NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
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281000 |
1new   |
4744 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1554 |
data_1new_MR_file_constraints
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_Study_list.Entry_ID parsed_1new
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_1new 1
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save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_1new
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 1new "Master copy" parsed_1new
stop_
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save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_1new
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 1new.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1new 1
1 1new.mr . . DYANA/DIANA 2 peak "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_1new 1
1 1new.mr . . DYANA/DIANA 3 distance NOE simple 1554 parsed_1new 1
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_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_1new
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER ELECTRON TRANSPORT 10-FEB-98 1NEW
*TITLE CYTOCHROME C551.5, NMR, STRUCTURES 1 - 18 OF 35
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: CYTOCHROME C551.5;
*COMPND 3 CHAIN: NULL;
*COMPND 4 SYNONYM: CYTOCHROME C7, TRIHEME CYTOCHROME;
*COMPND 5 OTHER_DETAILS: CLASS III OF C-TYPE CYTOCHROMES, FULLY
*COMPND 6 OXIDIZED FORM
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: DESULFUROMONAS ACETOXIDANS
*KEYWDS ELECTRON TRANSPORT, CYTOCHROME, MULTIHEME CYTOCHROME,
*KEYWDS 2 CYTOCHROME C7
*EXPDTA NMR, 18 STRUCTURES
*AUTHOR M.ASSFALG,L.BANCI,I.BERTINI,M.BRUSCHI,P.TURANO
*REVDAT 3 26-JAN-10 1NEW 1 MODEL SPRSDE
*REVDAT 2 31-MAR-09 1NEW 1 REMOVE NON ASCII CHARACTERS
*REVDAT 1 29-APR-98 1NEW 0
*SPRSDE 26-JAN-10 1NEW 2NEW
*SPRSDE 29-APR-98 1NEW 1CFO
;
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save_DYANA/DIANA_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_1new
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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403 1 2 . . . . . . . . . 20 HIS HB3 parsed_1new 1
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405 1 2 . . . . . . . . . 22 GLU- HN parsed_1new 1
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413 1 2 . . . . . . . . . 21 ALA QB parsed_1new 1
414 1 1 . . . . . . . . . 20 HIS HB2 parsed_1new 1
414 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
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416 1 2 . . . . . . . . . 21 ALA HN parsed_1new 1
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419 1 2 . . . . . . . . . 21 ALA HA parsed_1new 1
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445 1 2 . . . . . . . . . 25 GLY HN parsed_1new 1
446 1 1 . . . . . . . . . 21 ALA QB parsed_1new 1
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452 1 2 . . . . . . . . . 22 GLU- HA parsed_1new 1
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455 1 2 . . . . . . . . . 22 GLU- HG2 parsed_1new 1
456 1 1 . . . . . . . . . 22 GLU- HN parsed_1new 1
456 1 2 . . . . . . . . . 22 GLU- HG3 parsed_1new 1
457 1 1 . . . . . . . . . 22 GLU- HN parsed_1new 1
457 1 2 . . . . . . . . . 23 LYS+ HN parsed_1new 1
458 1 1 . . . . . . . . . 22 GLU- HN parsed_1new 1
458 1 2 . . . . . . . . . 24 LEU HN parsed_1new 1
459 1 1 . . . . . . . . . 22 GLU- HN parsed_1new 1
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460 1 1 . . . . . . . . . 22 GLU- HA parsed_1new 1
460 1 2 . . . . . . . . . 22 GLU- HB2 parsed_1new 1
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461 1 2 . . . . . . . . . 22 GLU- HB3 parsed_1new 1
462 1 1 . . . . . . . . . 22 GLU- HA parsed_1new 1
462 1 2 . . . . . . . . . 22 GLU- HG2 parsed_1new 1
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586 1 1 . . . . . . . . . 26 CYSS HA parsed_1new 1
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589 1 2 . . . . . . . . . 27 ASP- HA parsed_1new 1
590 1 1 . . . . . . . . . 26 CYSS HB2 parsed_1new 1
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644 1 2 . . . . . . . . . 30 HIS HN parsed_1new 1
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646 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM QM3 parsed_1new 1
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649 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HT4A parsed_1new 1
650 1 1 . . . . . . . . . 29 CYSS HB3 parsed_1new 1
650 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QT4 parsed_1new 1
651 1 1 . . . . . . . . . 29 CYSS HB3 parsed_1new 1
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652 1 1 . . . . . . . . . 30 HIS HN parsed_1new 1
652 1 2 . . . . . . . . . 30 HIS HA parsed_1new 1
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674 1 2 . . . . . . . . . 34 PRO HD3 parsed_1new 1
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677 1 1 . . . . . . . . . 30 HIS HB3 parsed_1new 1
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687 1 2 . . . . . . . . . 32 GLY HA1 parsed_1new 1
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702 1 1 . . . . . . . . . 33 THR QG2 parsed_1new 1
702 1 2 . . . . . . . . . 34 PRO HG2 parsed_1new 1
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714 1 2 . . . . . . . . . 34 PRO HD2 parsed_1new 1
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715 1 2 . . . . . . . . . 34 PRO HD3 parsed_1new 1
716 1 1 . . . . . . . . . 34 PRO HB3 parsed_1new 1
716 1 2 . . . . . . . . . 34 PRO HG2 parsed_1new 1
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720 1 2 . . . . . . . . . 34 PRO HD3 parsed_1new 1
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848 1 2 . . . . . . . . . 38 ALA QB parsed_1new 1
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1356 1 2 . . . . . . . . . 64 GLY HN parsed_1new 1
1357 1 1 . . . . . . . . . 63 GLY HA2 parsed_1new 1
1357 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1358 1 1 . . . . . . . . . 63 GLY HA2 parsed_1new 1
1358 1 2 . . . . . . . . . 66 HIS HB2 parsed_1new 1
1359 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HN parsed_1new 1
1359 1 2 . . . . . . . . . 64 GLY HA1 parsed_1new 1
1360 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HN parsed_1new 1
1360 1 2 . . . . . . . . . 64 GLY HA2 parsed_1new 1
1361 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HN parsed_1new 1
1361 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1362 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HN parsed_1new 1
1362 1 2 . . . . . . . . . 66 HIS HN parsed_1new 1
1363 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HA1 parsed_1new 1
1363 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1364 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HA1 parsed_1new 1
1364 1 2 . . . . . . . . . 71 HEM HAM parsed_1new 1
1365 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HA1 parsed_1new 1
1365 1 2 . . . . . . . . . 71 HEM QM3 parsed_1new 1
1366 1 1 . . . . . . . . . 64 GLY HA2 parsed_1new 1
1366 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1367 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1367 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HA parsed_1new 1
1368 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1368 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HB2 parsed_1new 1
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1370 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1370 1 2 . . . . . . . . . 66 HIS HN parsed_1new 1
1371 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1371 1 2 . . . . . . . . . 66 HIS HB2 parsed_1new 1
1372 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HN parsed_1new 1
1372 1 2 . . . . . . . . . 71 HEM QM3 parsed_1new 1
1373 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HA parsed_1new 1
1373 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HB2 parsed_1new 1
1374 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HA parsed_1new 1
1374 1 2 . . . . . . . . . 65 CYSS HB3 parsed_1new 1
1375 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HA parsed_1new 1
1375 1 2 . . . . . . . . . 66 HIS HN parsed_1new 1
1376 1 1 . . . . . . . . . 65 CYSS HA parsed_1new 1
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1380 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HN parsed_1new 1
1380 1 2 . . . . . . . . . 66 HIS HA parsed_1new 1
1381 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HN parsed_1new 1
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1383 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HN parsed_1new 1
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1384 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HA parsed_1new 1
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1385 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HA parsed_1new 1
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1386 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HA parsed_1new 1
1386 1 2 . . . . . . . . . 67 ILE HN parsed_1new 1
1387 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HA parsed_1new 1
1387 1 2 . . . . . . . . . 67 ILE HA parsed_1new 1
1388 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HA parsed_1new 1
1388 1 2 . . . . . . . . . 67 ILE HB parsed_1new 1
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1390 1 2 . . . . . . . . . 67 ILE HN parsed_1new 1
1391 1 1 . . . . . . . . . 66 HIS HB2 parsed_1new 1
1391 1 2 . . . . . . . . . 71 HEM QM1 parsed_1new 1
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1392 1 2 . . . . . . . . . 67 ILE HN parsed_1new 1
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1394 1 2 . . . . . . . . . 67 ILE HA parsed_1new 1
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1421 1 2 . . . . . . . . . 68 LYS+ HA parsed_1new 1
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1425 1 1 . . . . . . . . . 68 LYS+ HA parsed_1new 1
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1427 1 1 . . . . . . . . . 68 LYS+ HB3 parsed_1new 1
1427 1 2 . . . . . . . . . 68 LYS+ HG2 parsed_1new 1
1428 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HA71 parsed_1new 1
1428 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HA72 parsed_1new 1
1429 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HA71 parsed_1new 1
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1430 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HA71 parsed_1new 1
1430 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB74 parsed_1new 1
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1432 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB73 parsed_1new 1
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1446 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM1 parsed_1new 1
1447 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HDM parsed_1new 1
1447 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QT2 parsed_1new 1
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1449 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QT2 parsed_1new 1
1450 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HT2A parsed_1new 1
1450 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QT2 parsed_1new 1
1451 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HT2A parsed_1new 1
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1452 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HT2A parsed_1new 1
1452 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
1453 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QT2 parsed_1new 1
1453 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HAM parsed_1new 1
1454 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QT2 parsed_1new 1
1454 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
1455 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HAM parsed_1new 1
1455 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
1456 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
1456 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HT4A parsed_1new 1
1457 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
1457 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QT4 parsed_1new 1
1458 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
1458 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM QM3 parsed_1new 1
1459 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM3 parsed_1new 1
1459 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM QT4 parsed_1new 1
1460 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HT4A parsed_1new 1
1460 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QT4 parsed_1new 1
1461 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HT4A parsed_1new 1
1461 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1462 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HT4A parsed_1new 1
1462 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM QM3 parsed_1new 1
1463 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QT4 parsed_1new 1
1463 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1464 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QT4 parsed_1new 1
1464 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM QM3 parsed_1new 1
1465 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HBM parsed_1new 1
1465 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1466 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1466 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HA61 parsed_1new 1
1467 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1467 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HA62 parsed_1new 1
1468 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1468 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB63 parsed_1new 1
1469 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
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1470 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1470 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM HT2A parsed_1new 1
1471 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1471 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM QT2 parsed_1new 1
1472 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM QM5 parsed_1new 1
1472 1 2 . . . . . . . . . 70 HEM QM3 parsed_1new 1
1473 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HGM parsed_1new 1
1473 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HA61 parsed_1new 1
1474 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HGM parsed_1new 1
1474 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HA62 parsed_1new 1
1475 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HGM parsed_1new 1
1475 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB63 parsed_1new 1
1476 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HGM parsed_1new 1
1476 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB64 parsed_1new 1
1477 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HA61 parsed_1new 1
1477 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HA62 parsed_1new 1
1478 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HA61 parsed_1new 1
1478 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB63 parsed_1new 1
1479 1 1 . . . . . . . . . 69 HEM HA61 parsed_1new 1
1479 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB64 parsed_1new 1
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1480 1 2 . . . . . . . . . 69 HEM HB63 parsed_1new 1
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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1
;
Table II. Experimental NOESY cross peak intensities (last column) and corresponding upper distance limits (5th column).
Heme I, III, and IV are called HEM 69, 70, 71, respectively.
residue atom residue atom distance cross peak intensity
;
1 1 4 68 parsed_1new 1
2
;
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HN 17 HIS HB2 6.9 654
HN 17 HIS HB3 7.5 263
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HA 4 VAL QG1 5.6 15582
HA 4 VAL QG2 6 9732
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HA 5 THR HB 5.4 972.2
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HB 4 VAL QG2 4.9 32300
HB 5 THR HN 4.7 2386
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HB 15 PHE HN 5.4 2216
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QG1 5 THR HA 7.5 1273
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QG1 6 TYR CZ 9 2023
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QG1 15 PHE CG 9.2 1724
QG1 15 PHE CZ 1 0 689.2
QG1 69 HEM HB63 6.4 3346
QG2 5 THR HN 6.5 2982
QG2 6 TYR CZ 1 0 80.7
QG2 15 PHE HN 8 267.8
QG2 15 PHE HB2 8 641.4
QG2 15 PHE CG 1 0 53.4
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QG2 18 LYS+ HN 8 177.4
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;
73 1 119 25 parsed_1new 1
3
;
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HN 6 TYR CG 5.9 4856
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HN 13 VAL HA 6.7 329.2
HN 13 VAL QG1 5.9 5564
HN 13 VAL QG2 8 676.8
HN 14 THR HA 4.4 4048
HN 14 THR QG2 8 82.6
HN 15 PHE HN 4.8 2472
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HA 6 TYR CG 4.8 6002
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HB2 7 GLU- HN 4.6 2588
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HB3 6 TYR CZ 7.1 980.4
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HB3 8 ASN HD21 5.8 1513
HB3 12 ASN HA 6.5 831.4
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;
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4
;
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HN 15 PHE CG 7.3 750.4
HN 16 ASP- HN 6.4 366.8
HA 15 PHE HB2 5 1696.4
HA 15 PHE HB3 4.6 2698
HA 16 ASP- HN 5.2 1213
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HB2 15 PHE CZ 8.5 225
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HB3 15 PHE CZ 8.3 268.6
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;
450 1 478 25 parsed_1new 1
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