NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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38534 |
1rnk   |
cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 486 |
data_1rnk_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1rnk
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1rnk 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1rnk
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1rnk "Master copy" parsed_1rnk
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1rnk
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1rnk.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . n/a 2 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 150 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . n/a 4 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . XPLOR/CNS 5 distance NOE simple 57 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . n/a 6 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . XPLOR/CNS 7 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 279 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . n/a 8 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1rnk 1
1 1rnk.mr . . "MR format" 9 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1rnk 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1rnk
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RIBONUCLEIC ACID 11-JAN-95 1RNK
*COMPND RNA PSEUDOKNOT (GGCGCAGUGGGCUAGCGCCACUCAAAAGGCCCAU)
*COMPND 2 (NMR, 1 STRUCTURE)
*SOURCE SYNTHETIC
*EXPDTA NMR
*AUTHOR L.X.SHEN,I.TINOCO JUNIOR
*REVDAT 1 12-OCT-04 1RNK 0
;
save_
save_MR_file_comment_2
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1rnk
_Org_constr_file_comment.ID 2
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 2
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
NOE constraints
{ base pairing between 1 and 19 G%C pair }
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1rnk
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1rnk 1
2 1 . . . parsed_1rnk 1
3 1 . . . parsed_1rnk 1
4 1 . . . parsed_1rnk 1
5 1 . . . parsed_1rnk 1
6 1 . . . parsed_1rnk 1
7 1 . . . parsed_1rnk 1
8 1 . . . parsed_1rnk 1
9 1 . . . parsed_1rnk 1
10 1 . . . parsed_1rnk 1
11 1 . . . parsed_1rnk 1
12 1 . . . parsed_1rnk 1
13 1 . . . parsed_1rnk 1
14 1 . . . parsed_1rnk 1
15 1 . . . parsed_1rnk 1
16 1 . . . parsed_1rnk 1
17 1 . . . parsed_1rnk 1
18 1 . . . parsed_1rnk 1
19 1 . . . parsed_1rnk 1
20 1 . . . parsed_1rnk 1
21 1 . . . parsed_1rnk 1
22 1 . . . parsed_1rnk 1
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24 1 . . . parsed_1rnk 1
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26 1 . . . parsed_1rnk 1
27 1 . . . parsed_1rnk 1
28 1 . . . parsed_1rnk 1
29 1 . . . parsed_1rnk 1
30 1 . . . parsed_1rnk 1
31 1 . . . parsed_1rnk 1
32 1 . . . parsed_1rnk 1
33 1 . . . parsed_1rnk 1
34 1 . . . parsed_1rnk 1
35 1 . . . parsed_1rnk 1
36 1 . . . parsed_1rnk 1
37 1 . . . parsed_1rnk 1
38 1 . . . parsed_1rnk 1
39 1 . . . parsed_1rnk 1
40 1 . . . parsed_1rnk 1
41 1 . . . parsed_1rnk 1
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43 1 . . . parsed_1rnk 1
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45 1 . . . parsed_1rnk 1
46 1 . . . parsed_1rnk 1
47 1 . . . parsed_1rnk 1
48 1 . . . parsed_1rnk 1
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50 1 . . . parsed_1rnk 1
51 1 . . . parsed_1rnk 1
52 1 . . . parsed_1rnk 1
53 1 . . . parsed_1rnk 1
54 1 . . . parsed_1rnk 1
55 1 . . . parsed_1rnk 1
56 1 . . . parsed_1rnk 1
57 1 . . . parsed_1rnk 1
58 1 . . . parsed_1rnk 1
59 1 . . . parsed_1rnk 1
60 1 . . . parsed_1rnk 1
61 1 . . . parsed_1rnk 1
62 1 . . . parsed_1rnk 1
63 1 . . . parsed_1rnk 1
64 1 . . . parsed_1rnk 1
65 1 . . . parsed_1rnk 1
66 1 . . . parsed_1rnk 1
67 1 . . . parsed_1rnk 1
68 1 . . . parsed_1rnk 1
69 1 . . . parsed_1rnk 1
70 1 . . . parsed_1rnk 1
71 1 . . . parsed_1rnk 1
72 1 . . . parsed_1rnk 1
73 1 . . . parsed_1rnk 1
74 1 . . . parsed_1rnk 1
75 1 . . . parsed_1rnk 1
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77 1 . . . parsed_1rnk 1
78 1 . . . parsed_1rnk 1
79 1 . . . parsed_1rnk 1
80 1 . . . parsed_1rnk 1
81 1 . . . parsed_1rnk 1
82 1 . . . parsed_1rnk 1
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85 1 . . . parsed_1rnk 1
86 1 . . . parsed_1rnk 1
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88 1 . . . parsed_1rnk 1
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91 1 . . . parsed_1rnk 1
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97 1 . . . parsed_1rnk 1
98 1 . . . parsed_1rnk 1
99 1 . . . parsed_1rnk 1
100 1 . . . parsed_1rnk 1
101 1 . . . parsed_1rnk 1
102 1 . . . parsed_1rnk 1
103 1 . . . parsed_1rnk 1
104 1 . . . parsed_1rnk 1
105 1 . . . parsed_1rnk 1
106 1 . . . parsed_1rnk 1
107 1 . . . parsed_1rnk 1
108 1 . . . parsed_1rnk 1
109 1 . . . parsed_1rnk 1
110 1 . . . parsed_1rnk 1
111 1 . . . parsed_1rnk 1
112 1 . . . parsed_1rnk 1
113 1 . . . parsed_1rnk 1
114 1 . . . parsed_1rnk 1
115 1 . . . parsed_1rnk 1
116 1 . . . parsed_1rnk 1
117 1 . . . parsed_1rnk 1
118 1 . . . parsed_1rnk 1
119 1 . . . parsed_1rnk 1
120 1 . . . parsed_1rnk 1
121 1 . . . parsed_1rnk 1
122 1 . . . parsed_1rnk 1
123 1 . . . parsed_1rnk 1
124 1 . . . parsed_1rnk 1
125 1 . . . parsed_1rnk 1
126 1 . . . parsed_1rnk 1
127 1 . . . parsed_1rnk 1
128 1 . . . parsed_1rnk 1
129 1 . . . parsed_1rnk 1
130 1 . . . parsed_1rnk 1
131 1 . . . parsed_1rnk 1
132 1 . . . parsed_1rnk 1
133 1 . . . parsed_1rnk 1
134 1 . . . parsed_1rnk 1
135 1 . . . parsed_1rnk 1
136 1 . . . parsed_1rnk 1
137 1 . . . parsed_1rnk 1
138 1 . . . parsed_1rnk 1
139 1 . . . parsed_1rnk 1
140 1 . . . parsed_1rnk 1
141 1 . . . parsed_1rnk 1
142 1 . . . parsed_1rnk 1
143 1 . . . parsed_1rnk 1
144 1 . . . parsed_1rnk 1
145 1 . . . parsed_1rnk 1
146 1 . . . parsed_1rnk 1
147 1 . . . parsed_1rnk 1
148 1 . . . parsed_1rnk 1
149 1 . . . parsed_1rnk 1
150 1 . . . parsed_1rnk 1
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
1 1 1 . . . . . . . . . 19 . h41 parsed_1rnk 1
1 1 2 . . . . . . . . . 1 . o6 parsed_1rnk 1
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2 1 2 . . . . . . . . . 1 . h21 parsed_1rnk 1
3 1 1 . . . . . . . . . 19 . o2 parsed_1rnk 1
3 1 2 . . . . . . . . . 1 . h21 parsed_1rnk 1
4 1 1 . . . . . . . . . 19 . n3 parsed_1rnk 1
4 1 2 . . . . . . . . . 1 . h1 parsed_1rnk 1
5 1 1 . . . . . . . . . 18 . h41 parsed_1rnk 1
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7 1 2 . . . . . . . . . 2 . h21 parsed_1rnk 1
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11 1 2 . . . . . . . . . 17 . h21 parsed_1rnk 1
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46 1 2 . . . . . . . . . 1 . h1' parsed_1rnk 1
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52 1 2 . . . . . . . . . 2 . h1 parsed_1rnk 1
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loop_
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stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
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_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
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20 "constraints for residue 32 from expt" 80 9 80 9 parsed_1rnk 2
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22 "constraints for residue 33 from expt" 88 9 88 9 parsed_1rnk 2
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26
;
flipping over by 180{ }
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assign (residue 2 and name o6) (residue 3 and name h41) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 17 and name h22) (residue 4 and name h22) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 17 and name o6) (residue 16 and name h41) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 4 and name h22) (residue 15 and name h22) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 16 and name h41) (residue 15 and name o6) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 28 and name h22) (residue 29 and name h22) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 28 and name o6) (residue 29 and name o6) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 29 and name h22) (residue 11 and name h22) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 29 and name o6) (residue 30 and name h41) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 11 and name h22) (residue 10 and name h22) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 11 and name o6) (residue 10 and name o6) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 10 and name h22) (residue 9 and name h22) 3.0 0.0 3.5
assign (residue 10 and name o6) (residue 9 and name o6) 3.0 0.0 3.5
{ constraints to keep the molecule from }
{ forming a knotted structure }
{ used in global fold only }
assign (residue 2 and name o1p) (residue 12 and name ho2') 25 0 35
assign (residue 1 and name h5') (residue 13 and name o1p) 25 0 35
assign (residue 25 and name h62) (residue 1 and name h5') 15 0 35
{ additional constraints }
{ used in global fold only }
assign (residue 6 and name h2'') (residue 7 and name h8) 3.0 0.0 5.0
assign (residue 28 and name h8) (residue 5 and name h1') 4.0 0.0 16
assign (residue 28 and name h8) (residue 5 and name h2'') 4.0 0.0 1
;
108 9 108 9 parsed_1rnk 2
stop_
save_
save_MR_file_comment_6
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1rnk
_Org_constr_file_comment.ID 4
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 6
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
Torsion angle constraints
constraints
dihedral
reset
;
save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_7
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
_Torsion_angle_constraint_list.Entry_ID parsed_1rnk
_Torsion_angle_constraint_list.ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 7
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Torsion_angle_constraint.ID
_Torsion_angle_constraint.Torsion_angle_name
_Torsion_angle_constraint.Assembly_atom_ID_1
_Torsion_angle_constraint.Entity_assembly_ID_1
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10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -5 5 . . 11 . h22 . 11 . n2 . 11 . c2 . 11 . n3 parsed_1rnk 1
11 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -5 5 . . 12 . h42 . 12 . n4 . 12 . c4 . 12 . c5 parsed_1rnk 1
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18 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . -5 5 . . 20 . h62 . 20 . n6 . 20 . c6 . 20 . c5 parsed_1rnk 1
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3 "modified to restrain uo, u1, u2, and u3 instead of delta" 66 1 66 1 parsed_1rnk 1
4 "restrain some nucleotides" 237 1 237 1 parsed_1rnk 1
5 "to be C2'-endo or C3'-endo or in between" 238 1 238 1 parsed_1rnk 1
6 "restrain some nucletides to keep bases anti" 345 1 345 1 parsed_1rnk 1
7 "backbone torsion angle beta" 416 1 416 1 parsed_1rnk 1
8 "used in refinement only" 417 1 417 1 parsed_1rnk 1
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