NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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38127 |
1qwb   |
cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 756 |
data_1qwb_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1qwb
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1qwb 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1qwb
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1qwb "Master copy" parsed_1qwb
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1qwb
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1qwb.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1qwb 1
1 1qwb.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 588 parsed_1qwb 1
1 1qwb.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 17 parsed_1qwb 1
1 1qwb.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "hydrogen bond" simple 47 parsed_1qwb 1
1 1qwb.mr . . XPLOR/CNS 5 planarity "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1qwb 1
1 1qwb.mr . . XPLOR/CNS 6 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 95 parsed_1qwb 1
1 1qwb.mr . . XPLOR/CNS 7 "dipolar coupling" "Not applicable" "Not applicable" 9 parsed_1qwb 1
1 1qwb.mr . . "MR format" 8 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1qwb 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1qwb
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER RNA 01-SEP-03 1QWB
*TITLE NMR STRUCUTRE OF 5'-R(GGACACGAAAUCCCGAAGUAGUGUCC)-3' : AN
*TITLE 2 RNA HAIRPIN CONTAINING THE IN VITRO SELECTED CONSENSUS
*TITLE 3 SEQUENCE FOR NUCLEOLIN RBD12
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: SNRE26;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 ENGINEERED: YES;
*COMPND 5 OTHER_DETAILS: RNA CONTAINS THE CONSENSUS SEQUENCE FOR THE
*COMPND 6 IN VITRO SELECTED NRE.
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 SYNTHETIC: YES;
*SOURCE 3 OTHER_DETAILS: RNA WAS PREPARED BY IN VITRO TRANSCRIPTION
*SOURCE 4 WITH T7 RNA POLYMERASE
*KEYWDS A-FORM HELIX, LOOP E MOTIF, S-TURN, DISORDERED HAIRPIN LOOP
*EXPDTA NMR, 17 STRUCTURES
*AUTHOR L.D.FINGER, L.TRANTIREK, C.JOHANSSON, J.FEIGON
*REVDAT 1 25-NOV-03 1QWB 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1qwb
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1qwb 1
2 1 . . . parsed_1qwb 1
3 1 . . . parsed_1qwb 1
4 1 . . . parsed_1qwb 1
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6 1 . . . parsed_1qwb 1
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13 1 . . . parsed_1qwb 1
14 1 . . . parsed_1qwb 1
15 1 . . . parsed_1qwb 1
16 1 . . . parsed_1qwb 1
17 1 . . . parsed_1qwb 1
18 1 . . . parsed_1qwb 1
19 1 . . . parsed_1qwb 1
20 1 . . . parsed_1qwb 1
21 1 . . . parsed_1qwb 1
22 1 . . . parsed_1qwb 1
23 1 . . . parsed_1qwb 1
24 1 . . . parsed_1qwb 1
25 1 . . . parsed_1qwb 1
26 1 . . . parsed_1qwb 1
27 1 . . . parsed_1qwb 1
28 1 . . . parsed_1qwb 1
29 1 . . . parsed_1qwb 1
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31 1 . . . parsed_1qwb 1
32 1 . . . parsed_1qwb 1
33 1 . . . parsed_1qwb 1
34 1 . . . parsed_1qwb 1
35 1 . . . parsed_1qwb 1
36 1 . . . parsed_1qwb 1
37 1 . . . parsed_1qwb 1
38 1 . . . parsed_1qwb 1
39 1 . . . parsed_1qwb 1
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58 1 . . . parsed_1qwb 1
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126 1 . . . parsed_1qwb 1
127 1 . . . parsed_1qwb 1
128 1 . . . parsed_1qwb 1
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131 1 . . . parsed_1qwb 1
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134 1 . . . parsed_1qwb 1
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163 1 . . . parsed_1qwb 1
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414
;
W
U22INTRA
;
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;
M
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436
;
M
G23INTRA
;
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446
;
M
G23INTER
;
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;
W
U24INTRA
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469
;
W
U24INTER
;
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474
;
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;
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;
W
C25INTER
;
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;
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C26INTRA
;
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;
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C26INTER
;
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522
;
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G1
;
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stop_
save_
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_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1qwb
_Distance_constraint_list.ID 2
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stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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13 1 2 . . . . . . . . . 8 . N6 parsed_1qwb 2
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stop_
loop_
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5 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
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7 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
8 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
9 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
10 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
11 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
12 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
13 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
14 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
15 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
16 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
17 1 . . . . . 6.2 3.1 9.3 parsed_1qwb 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_comment_org.ID
_Dist_constraint_comment_org.Comment_text
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
_Dist_constraint_comment_org.Entry_ID
_Dist_constraint_comment_org.Distance_constraint_list_ID
1 "CPMGNOESY NOES" 1 1 1 16 parsed_1qwb 2
stop_
save_
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_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1qwb
_Distance_constraint_list.ID 3
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_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
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_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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5 1 . . . parsed_1qwb 3
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7 1 . . . parsed_1qwb 3
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9 1 . . . parsed_1qwb 3
10 1 . . . parsed_1qwb 3
11 1 . . . parsed_1qwb 3
12 1 . . . parsed_1qwb 3
13 1 . . . parsed_1qwb 3
14 1 . . . parsed_1qwb 3
15 1 . . . parsed_1qwb 3
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47 1 . . . parsed_1qwb 3
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
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_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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13 1 2 . . . . . . . . . 3 . N1 parsed_1qwb 3
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stop_
loop_
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loop_
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_Dist_constraint_comment_org.Comment_begin_column
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_line
_Dist_constraint_comment_org.Comment_end_column
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save_CNS/XPLOR_dihedral_6
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_Torsion_angle_constraint_list.Block_ID 6
_Torsion_angle_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
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loop_
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1 . . . . . . . . . . . . . . . . 17.73 15.93 19.53 . . . 2 . H8 . 2 . C8 parsed_1qwb 1
2 . . . . . . . . . . . . . . . . 22.13 19.93 24.33 . . . 7 . H8 . 7 . C8 parsed_1qwb 1
3 . . . . . . . . . . . . . . . . 26.97 24.27 29.67 . . . 9 . H2 . 9 . C2 parsed_1qwb 1
4 . . . . . . . . . . . . . . . . 23.24 20.94 25.54 . . . 10 . H8 . 10 . C8 parsed_1qwb 1
5 . . . . . . . . . . . . . . . . 21.88 19.68 24.08 . . . 10 . H2 . 10 . C2 parsed_1qwb 1
6 . . . . . . . . . . . . . . . . 26.39 23.79 28.99 . . . 17 . H2 . 17 . C2 parsed_1qwb 1
7 . . . . . . . . . . . . . . . . 27.78 24.98 30.58 . . . 21 . H8 . 21 . C8 parsed_1qwb 1
8 . . . . . . . . . . . . . . . . 24.46 22.06 26.86 . . . 23 . H8 . 23 . C8 parsed_1qwb 1
9 . . . . . . . . . . . . . . . . 28.79 25.89 31.69 . . . 26 . H6 . 26 . C6 parsed_1qwb 1
stop_
loop_
_RDC_constraint_comment_org.ID
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1
;
RDC for SNRE: 1.12.2002
1DCH derived from signal splitting in F2
error was estimated to be 10 %
the smallest error is however estimated to be 1.5 Hz
;
1 1 4 54 parsed_1qwb 1
2
;
assign ( resid 500 and name OO )
( resid 500 and name Z )
( resid 500 and name X )
( resid 500 and name Y )
( resid 11 and name H6 )
( resid 11 and name C6 ) -3.77 1.5 1.5 !exception in error *
assign ( resid 500 and name OO )
( resid 500 and name Z )
( resid 500 and name X )
( resid 500 and name Y )
( resid 11 and name H5 )
( resid 11 and name C5 ) -1.12 1.5 1.5 !exception in error *
assign ( resid 500 and name OO )
( resid 500 and name Z )
( resid 500 and name X )
( resid 500 and name Y )
( resid 12 and name H6 )
( resid 12 and name C6 ) 5.42 1.5 1.5 !exception in error *
assign ( resid 500 and name OO )
( resid 500 and name Z )
( resid 500 and name X )
( resid 500 and name Y )
( resid 13 and name H6 )
( resid 13 and name C6 ) 12.06 1.5 1.5 !exception in error *
assign ( resid 500 and name OO )
( resid 500 and name Z )
( resid 500 and name X )
( resid 500 and name Y )
( resid 14 and name H6 )
( resid 14 and name C6 ) 17.41 1.7 1.7
assign ( resid 500 and name OO )
( resid 500 and name Z )
( resid 500 and name X )
( resid 500 and name Y )
( resid 16 and name H2 )
( resid 16 and name C2 ) 20.71 2.1 2.1
;
41 1 81 54 parsed_1qwb 1
stop_
save_
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