NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | cing | in_recoord | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
32552 |
1gb1   |
cing | recoord | 2-parsed | STAR | entry | full | 1015 |
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1 "Conversion project" NMR . parsed_1gb1 1
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_Entry.Sf_category entry_information
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_Entry.Version_type original
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_Entry.Origination .
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PDB 1gb1 "Master copy" parsed_1gb1
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1 1gb1.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . n/a 2 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . XPLOR/CNS 3 distance NOE simple 854 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . XPLOR/CNS 4 distance "hydrogen bond" simple 68 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . n/a 5 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . XPLOR/CNS 6 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 93 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . n/a 7 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . unknown 8 "chemical shift" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1gb1 1
1 1gb1.mr . . "MR format" 9 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1gb1 1
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_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
REMARK Experimental NMR restraints used to determine the
REMARK high resolution three-dimensional structure of the
REMARK B1 domain of protein G in solution
REMARK
REMARK Authors: A.M. Gronenborn and G.M. Clore
REMARK
REMARK References
REMARK
REMARK 1. Gronenborn, A.M., Filpula, D.R., Essig, N.Z., Achari, A.,
REMARK Whitlow, M., Wingfield, P.T. & Clore, G.M. (1991)
REMARK The immunoglobulin binding domain of streptococcal protein G
REMARK has a novel and highly stable polypeptide fold.
REMARK Science in press
REMARK
REMARK
REMARK Details of the structure determination and all structural
REMARK statistics are given in ref. 1 (i.e. agreement with experimental
REMARK restraints, deviations from ideality for bond lengths, angles,
REMARK planes and chirality, non-bonded contacts, atomic rms differences
REMARK between the calculated structures).
REMARK The structures are based on 854 interproton distance restraints
REMARK derived from NOE measurements; 60 hydrogen-bonding distance
REMARK restraints for 30 hydrogen-bonds identified on the basis of the
REMARK NOE and amide proton exchange data, as well as the initial structure
REMARK calculations; and 54 phi and 51 psi backbone torsion angle
REMARK restraints and 39 chi1 side chain torsion angle restraints derived
REMARK from coupling constants and NOE data. The latter are obtained using
REMARK the conformationa grid search program STEREOSEARCH [Nilges, M.,
REMARK Clore, G.M. & Gronenborn, A.M. (1990) Biopolymers 29, 813-822
REMARK The method used to determine the structures
REMARK is the hybrid metric matrix distance geometry-dynamical simulated
REMARK annealing method [Nilges, M., Clore, G.M. & Gronenborn, A.M.
REMARK FEBS Lett. 229, 317-324 (1988)].
REMARK
REMARK
REMARK All the coordinates
REMARK are included here as a separate file: g_brookhaven.pdb
REMARK
REMARK The NOE restraints are given in (A), the torsion angle restraints
REMARK in (B), and the table of proton chemical shift assignments in (C).
REMARK
REMARK
;
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_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
A. NOE interproton distance restraints
The restraints are represented by square-well potentials with the upper (u)
and lower (l) limits given by u=i+k and l=i-j where the numbers are
entered in the order i,j,k. [Clore et al. (1986) EMBO J. 5, 2729-2735]
The NOEs are classified into three distance ranges corresponding to
strong, medium and weak NOEs. These are 1.8-2.7 A, 1.8-3.3 A and 1.8-5.0 A,
respectively. Appropriate corrections to the upper limits for distances
involving methyl, methylene and Tyr and Phe aromatic ring protons, to account
for centre averaging, are carried out as described by Wuthrich et al.
[J. Mol. Biol. 169, 949-961 (1983)]. In addition, an extra 0.5 A is added
to the upper limits of distances involving methyl protons [Clore et al.
(1983) Biochemistry 26, 8012-8023; Wagner et al. (1987)
J. Mol. Biol. 196, 611-640].
The atom notation follows standard PDB format. The # indicates a single
wild card, and the * a full wild card. e.g. For Leu, HD* representes all the
methyl protons; for a normal methylene beta proton, HB# represents the
two protons. In these cases, the distances are calculated as centre
averages.
Note that the hard sphere van der Waals repulsion term ensures that
the minimum lower limit for all distances is the sum of the relevant
hard sphere atom radii.
;
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_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1gb1
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
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_Distance_constraint_list.Block_ID 3
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753 1 2 . . . . . . . . . 16 . HA parsed_1gb1 1
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1 "CaH(i)-NH(j) long range" 1 1 1 26 parsed_1gb1 1
2 "Long range NH(i)-NH(j)" 16 1 16 24 parsed_1gb1 1
3 "long range CaH(i)-CaH(j)" 26 1 26 26 parsed_1gb1 1
4
;
#
long range CaH(i)-CbH(j)
;
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5 "#" 37 77 37 79 parsed_1gb1 1
6 "#" 47 77 47 79 parsed_1gb1 1
7 "#" 48 77 48 79 parsed_1gb1 1
8 Cbh(i)-CbH(j) 56 1 56 15 parsed_1gb1 1
9 !# 59 77 59 81 parsed_1gb1 1
10 "long range Thr CbH(i)-NH(j)" 64 1 64 29 parsed_1gb1 1
11 "long range CbH(i)-NH(j)" 69 1 69 25 parsed_1gb1 1
12 "other long range" 79 1 79 18 parsed_1gb1 1
13 !# 80 77 80 81 parsed_1gb1 1
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21 !# 106 77 106 81 parsed_1gb1 1
22 !# 107 77 107 81 parsed_1gb1 1
23 !# 108 77 108 81 parsed_1gb1 1
24
;
long range Val CbH(i)-NH(j)
assign (resid 54 and name hb) (resid 45 and name hn) 2.5 0.7 0.4
;
115 77 117 66 parsed_1gb1 1
25 !# 128 77 128 81 parsed_1gb1 1
26
;
!#
long range Val hg
;
129 77 130 19 parsed_1gb1 1
27 !# 131 77 131 81 parsed_1gb1 1
28 !# 132 77 132 81 parsed_1gb1 1
29 !# 134 77 134 81 parsed_1gb1 1
30 !# 135 77 135 81 parsed_1gb1 1
31 !# 138 77 138 81 parsed_1gb1 1
32 !# 139 77 139 81 parsed_1gb1 1
33 !# 143 77 143 81 parsed_1gb1 1
34 !# 144 77 144 81 parsed_1gb1 1
35 !# 149 77 149 81 parsed_1gb1 1
36 !# 150 77 150 81 parsed_1gb1 1
37 "long range Thr hg2#" 152 77 153 21 parsed_1gb1 1
38 !# 156 77 156 81 parsed_1gb1 1
39 !# 159 77 159 81 parsed_1gb1 1
40 !# 165 77 165 81 parsed_1gb1 1
41 !# 166 77 166 81 parsed_1gb1 1
42 "#" 168 77 168 79 parsed_1gb1 1
43 "#" 169 77 169 79 parsed_1gb1 1
44 !# 173 77 173 81 parsed_1gb1 1
45
;
Long range aromatics
Tyr-3
;
178 77 180 7 parsed_1gb1 1
46 "#" 181 77 181 79 parsed_1gb1 1
47 "#" 182 77 182 79 parsed_1gb1 1
48 "#" 183 77 183 79 parsed_1gb1 1
49 "#" 184 77 184 79 parsed_1gb1 1
50 Phe-30 190 1 190 8 parsed_1gb1 1
51 "#" 204 77 204 79 parsed_1gb1 1
52 "#" 205 77 205 79 parsed_1gb1 1
53
;
#
Tyr-33
;
214 77 215 8 parsed_1gb1 1
54 "#" 216 77 216 79 parsed_1gb1 1
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57 "#" 219 77 219 79 parsed_1gb1 1
58 "#" 220 77 220 79 parsed_1gb1 1
59 "#" 221 77 221 79 parsed_1gb1 1
60
;
#
Trp-43
;
222 77 223 8 parsed_1gb1 1
61 "#" 224 77 224 79 parsed_1gb1 1
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76 "#" 260 77 260 79 parsed_1gb1 1
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80 "#" 264 77 264 79 parsed_1gb1 1
81
;
#
Phe-45
;
265 77 266 8 parsed_1gb1 1
82 "#" 267 77 267 79 parsed_1gb1 1
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84 "#" 281 77 281 79 parsed_1gb1 1
85 "#" 282 77 282 79 parsed_1gb1 1
86 "#" 283 77 283 79 parsed_1gb1 1
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88 "#" 286 77 286 79 parsed_1gb1 1
89 "#" 287 77 287 79 parsed_1gb1 1
90 "#" 291 77 291 79 parsed_1gb1 1
91 !# 292 77 292 81 parsed_1gb1 1
92 "#" 293 77 293 79 parsed_1gb1 1
93 Ile 304 1 304 5 parsed_1gb1 1
94 "Noes involving side chain amides" 307 1 307 34 parsed_1gb1 1
95 !# 308 77 308 81 parsed_1gb1 1
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97 !# 310 77 310 81 parsed_1gb1 1
98 !# 311 77 311 81 parsed_1gb1 1
99
;
!!Short range NOEs
CaH(i)-NH(i+1)
;
312 77 314 16 parsed_1gb1 1
100 NH(i)-NH(i+1) 371 1 371 15 parsed_1gb1 1
101 CaH-CbH 409 1 409 9 parsed_1gb1 1
102 "#" 415 77 415 79 parsed_1gb1 1
103 CaH(i)-NH(i+2) 417 1 417 16 parsed_1gb1 1
104 CaH(i)-NH(i+3) 425 1 425 17 parsed_1gb1 1
105
;
assign (resid 37 and name ha) (resid 40 and name hn) 4.0 2.2 1.0
NH(i)-NH(i+2)
;
436 1 437 15 parsed_1gb1 1
106 NH(i)-NH(i+3) 451 1 451 15 parsed_1gb1 1
107 NH(i)-NH(i+5) 454 1 454 15 parsed_1gb1 1
108 CaH(i)-NH(i+4) 456 1 456 17 parsed_1gb1 1
109 CaH(i)-NH(i+5) 460 1 460 17 parsed_1gb1 1
110 CaH(i)-CbH(i+3) 463 1 463 17 parsed_1gb1 1
111 "#" 464 77 464 79 parsed_1gb1 1
112 "#" 474 77 474 79 parsed_1gb1 1
113 CaH(i)-CaH(i+5) 481 1 481 17 parsed_1gb1 1
114 "CbH(i)-CbH(j) short range" 483 1 483 27 parsed_1gb1 1
115 CbH-NH 486 1 486 8 parsed_1gb1 1
116
;
#
Others
;
490 77 491 8 parsed_1gb1 1
117 !# 495 77 495 81 parsed_1gb1 1
118 "Thr hg2#(i) to j" 497 77 498 18 parsed_1gb1 1
119 !# 501 77 501 81 parsed_1gb1 1
120 !# 514 77 514 81 parsed_1gb1 1
121 "#" 522 77 522 79 parsed_1gb1 1
122 "Val hg(i)-Others" 523 77 524 18 parsed_1gb1 1
123 !# 527 77 527 81 parsed_1gb1 1
124 !# 528 77 528 81 parsed_1gb1 1
125 !# 536 77 536 81 parsed_1gb1 1
126 Ile 537 77 538 5 parsed_1gb1 1
127
;
!#
NOEs involving side chain amide groups
;
540 77 541 40 parsed_1gb1 1
128 !# 545 77 545 81 parsed_1gb1 1
129
;
!#
Aromatic NOEs
;
546 77 547 15 parsed_1gb1 1
130 "#" 548 77 548 79 parsed_1gb1 1
131 "#" 549 77 549 79 parsed_1gb1 1
132 "#" 550 77 550 79 parsed_1gb1 1
133 "#" 552 77 552 79 parsed_1gb1 1
134 "#" 553 77 553 79 parsed_1gb1 1
135 "#" 557 77 557 79 parsed_1gb1 1
136 "#" 569 77 569 79 parsed_1gb1 1
137 "Leu HD*" 573 1 573 9 parsed_1gb1 1
138 !# 578 77 578 81 parsed_1gb1 1
139 !# 579 77 579 81 parsed_1gb1 1
140 Lys 584 77 585 5 parsed_1gb1 1
141 Glu 590 1 590 5 parsed_1gb1 1
142
;
Intraresidue
Ha-NH
;
591 77 593 7 parsed_1gb1 1
143 "Ha-Hn Gly" 645 1 645 11 parsed_1gb1 1
144 CaH-CbH 653 77 654 9 parsed_1gb1 1
145 "#" 655 77 655 79 parsed_1gb1 1
146 "#" 666 77 666 79 parsed_1gb1 1
147 "#" 667 77 667 79 parsed_1gb1 1
148 "#" 682 77 682 79 parsed_1gb1 1
149 "#" 690 77 690 79 parsed_1gb1 1
150 "#" 691 77 691 79 parsed_1gb1 1
151 "#" 713 77 713 79 parsed_1gb1 1
152
;
#
NH-CbH
;
717 77 718 8 parsed_1gb1 1
153 "#" 729 77 729 79 parsed_1gb1 1
154 "#" 730 77 730 79 parsed_1gb1 1
155 "#" 736 77 736 79 parsed_1gb1 1
156 "#" 740 77 740 79 parsed_1gb1 1
157 "#" 744 77 744 79 parsed_1gb1 1
158 "#" 745 77 745 79 parsed_1gb1 1
159 "#" 747 77 747 79 parsed_1gb1 1
160 "#" 750 77 750 79 parsed_1gb1 1
161 "#" 758 77 758 79 parsed_1gb1 1
162 "#" 759 77 759 79 parsed_1gb1 1
163 "#" 760 77 760 79 parsed_1gb1 1
164 "#" 779 77 779 79 parsed_1gb1 1
165 "#" 783 77 783 79 parsed_1gb1 1
166
;
#
Val-methyl to ha and hn
;
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167 "#" 789 77 789 79 parsed_1gb1 1
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171 "#" 793 77 793 79 parsed_1gb1 1
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179 "#" 801 77 801 79 parsed_1gb1 1
180
;
#
Thr
;
802 77 803 5 parsed_1gb1 1
181 Glu 824 77 825 5 parsed_1gb1 1
182 "#" 826 77 826 79 parsed_1gb1 1
183 "#" 827 77 827 79 parsed_1gb1 1
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192 "#" 836 77 836 79 parsed_1gb1 1
193
;
#
Met
;
837 77 838 5 parsed_1gb1 1
194
;
#
Leu
;
839 77 840 5 parsed_1gb1 1
195 "#" 841 77 841 79 parsed_1gb1 1
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199 "#" 848 77 848 79 parsed_1gb1 1
200 "#" 849 77 849 79 parsed_1gb1 1
201 Ile 851 77 852 5 parsed_1gb1 1
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211
;
#
Lys
;
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213 "#" 866 77 866 79 parsed_1gb1 1
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222 "#" 875 77 875 79 parsed_1gb1 1
223 "#" 876 77 876 79 parsed_1gb1 1
224 "#" 877 77 877 79 parsed_1gb1 1
225 "#" 878 77 878 79 parsed_1gb1 1
226 "#" 879 77 879 79 parsed_1gb1 1
227
;
!#
Gln and Asn side chain amides
;
880 77 881 31 parsed_1gb1 1
228 "#" 884 77 884 79 parsed_1gb1 1
229 "#" 885 77 885 79 parsed_1gb1 1
230 !# 886 77 886 81 parsed_1gb1 1
231 aromatic 889 77 890 10 parsed_1gb1 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_4
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1gb1
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 4
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_1gb1 2
2 1 . . . parsed_1gb1 2
3 1 . . . parsed_1gb1 2
4 1 . . . parsed_1gb1 2
5 1 . . . parsed_1gb1 2
6 1 . . . parsed_1gb1 2
7 1 . . . parsed_1gb1 2
8 1 . . . parsed_1gb1 2
9 1 . . . parsed_1gb1 2
10 1 . . . parsed_1gb1 2
11 1 . . . parsed_1gb1 2
12 1 . . . parsed_1gb1 2
13 1 . . . parsed_1gb1 2
14 1 . . . parsed_1gb1 2
15 1 . . . parsed_1gb1 2
16 1 . . . parsed_1gb1 2
17 1 . . . parsed_1gb1 2
18 1 . . . parsed_1gb1 2
19 1 . . . parsed_1gb1 2
20 1 . . . parsed_1gb1 2
21 1 . . . parsed_1gb1 2
22 1 . . . parsed_1gb1 2
23 1 . . . parsed_1gb1 2
24 1 . . . parsed_1gb1 2
25 1 . . . parsed_1gb1 2
26 1 . . . parsed_1gb1 2
27 1 . . . parsed_1gb1 2
28 1 . . . parsed_1gb1 2
29 1 . . . parsed_1gb1 2
30 1 . . . parsed_1gb1 2
31 1 . . . parsed_1gb1 2
32 1 . . . parsed_1gb1 2
33 1 . . . parsed_1gb1 2
34 1 . . . parsed_1gb1 2
35 1 . . . parsed_1gb1 2
36 1 . . . parsed_1gb1 2
37 1 . . . parsed_1gb1 2
38 1 . . . parsed_1gb1 2
39 1 . . . parsed_1gb1 2
40 1 . . . parsed_1gb1 2
41 1 . . . parsed_1gb1 2
42 1 . . . parsed_1gb1 2
43 1 . . . parsed_1gb1 2
44 1 . . . parsed_1gb1 2
45 1 . . . parsed_1gb1 2
46 1 . . . parsed_1gb1 2
47 1 . . . parsed_1gb1 2
48 1 . . . parsed_1gb1 2
49 1 . . . parsed_1gb1 2
50 1 . . . parsed_1gb1 2
51 1 . . . parsed_1gb1 2
52 1 . . . parsed_1gb1 2
53 1 . . . parsed_1gb1 2
54 1 . . . parsed_1gb1 2
55 1 . . . parsed_1gb1 2
56 1 . . . parsed_1gb1 2
57 1 . . . parsed_1gb1 2
58 1 . . . parsed_1gb1 2
59 1 . . . parsed_1gb1 2
60 1 . . . parsed_1gb1 2
61 1 . . . parsed_1gb1 2
62 1 . . . parsed_1gb1 2
63 1 . . . parsed_1gb1 2
64 1 . . . parsed_1gb1 2
65 1 . . . parsed_1gb1 2
66 1 . . . parsed_1gb1 2
67 1 . . . parsed_1gb1 2
68 1 . . . parsed_1gb1 2
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
_Dist_constraint.Auth_seq_ID
_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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2 1 2 . . . . . . . . . 18 . O parsed_1gb1 2
3 1 1 . . . . . . . . . 18 . N parsed_1gb1 2
3 1 2 . . . . . . . . . 3 . O parsed_1gb1 2
4 1 1 . . . . . . . . . 5 . N parsed_1gb1 2
4 1 2 . . . . . . . . . 16 . O parsed_1gb1 2
5 1 1 . . . . . . . . . 16 . N parsed_1gb1 2
5 1 2 . . . . . . . . . 5 . O parsed_1gb1 2
6 1 1 . . . . . . . . . 7 . N parsed_1gb1 2
6 1 2 . . . . . . . . . 14 . O parsed_1gb1 2
7 1 1 . . . . . . . . . 14 . N parsed_1gb1 2
7 1 2 . . . . . . . . . 7 . O parsed_1gb1 2
8 1 1 . . . . . . . . . 9 . N parsed_1gb1 2
8 1 2 . . . . . . . . . 12 . O parsed_1gb1 2
9 1 1 . . . . . . . . . 12 . N parsed_1gb1 2
9 1 2 . . . . . . . . . 9 . O parsed_1gb1 2
10 1 1 . . . . . . . . . 4 . N parsed_1gb1 2
10 1 2 . . . . . . . . . 50 . O parsed_1gb1 2
11 1 1 . . . . . . . . . 52 . N parsed_1gb1 2
11 1 2 . . . . . . . . . 4 . O parsed_1gb1 2
12 1 1 . . . . . . . . . 6 . N parsed_1gb1 2
12 1 2 . . . . . . . . . 52 . O parsed_1gb1 2
13 1 1 . . . . . . . . . 54 . N parsed_1gb1 2
13 1 2 . . . . . . . . . 6 . O parsed_1gb1 2
14 1 1 . . . . . . . . . 8 . N parsed_1gb1 2
14 1 2 . . . . . . . . . 54 . O parsed_1gb1 2
15 1 1 . . . . . . . . . 42 . N parsed_1gb1 2
15 1 2 . . . . . . . . . 55 . O parsed_1gb1 2
16 1 1 . . . . . . . . . 55 . N parsed_1gb1 2
16 1 2 . . . . . . . . . 42 . O parsed_1gb1 2
17 1 1 . . . . . . . . . 44 . N parsed_1gb1 2
17 1 2 . . . . . . . . . 53 . O parsed_1gb1 2
18 1 1 . . . . . . . . . 53 . N parsed_1gb1 2
18 1 2 . . . . . . . . . 44 . O parsed_1gb1 2
19 1 1 . . . . . . . . . 46 . N parsed_1gb1 2
19 1 2 . . . . . . . . . 51 . O parsed_1gb1 2
20 1 1 . . . . . . . . . 50 . N parsed_1gb1 2
20 1 2 . . . . . . . . . 46 . O parsed_1gb1 2
21 1 1 . . . . . . . . . 51 . N parsed_1gb1 2
21 1 2 . . . . . . . . . 46 . O parsed_1gb1 2
22 1 1 . . . . . . . . . 22 . O parsed_1gb1 2
22 1 2 . . . . . . . . . 26 . N parsed_1gb1 2
23 1 1 . . . . . . . . . 23 . O parsed_1gb1 2
23 1 2 . . . . . . . . . 27 . N parsed_1gb1 2
24 1 1 . . . . . . . . . 24 . O parsed_1gb1 2
24 1 2 . . . . . . . . . 28 . N parsed_1gb1 2
25 1 1 . . . . . . . . . 25 . O parsed_1gb1 2
25 1 2 . . . . . . . . . 29 . N parsed_1gb1 2
26 1 1 . . . . . . . . . 26 . O parsed_1gb1 2
26 1 2 . . . . . . . . . 30 . N parsed_1gb1 2
27 1 1 . . . . . . . . . 27 . O parsed_1gb1 2
27 1 2 . . . . . . . . . 31 . N parsed_1gb1 2
28 1 1 . . . . . . . . . 28 . O parsed_1gb1 2
28 1 2 . . . . . . . . . 32 . N parsed_1gb1 2
29 1 1 . . . . . . . . . 29 . O parsed_1gb1 2
29 1 2 . . . . . . . . . 33 . N parsed_1gb1 2
30 1 1 . . . . . . . . . 30 . O parsed_1gb1 2
30 1 2 . . . . . . . . . 34 . N parsed_1gb1 2
31 1 1 . . . . . . . . . 31 . O parsed_1gb1 2
31 1 2 . . . . . . . . . 35 . N parsed_1gb1 2
32 1 1 . . . . . . . . . 34 . O parsed_1gb1 2
32 1 2 . . . . . . . . . 39 . N parsed_1gb1 2
33 1 1 . . . . . . . . . 22 . OD2 parsed_1gb1 2
33 1 2 . . . . . . . . . 25 . N parsed_1gb1 2
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34 1 2 . . . . . . . . . 1 . O parsed_1gb1 2
35 1 1 . . . . . . . . . 3 . HN parsed_1gb1 2
35 1 2 . . . . . . . . . 18 . O parsed_1gb1 2
36 1 1 . . . . . . . . . 18 . HN parsed_1gb1 2
36 1 2 . . . . . . . . . 3 . O parsed_1gb1 2
37 1 1 . . . . . . . . . 5 . HN parsed_1gb1 2
37 1 2 . . . . . . . . . 16 . O parsed_1gb1 2
38 1 1 . . . . . . . . . 16 . HN parsed_1gb1 2
38 1 2 . . . . . . . . . 5 . O parsed_1gb1 2
39 1 1 . . . . . . . . . 7 . HN parsed_1gb1 2
39 1 2 . . . . . . . . . 14 . O parsed_1gb1 2
40 1 1 . . . . . . . . . 14 . HN parsed_1gb1 2
40 1 2 . . . . . . . . . 7 . O parsed_1gb1 2
41 1 1 . . . . . . . . . 9 . HN parsed_1gb1 2
41 1 2 . . . . . . . . . 12 . O parsed_1gb1 2
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42 1 2 . . . . . . . . . 9 . O parsed_1gb1 2
43 1 1 . . . . . . . . . 4 . HN parsed_1gb1 2
43 1 2 . . . . . . . . . 50 . O parsed_1gb1 2
44 1 1 . . . . . . . . . 52 . HN parsed_1gb1 2
44 1 2 . . . . . . . . . 4 . O parsed_1gb1 2
45 1 1 . . . . . . . . . 6 . HN parsed_1gb1 2
45 1 2 . . . . . . . . . 52 . O parsed_1gb1 2
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46 1 2 . . . . . . . . . 6 . O parsed_1gb1 2
47 1 1 . . . . . . . . . 8 . HN parsed_1gb1 2
47 1 2 . . . . . . . . . 54 . O parsed_1gb1 2
48 1 1 . . . . . . . . . 42 . HN parsed_1gb1 2
48 1 2 . . . . . . . . . 55 . O parsed_1gb1 2
49 1 1 . . . . . . . . . 55 . HN parsed_1gb1 2
49 1 2 . . . . . . . . . 42 . O parsed_1gb1 2
50 1 1 . . . . . . . . . 44 . HN parsed_1gb1 2
50 1 2 . . . . . . . . . 53 . O parsed_1gb1 2
51 1 1 . . . . . . . . . 53 . HN parsed_1gb1 2
51 1 2 . . . . . . . . . 44 . O parsed_1gb1 2
52 1 1 . . . . . . . . . 46 . HN parsed_1gb1 2
52 1 2 . . . . . . . . . 51 . O parsed_1gb1 2
53 1 1 . . . . . . . . . 50 . HN parsed_1gb1 2
53 1 2 . . . . . . . . . 46 . O parsed_1gb1 2
54 1 1 . . . . . . . . . 51 . HN parsed_1gb1 2
54 1 2 . . . . . . . . . 46 . O parsed_1gb1 2
55 1 1 . . . . . . . . . 22 . O parsed_1gb1 2
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57 1 1 . . . . . . . . . 24 . O parsed_1gb1 2
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58 1 1 . . . . . . . . . 25 . O parsed_1gb1 2
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63 1 2 . . . . . . . . . 34 . HN parsed_1gb1 2
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64 1 2 . . . . . . . . . 35 . HN parsed_1gb1 2
65 1 1 . . . . . . . . . 34 . O parsed_1gb1 2
65 1 2 . . . . . . . . . 39 . HN parsed_1gb1 2
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68 1 1 . . . . . . . . . 46 . OD2 parsed_1gb1 2
68 1 2 . . . . . . . . . 48 . N parsed_1gb1 2
stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
_Dist_constraint_value.Tree_node_ID
_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
_Dist_constraint_value.Intensity_val
_Dist_constraint_value.Intensity_lower_val_err
_Dist_constraint_value.Intensity_upper_val_err
_Dist_constraint_value.Distance_val
_Dist_constraint_value.Distance_lower_bound_val
_Dist_constraint_value.Distance_upper_bound_val
_Dist_constraint_value.Entry_ID
_Dist_constraint_value.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
2 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
3 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
4 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
5 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
6 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
7 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
8 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
9 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
10 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
11 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
12 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
13 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
14 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
15 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
16 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
17 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
18 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
19 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
20 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
21 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
22 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
23 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
24 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
25 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
26 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
27 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
28 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
29 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
30 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
31 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
32 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
33 1 . . . . . 3.3 2.5 3.5 parsed_1gb1 2
34 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
35 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
36 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
37 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
38 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
39 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
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41 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
42 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
43 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
44 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
45 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
46 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
47 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
48 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
49 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
50 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
51 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
52 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
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54 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
55 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
56 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
57 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
58 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
59 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
60 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
61 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
62 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
63 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
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67 1 . . . . . 2.3 1.5 2.5 parsed_1gb1 2
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stop_
loop_
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_Org_constr_file_comment.Comment
;
set echo=true end
set wrnlev=5 end
B. Torsion angle restraints
The torsion angle restraints are derived from coupling constant and NOE data
using the conformational grid search program STEREOSEARCH [Nilges, M.,
Clore, G.M. & Gronenborn, A.M. (1990) Biopolymers 29, 813-822].
They are represented by a square well potential
[Clore et al. (1986) EMBO J. 5, 2729-2735]. The upper and lower limits are
given by i+j and i-j respectively, where the numbers are entered in the order
x,i,j,m. x is the force constant and m the exponent used to compute the
torsion angle restraints target function.
!!
;
save_
save_CNS/XPLOR_dihedral_6
_Torsion_angle_constraint_list.Sf_category torsion_angle_constraints
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loop_
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stop_
loop_
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!2
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94
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!56
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C. 1H and 15N resonance assignments of the B1 domain of protein G at 25C
and pH 4.34
The sample comprises two forms in a 7:3 mixture with and without the
N-terminal Met. Where the chemical shifts of the latter are different from the
former, a separate entry denoted by (m)is included to indicate the
minor form (i.e. without the N-terminal Met).
15N shifts are given only for the major species
Stereospecific assignments are denoted as follows: for the Ca methylene
protons of Gly, the asterisk indicates the Ha1 proton; for the Cb methylene
protons, the asterisk indicates the Hb3 proton; for the methyl groups of Val
and Leu, the asterisk indicates the Cg1H3 and Cd1H3 groups, respectively; for
the NH2 protons of Asn and Gln, the asterisk indicates the Hd21 and He21
protons, respectively, which are cis to Cb and Cg, respectively.
;
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