 33 VAL 0.215 0.139 1 0 "[ ]" 1 34 GLY 0.077 0.077 1 0 "[ ]" 1 35 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 36 LYS 0.102 0.102 1 0 "[ ]" 1 37 LEU 0.043 0.031 1 0 "[ ]" 1 38 SER 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 39 GLU 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 40 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 41 ASP 0.005 0.005 1 0 "[ ]" 1 42 LEU 0.054 0.043 1 0 "[ ]" 1 43 LEU 0.045 0.022 1 0 "[ ]" 1 44 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 45 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 46 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 47 GLU 0.019 0.013 1 0 "[ ]" 1 48 THR 0.036 0.036 1 0 "[ ]" 1 49 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 50 LYS 0.036 0.036 1 0 "[ ]" 1 51 ALA 0.019 0.013 1 0 "[ ]" 1 52 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 53 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 54 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 55 PHE 0.026 0.022 1 0 "[ ]" 1 56 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 57 VAL 0.083 0.043 1 0 "[ ]" 1 58 GLN 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 59 GLU 0.000 0.000 1 0 "[ ]" 1 60 GLU 0.058 0.031 1 0 "[ ]" 1 61 GLY 0.103 0.091 1 0 "[ ]" 1 62 TYR 0.102 0.102 1 0 "[ ]" 1 63 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 64 ALA 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 65 LYS 0.046 0.026 1 0 "[ ]" 1 66 ILE 0.470 0.151 1 0 "[ ]" 1 67 LEU 0.026 0.026 1 0 "[ ]" 1 68 VAL 0.033 0.030 1 0 "[ ]" 1 69 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 70 GLU 0.101 0.056 1 0 "[ ]" 1 71 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 72 THR 0.003 0.003 1 0 "[ ]" 1 73 ARG 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 74 ASP 0.072 0.057 1 0 "[ ]" 1 75 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 76 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 77 LEU 0.024 0.024 1 0 "[ ]" 1 78 GLY 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 79 THR 0.057 0.057 1 0 "[ ]" 1 80 PRO 0.273 0.131 1 0 "[ ]" 1 81 LEU 0.128 0.088 1 0 "[ ]" 1 82 CYS 0.133 0.080 1 0 "[ ]" 1 83 ILE 0.287 0.197 1 0 "[ ]" 1 84 ILE 0.044 0.040 1 0 "[ ]" 1 85 VAL 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 86 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 87 LYS 0.012 0.012 1 0 "[ ]" 1 88 GLU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 91 ILE 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 100 THR 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 105 LEU 0.000 0.000 . 0 "[ ]" 1 106 LYS 0.000 0.000 . 0 "[ ]" stop_ loop_ _Distance_constraint_stats.Restraint_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_1_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID _Distance_constraint_stats.Atom_2_ID _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val _Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val _Distance_constraint_stats.Distance_average _Distance_constraint_stats.Distance_minimum _Distance_constraint_stats.Distance_maximum _Distance_constraint_stats.Max_violation _Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count _Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model _Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID 1 1 4 MET H 1 4 MET QG 4.000 . 6.000 2.048 2.048 2.048 . 0 0 "[ ]" 1 2 1 4 MET HA 1 4 MET QG 3.000 . 4.300 3.260 3.260 3.260 . 0 0 "[ ]" 1 3 1 9 HIS H 1 10 MET H 5.000 . 6.000 3.073 3.073 3.073 . 0 0 "[ ]" 1 4 1 9 HIS H 1 84 ILE HB 5.000 . 6.000 6.004 6.004 6.004 0.004 1 0 "[ ]" 1 5 1 9 HIS HA 1 10 MET H 5.000 . 6.000 2.352 2.352 2.352 . 0 0 "[ ]" 1 6 1 9 HIS HA 1 84 ILE HB 5.000 . 6.000 6.040 6.040 6.040 0.040 1 0 "[ ]" 1 7 1 9 HIS HA 1 85 VAL HA 5.000 . 6.000 4.681 4.681 4.681 . 0 0 "[ ]" 1 8 1 9 HIS HB2 1 9 HIS HE1 5.000 . 6.000 4.760 4.760 4.760 . 0 0 "[ ]" 1 9 1 9 HIS HB3 1 9 HIS HE1 5.000 . 6.000 5.284 5.284 5.284 . 0 0 "[ ]" 1 10 1 10 MET H 1 83 ILE HA 5.000 . 6.000 4.324 4.324 4.324 . 0 0 "[ ]" 1 11 1 10 MET H 1 84 ILE H 5.000 . 6.000 3.399 3.399 3.399 . 0 0 "[ ]" 1 12 1 10 MET HA 1 11 GLN H 5.000 . 6.000 2.318 2.318 2.318 . 0 0 "[ ]" 1 13 1 10 MET HB2 1 83 ILE HA 3.000 . 3.300 3.497 3.497 3.497 0.197 1 0 "[ ]" 1 14 1 10 MET HB2 1 84 ILE H 5.000 . 6.000 1.777 1.777 1.777 . 0 0 "[ ]" 1 15 1 10 MET HB3 1 83 ILE HA 3.000 . 3.300 3.371 3.371 3.371 0.071 1 0 "[ ]" 1 16 1 10 MET HB3 1 84 ILE H 5.000 . 6.000 2.117 2.117 2.117 . 0 0 "[ ]" 1 17 1 10 MET QG 1 57 VAL HA 3.000 . 4.300 3.786 3.786 3.786 . 0 0 "[ ]" 1 18 1 10 MET QG 1 57 VAL QG 5.000 . 6.000 2.801 2.801 2.801 . 0 0 "[ ]" 1 19 1 11 GLN H 1 11 GLN HB3 4.000 . 5.000 3.593 3.593 3.593 . 0 0 "[ ]" 1 20 1 11 GLN HA 1 12 VAL H 4.000 . 5.000 2.168 2.168 2.168 . 0 0 "[ ]" 1 21 1 11 GLN HA 1 80 PRO QG 5.000 . 8.500 7.678 7.678 7.678 . 0 0 "[ ]" 1 22 1 11 GLN HA 1 82 CYS H 5.000 . 6.500 6.424 6.424 6.424 . 0 0 "[ ]" 1 23 1 11 GLN HA 1 83 ILE HA 5.000 . 6.000 4.167 4.167 4.167 . 0 0 "[ ]" 1 24 1 11 GLN HA 1 84 ILE H 5.000 . 6.000 5.440 5.440 5.440 . 0 0 "[ ]" 1 25 1 11 GLN HB2 1 80 PRO HA 4.000 . 5.500 5.631 5.631 5.631 0.131 1 0 "[ ]" 1 26 1 11 GLN HB3 1 12 VAL H 5.000 . 6.000 3.222 3.222 3.222 . 0 0 "[ ]" 1 27 1 11 GLN HB3 1 80 PRO HA 4.000 . 5.500 5.603 5.603 5.603 0.103 1 0 "[ ]" 1 28 1 12 VAL H 1 12 VAL HB 4.000 . 5.000 3.547 3.547 3.547 . 0 0 "[ ]" 1 29 1 12 VAL H 1 13 LEU H 5.000 . 6.000 2.675 2.675 2.675 . 0 0 "[ ]" 1 30 1 12 VAL H 1 80 PRO QG 5.000 . 7.000 6.214 6.214 6.214 . 0 0 "[ ]" 1 31 1 12 VAL H 1 81 LEU H 5.000 . 6.000 4.656 4.656 4.656 . 0 0 "[ ]" 1 32 1 12 VAL H 1 82 CYS H 5.000 . 6.000 4.619 4.619 4.619 . 0 0 "[ ]" 1 33 1 12 VAL H 1 83 ILE HA 5.000 . 6.000 3.769 3.769 3.769 . 0 0 "[ ]" 1 34 1 12 VAL HA 1 13 LEU H 4.000 . 5.000 3.501 3.501 3.501 . 0 0 "[ ]" 1 35 1 12 VAL HB 1 83 ILE H 5.000 . 6.000 4.953 4.953 4.953 . 0 0 "[ ]" 1 36 1 12 VAL HB 1 83 ILE HA 5.000 . 6.000 5.189 5.189 5.189 . 0 0 "[ ]" 1 37 1 12 VAL MG1 1 55 PHE HE2 4.000 . 6.000 4.244 4.244 4.244 . 0 0 "[ ]" 1 38 1 13 LEU H 1 13 LEU MD1 5.000 . 6.300 3.801 3.801 3.801 . 0 0 "[ ]" 1 39 1 13 LEU H 1 13 LEU MD2 5.000 . 6.300 1.979 1.979 1.979 . 0 0 "[ ]" 1 40 1 13 LEU H 1 13 LEU HG 4.000 . 5.000 2.276 2.276 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