NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
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33165 |
1hsn   |
cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1527 |
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_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_1hsn
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1hsn 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1hsn
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1hsn "Master copy" parsed_1hsn
stop_
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save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1hsn
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1hsn.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1hsn 1
1 1hsn.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 1387 parsed_1hsn 1
1 1hsn.mr . . XPLOR/CNS 3 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 76 parsed_1hsn 1
1 1hsn.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "hydrogen bond" simple 64 parsed_1hsn 1
1 1hsn.mr . . "MR format" 5 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1hsn 1
stop_
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save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1hsn
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER DNA-BINDING 17-NOV-94 1HSN
*COMPND HIGH MOBILITY GROUP PROTEIN 1 (HMG1) BOX 2, COMPLEXED WITH
*COMPND 2 MERCAPTOETHANOL (NMR, 49 STRUCTURES)
*SOURCE ORGANISM: CHINESE HAMSTER (CRICETULUS GRISEUS);
*SOURCE 2 EXPRESSION SYSTEM: (ESCHERICHIA COLI); STRAIN: DH5 ALPHA
*SOURCE 3 OR BL21; PLASMID: PGEX-2T; GENE: INSERT DERIVED BY PCR
*SOURCE 4 USING AS TEMPLATE A PARTIAL CDNA CLONE OF CHINESE HAMSTER
*SOURCE 5 HMG1 (PLASMID PCH1, LEE ET AL., (1987) NUCLEIC ACIDS
*SOURCE 6 RES. 15, 5051-5068)
*EXPDTA NMR
*AUTHOR C.M.READ,P.D.CARY,C.CRANE-ROBINSON,P.C.DRISCOLL,
*AUTHOR 2 M.O.M.CARILLO,D.G.NORMAN
*REVDAT 1 12-OCT-04 1HSN 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1hsn
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . parsed_1hsn 1
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1
;
Experimental Restraints for NMR Structures of Hamster High
Mobility Group Protein 1 (HMG1) Box 2, containing a mercaptoethanol
molecule adducted to residue cysteine 16.
Authors: C.M. READ, P.D. CARY, C. CRANE-ROBINSON, P.C. DRISCOLL,
M.O.M. CARILLO, AND D.G. NORMAN
Address: Biophysics Laboratories, Department of Biological Sciences
University of Portsmouth, St. Michael's Building, White
Swan Road, Portsmouth PO1 2DT. United Kingdom.
References:
1 C.M. READ, P.D. CARY, C. CRANE-ROBINSON, P.C. DRISCOLL,
M.O.M. CARILLO, AND D.G. NORMAN (1994). In "Nucleic Acids and
Molecular Biology." Eds. F. Eckstein and D.M.J. Lilley. Publ. by
Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg. Volume 9, in press.
2 C.M. READ, P.D. CARY, C. CRANE-ROBINSON, P.C. DRISCOLL, and D.G.
NORMAN (1993). Solution structure of a DNA-binding domain from HMG1.
Nucleic Acids Research, 21, 3427-3436
SUMMARY OF NMR DERIVED RESTRAINTS:
1. NOE RESTRAINTS
INTRA-RESIDUE = 129
SEQUENTIAL (|I-J| = 1) = 455
SHORT RANGE (|I-J| = 2,3,4) = 530
LONG RANGE (|I-J| >= 5) = 273
TOTAL = 1387
2. DIHEDRAL ANGLE RESTRAINTS
38 RESTRAINTS WITH (-170 > PHI > -10)
38 RESTRAINTS WITH ( +5 > PSI > -85)
TOTAL = 76
3. HYDROGEN BOND RESTRAINTS
32 RESTRAINTS WITH D(O-H) 1.5 - 2.5 ANGSTROMS
32 RESTRAINTS WITH D(N-O) 2.5 - 3.5 ANGSTROMS
TOTAL = 64
GRAND TOTAL OF RESTRAINTS = 1527
A. NOE INTERPROTON DISTANCE RESTRAINTS
;
2 1 42 7 parsed_1hsn 1
2 "ASN 3, intra-residue NOES" 44 1 44 27 parsed_1hsn 1
3 "ASN 3, sequential NOES" 50 73 51 24 parsed_1hsn 1
4
;
ASN 3, short-range NOES
ASN 3, long-range NOES
;
55 73 57 24 parsed_1hsn 1
5 "ALA 4, intra-residue NOES" 58 73 60 27 parsed_1hsn 1
6 "ALA 4, sequential NOES" 61 73 62 24 parsed_1hsn 1
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9
;
PRO 5, intra-residue NOES
PRO 5, sequential NOES
;
84 73 87 24 parsed_1hsn 1
10
;
PRO 5, short-range NOES
PRO 5, long-range NOES
;
90 73 92 24 parsed_1hsn 1
11 "LYS 6, intra-residue NOES" 115 73 117 27 parsed_1hsn 1
12 "LYS 6, sequential NOES" 118 73 119 24 parsed_1hsn 1
13
;
LYS 6, short-range NOES
LYS 6, long-range NOES
;
123 73 125 24 parsed_1hsn 1
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15 "ARG 7, sequential NOES" 132 73 133 24 parsed_1hsn 1
16
;
ARG 7, short-range NOES
ARG 7, long-range NOES
;
137 73 139 24 parsed_1hsn 1
17
;
PRO 8, intra-residue NOES
PRO 8, sequential NOES
;
145 73 148 24 parsed_1hsn 1
18
;
PRO 8, short-range NOES
PRO 8, long-range NOES
;
153 73 155 24 parsed_1hsn 1
19
;
PRO 9, intra-residue NOES
PRO 9, sequential NOES
;
162 73 165 24 parsed_1hsn 1
20 "PRO 9, short-range NOES" 168 73 169 25 parsed_1hsn 1
21 "PRO 9, long-range NOES" 178 73 179 24 parsed_1hsn 1
22 "SER 10, intra-residue NOES" 183 73 185 28 parsed_1hsn 1
23 "SER 10, sequential NOES" 186 73 187 25 parsed_1hsn 1
24 "SER 10, short-range NOES" 191 73 192 26 parsed_1hsn 1
25
;
SER 10, long-range NOES
ALA 11, intra-residue NOES
;
207 73 210 28 parsed_1hsn 1
26 "ALA 11, sequential NOES" 211 73 212 25 parsed_1hsn 1
27 "ALA 11, short-range NOES" 219 73 220 26 parsed_1hsn 1
28 "ALA 11, long-range NOES" 227 72 228 25 parsed_1hsn 1
29 "PHE 12, intra-residue NOES" 239 73 241 28 parsed_1hsn 1
30 "PHE 12, sequential NOES" 249 73 250 25 parsed_1hsn 1
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53 "GLU 18, intra-residue NOES" 535 73 537 28 parsed_1hsn 1
54 "GLU 18, sequential NOES" 538 73 539 25 parsed_1hsn 1
55 "GLU 18, short-range NOES" 552 73 553 26 parsed_1hsn 1
56 "GLU 18, long-range NOES" 557 73 558 25 parsed_1hsn 1
57 "TYR 19, intra-residue NOES" 559 73 561 28 parsed_1hsn 1
58 "TYR 19, sequential NOES" 568 73 569 25 parsed_1hsn 1
59 "TYR 19, short-range NOES" 578 73 579 26 parsed_1hsn 1
60 "TYR 19, long-range NOES" 592 73 593 25 parsed_1hsn 1
61 "ARG 20, intra-residue NOES" 599 73 601 28 parsed_1hsn 1
62 "ARG 20, sequential NOES" 602 73 603 25 parsed_1hsn 1
63 "ARG 20, short-range NOES" 608 73 609 26 parsed_1hsn 1
64 "ARG 20, long-range NOES" 614 73 615 25 parsed_1hsn 1
65
;
PRO 21, intra-residue NOES
PRO 21, sequential NOES
;
617 73 620 25 parsed_1hsn 1
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83
;
GLY 25, long-range NOES
GLU 26, intra-residue NOES
;
711 73 714 28 parsed_1hsn 1
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86
;
GLU 26, long-range NOES
HIS 27, intra-residue NOES
;
734 73 737 28 parsed_1hsn 1
87 "HIS 27, sequential NOES" 739 73 740 25 parsed_1hsn 1
88 "HIS 27, short-range NOES" 747 73 748 26 parsed_1hsn 1
89
;
HIS 27, long-range NOES
PRO 28, intra-residue NOES
PRO 28, sequential NOES
;
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90 "PRO 28, short-range NOES" 771 73 772 26 parsed_1hsn 1
91
;
PRO 28, long-range NOES
GLY 29, intra-residue NOES
;
773 73 776 28 parsed_1hsn 1
92 "GLY 29, sequential NOES" 778 73 779 25 parsed_1hsn 1
93
;
GLY 29, short-range NOES
GLY 29, long-range NOES
;
787 73 789 25 parsed_1hsn 1
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99 "SER 31, sequential NOES" 824 73 825 25 parsed_1hsn 1
100 "SER 31, short-range NOES" 832 73 833 26 parsed_1hsn 1
101
;
SER 31, long-range NOES
ILE 32, intra-residue NOES
;
847 73 850 28 parsed_1hsn 1
102 "ILE 32, sequential NOES" 851 73 852 25 parsed_1hsn 1
103 "ILE 32, short-range NOES" 860 73 861 26 parsed_1hsn 1
104
;
ILE 32, long-range NOES
GLY 33, intra-residue NOES
;
872 73 875 28 parsed_1hsn 1
105 "GLY 33, sequential NOES" 876 73 877 25 parsed_1hsn 1
106 "GLY 33, short-range NOES" 882 73 883 26 parsed_1hsn 1
107
;
GLY 33, long-range NOES
ASP 34, intra-residue NOES
;
891 73 894 28 parsed_1hsn 1
108 "ASP 34, sequential NOES" 895 73 896 25 parsed_1hsn 1
109 "ASP 34, short-range NOES" 903 73 904 26 parsed_1hsn 1
110
;
ASP 34, long-range NOES
VAL 35, intra-residue NOES
;
913 73 916 28 parsed_1hsn 1
111 "VAL 35, sequential NOES" 917 73 918 25 parsed_1hsn 1
112 "VAL 35, short-range NOES" 924 73 925 26 parsed_1hsn 1
113
;
VAL 35, long-range NOES
ALA 36, intra-residue NOES
;
935 73 938 28 parsed_1hsn 1
114 "ALA 36, sequential NOES" 939 73 940 25 parsed_1hsn 1
115 "ALA 36, short-range NOES" 946 73 947 26 parsed_1hsn 1
116
;
ALA 36, long-range NOES
LYS 37, intra-residue NOES
;
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117 "LYS 37, sequential NOES" 957 73 958 25 parsed_1hsn 1
118 "LYS 37, short-range NOES" 962 73 963 26 parsed_1hsn 1
119
;
LYS 37, long-range NOES
LYS 38, intra-residue NOES
;
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120 "LYS 38, sequential NOES" 972 73 973 25 parsed_1hsn 1
121 "LYS 38, short-range NOES" 980 73 981 26 parsed_1hsn 1
122
;
LYS 38, long-range NOES
LEU 39, intra-residue NOES
;
991 73 994 28 parsed_1hsn 1
123 "LEU 39, sequential NOES" 995 73 996 25 parsed_1hsn 1
124 "LEU 39, short-range NOES" 1003 73 1004 26 parsed_1hsn 1
125 "LEU 39, long-range NOES" 1014 73 1015 25 parsed_1hsn 1
126 "GLY 40, intra-residue NOES" 1016 73 1018 28 parsed_1hsn 1
127 "GLY 40, sequential NOES" 1019 73 1020 25 parsed_1hsn 1
128 "GLY 40, short-range NOES" 1024 73 1025 26 parsed_1hsn 1
129
;
GLY 40, long-range NOES
GLU 41, intra-residue NOES
;
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130 "GLU 41, sequential NOES" 1038 73 1039 25 parsed_1hsn 1
131 "GLU 41, short-range NOES" 1045 73 1046 26 parsed_1hsn 1
132
;
GLU 41, long-range NOES
MET 42, intra-residue NOES
;
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133 "MET 42, sequential NOES" 1066 73 1067 25 parsed_1hsn 1
134 "MET 42, short-range NOES" 1072 73 1073 26 parsed_1hsn 1
135
;
MET 42, long-range NOES
TRP 43, intra-residue NOES
;
1082 73 1085 28 parsed_1hsn 1
136 "TRP 43, sequential NOES" 1099 73 1100 25 parsed_1hsn 1
137 "TRP 43, short-range NOES" 1110 73 1111 26 parsed_1hsn 1
138 "TRP 43, long-range NOES" 1123 73 1124 25 parsed_1hsn 1
139 "ASN 44, intra-residue NOES" 1154 73 1156 28 parsed_1hsn 1
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141 "ASN 44, short-range NOES" 1168 73 1169 26 parsed_1hsn 1
142
;
ASN 44, long-range NOES
ASN 45, intra-residue NOES
;
1173 73 1176 28 parsed_1hsn 1
143 "ASN 45, sequential NOES" 1177 73 1178 25 parsed_1hsn 1
144
;
ASN 45, short-range NOES
ASN 45, long-range NOES
THR 46, intra-residue NOES
;
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145 "THR 46, sequential NOES" 1190 73 1191 25 parsed_1hsn 1
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148 "ALA 47, intra-residue NOES" 1217 73 1219 28 parsed_1hsn 1
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151
;
ALA 47, long-range NOES
ALA 48, intra-residue NOES
;
1241 73 1244 28 parsed_1hsn 1
152 "ALA 48, sequential NOES" 1245 73 1246 25 parsed_1hsn 1
153 "ALA 48, short-range NOES" 1251 73 1252 26 parsed_1hsn 1
154
;
ALA 48, long-range NOES
ASP 49, intra-residue NOES
;
1265 73 1268 28 parsed_1hsn 1
155 "ASP 49, sequential NOES" 1269 73 1270 25 parsed_1hsn 1
156 "ASP 49, short-range NOES" 1275 73 1276 26 parsed_1hsn 1
157
;
ASP 49, long-range NOES
ASP 50, intra-residue NOES
;
1281 73 1284 28 parsed_1hsn 1
158 "ASP 50, sequential NOES" 1285 73 1286 25 parsed_1hsn 1
159 "ASP 50, short-range NOES" 1293 73 1294 26 parsed_1hsn 1
160
;
ASP 50, long-range NOES
LYS 51, intra-residue NOES
;
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161 "LYS 51, sequential NOES" 1302 73 1303 25 parsed_1hsn 1
162 "LYS 51, short-range NOES" 1312 73 1313 26 parsed_1hsn 1
163
;
LYS 51, long-range NOES
GLN 52, intra-residue NOES
;
1318 73 1321 28 parsed_1hsn 1
164 "GLN 52, sequential NOES" 1322 73 1323 25 parsed_1hsn 1
165 "GLN 52, short-range NOES" 1330 73 1331 26 parsed_1hsn 1
166
;
GLN 52, long-range NOES
PRO 53, intra-residue NOES
PRO 53, sequential NOES
;
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167 "PRO 53, short-range NOES" 1348 73 1349 26 parsed_1hsn 1
168
;
PRO 53, long-range NOES
TYR 54, intra-residue NOES
;
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;
TYR 54, long-range NOES
GLU 55, intra-residue NOES
;
1381 73 1384 28 parsed_1hsn 1
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174
;
GLU 55, long-range NOES
LYS 56, intra-residue NOES
;
1397 73 1400 28 parsed_1hsn 1
175 "LYS 56, sequential NOES" 1401 73 1402 25 parsed_1hsn 1
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177
;
LYS 56, long-range NOES
LYS 57, intra-residue NOES
;
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;
LYS 57, long-range NOES
ALA 58, intra-residue NOES
;
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183
;
ALA 58, long-range NOES
ALA 59, intra-residue NOES
;
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184 "ALA 59, sequential NOES" 1444 73 1445 25 parsed_1hsn 1
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186
;
ALA 59, long-range NOES
LYS 60, intra-residue NOES
;
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;
LYS 60, long-range NOES
LEU 61, intra-residue NOES
;
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;
LEU 61, long-range NOES
LYS 62, intra-residue NOES
;
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;
LYS 62, long-range NOES
GLU 63, intra-residue NOES
;
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LYS 64, intra-residue NOES
;
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;
LYS 64, long-range NOES
TYR 65, intra-residue NOES
;
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202 "TYR 65, sequential NOES" 1544 73 1545 25 parsed_1hsn 1
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TYR 65, long-range NOES
GLU 66, intra-residue NOES
;
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205 "GLU 66, sequential NOES" 1584 73 1585 25 parsed_1hsn 1
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207
;
GLU 66, long-range NOES
LYS 67, intra-residue NOES
;
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208 "LYS 67, sequential NOES" 1611 73 1612 25 parsed_1hsn 1
209 "LYS 67, short-range NOES" 1617 73 1618 26 parsed_1hsn 1
210
;
LYS 67, long-range NOES
ASP 68, intra-residue NOES
;
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211 "ASP 68, sequential NOES" 1631 73 1632 25 parsed_1hsn 1
212 "ASP 68, short-range NOES" 1639 73 1640 26 parsed_1hsn 1
213
;
ASP 68, long-range NOES
ILE 69, intra-residue NOES
;
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;
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;
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;
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TYR 72, intra-residue NOES
;
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;
ARG 73, long-range NOES
ALA 74, intra-residue NOES
;
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231
;
ALA 74, sequential NOES
ALA 74, short-range NOES
ARG 74, long-range NOES
LYS 75, intra-residue NOES
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loop_
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_TA_constraint_comment_org.Comment_end_line
_TA_constraint_comment_org.Comment_end_column
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9
;
!PHI ANGLE RESTRAINTS HELIX 2
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;
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!PSI ANGLE RESTRAINTS HELIX 3
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save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1hsn
_Distance_constraint_list.ID 2
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_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
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_Dist_constraint_tree.Logic_operation
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stop_
loop_
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_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
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1 "C. H-BOND RESTRAINTS" 1 1 4 7 parsed_1hsn 2
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;
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ARG 20
;
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;
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