Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | subsubtype |
|
|
429193 | 2j4m RC | 7285 | cing | 4-filtered-FRED | Wattos | check | violation | distance |
data_2j4m
save_distance_constraint_statistics_1
_Distance_constraint_stats_list.Sf_category distance_constraint_statistics
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_list_ID 1
_Distance_constraint_stats_list.Constraint_count 1410
_Distance_constraint_stats_list.Viol_count 910
_Distance_constraint_stats_list.Viol_total 164.134
_Distance_constraint_stats_list.Viol_max 0.259
_Distance_constraint_stats_list.Viol_rms 0.0141
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_all_restraints 0.0032
_Distance_constraint_stats_list.Viol_average_violations_only 0.0301
_Distance_constraint_stats_list.Cutoff_violation_report 0.500
_Distance_constraint_stats_list.Details
;
Description of the tags in this list:
* 1 * Administrative tag
* 2 * Administrative tag
* 3 * Administrative tag
* 4 * ID of the restraint list.
* 5 * Number of restraints in list.
* 6 * Number of violated restraints (each model violation is used).
* 7 * Sum of violations in Angstrom.
* 8 * Maximum violation of a restraint without averaging in any way.
* 9 * Rms of violations over all restraints.
* 10 * Average violation over all restraints.
* 11 * Average violation over violated restraints.
This violation is averaged over only those models in which the restraint is violated.
These definitions are from: Doreleijers, et al., J. Mol. Biol. 281, 149-164 (1998).
* 12 * Threshold for reporting violations (in Angstrom) in the last columns of the next table.
* 13 * This tag
Description of the tags in the per residue table below:
* 1 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 2 * Residue number
* 3 * Residue name
* 4 * Maximum violation in ensemble of models (without any averaging)
* 5 * Model number with the maximum violation
* 6 * Number of models with a violation above cutoff
* 7 * List of models (1 character per model) with a violation above cutoff.
An '*' marks a violation above the cutoff. A '+' indicates the largest
violation above the cutoff and a '-' marks the smallest violation over cutoff.
For models 5, 15, 25,... a ' ' is replaced by a '.'.
For models 10, 20, 30,... a ' ' is replaced by a digit starting at 1.
* 8 * Administrative tag
* 9 * Administrative tag
Description of the tags in the per restraint table below:
* 1 * Restraint ID within restraint list.
First node, FIRST member, first atom's:
* 2 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 3 * Residue number
* 4 * Residue name
* 5 * Name of (pseudo-)atom
First node, SECOND member, first atom's:
* 6 * Chain identifier (can be absent if none defined)
* 7 * Residue number
* 8 * Residue name
* 9 * Name of (pseudo-)atom
FIRST node's:
* 10 * Target distance value (Angstrom)
* 11 * Lower bound distance (Angstrom)
* 12 * Upper bound distance (Angstrom)
* 13 * Average distance in ensemble of models
* 14 * Minimum distance in ensemble of models
* 15 * Maximum distance in ensemble of models
* 16 * Maximum violation (without any averaging)
* 17 * Model number with the maximum violation
* 18 * Number of models with a violation above cutoff
* 19 * List of models with a violation above cutoff. See description above.
* 20 * Administrative tag
* 21 * Administrative tag
;
loop_
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Atom_comp_ID
_Distance_constraint_stats_per_res.Total_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation
_Distance_constraint_stats_per_res.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_count
_Distance_constraint_stats_per_res.Over_cutoff_viol_per_model
1 2 MET 0.521 0.054 3 0 "[ . ]"
1 3 ALA 1.098 0.137 3 0 "[ . ]"
1 4 CYS 0.086 0.021 3 0 "[ . ]"
1 5 TRP 0.384 0.045 4 0 "[ . ]"
1 6 ALA 0.418 0.066 5 0 "[ . ]"
1 7 GLN 0.459 0.043 5 0 "[ . ]"
1 8 SER 0.014 0.014 5 0 "[ . ]"
1 9 GLN 0.174 0.025 6 0 "[ . ]"
1 10 GLY 0.120 0.023 2 0 "[ . ]"
1 11 TYR 0.490 0.058 5 0 "[ . ]"
1 12 ASN 0.092 0.060 4 0 "[ . ]"
1 13 CYS 0.349 0.064 3 0 "[ . ]"
1 14 CYS 0.942 0.156 4 0 "[ . ]"
1 15 ASN 0.798 0.136 1 0 "[ . ]"
1 16 ASN 0.449 0.058 5 0 "[ . ]"
1 17 PRO 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 18 SER 0.434 0.058 4 0 "[ . ]"
1 19 SER 0.393 0.055 6 0 "[ . ]"
1 20 THR 1.658 0.138 2 0 "[ . ]"
1 21 LYS 0.084 0.016 5 0 "[ . ]"
1 22 VAL 1.738 0.252 6 0 "[ . ]"
1 23 GLU 0.364 0.040 3 0 "[ . ]"
1 24 TYR 1.554 0.252 6 0 "[ . ]"
1 25 THR 0.318 0.043 6 0 "[ . ]"
1 26 ASP 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
1 27 ALA 0.382 0.055 5 0 "[ . ]"
1 28 SER 0.209 0.043 6 0 "[ . ]"
1 29 GLY 0.253 0.055 5 0 "[ . ]"
1 30 GLN 0.431 0.057 6 0 "[ . ]"
1 31 TRP 0.265 0.033 3 0 "[ . ]"
1 32 GLY 0.267 0.057 2 0 "[ . ]"
1 33 VAL 0.419 0.057 2 0 "[ . ]"
1 34 GLN 0.999 0.058 4 0 "[ . ]"
1 35 ASN 0.571 0.050 4 0 "[ . ]"
1 36 GLY 0.002 0.002 2 0 "[ . ]"
1 37 GLN 0.164 0.023 4 0 "[ . ]"
1 38 TRP 0.292 0.046 5 0 "[ . ]"
1 39 CYS 0.445 0.156 4 0 "[ . ]"
1 40 GLY 0.001 0.001 2 0 "[ . ]"
1 41 ILE 1.569 0.073 3 0 "[ . ]"
1 42 ASP 0.249 0.066 5 0 "[ . ]"
1 43 TYR 0.641 0.073 3 0 "[ . ]"
1 44 SER 0.506 0.074 3 0 "[ . ]"
1 45 TYR 1.956 0.137 3 0 "[ . ]"
1 46 GLY 0.448 0.082 5 0 "[ . ]"
1 47 GLN 0.330 0.054 3 0 "[ . ]"
1 48 ASN 0.030 0.017 4 0 "[ . ]"
1 49 GLN 1.245 0.259 2 0 "[ . ]"
1 50 GLY 0.456 0.259 2 0 "[ . ]"
1 51 ASN 0.203 0.055 4 0 "[ . ]"
1 52 GLU 0.049 0.017 4 0 "[ . ]"
1 53 SER 0.049 0.025 3 0 "[ . ]"
1 54 CYS 0.423 0.136 4 0 "[ . ]"
1 55 THR 1.600 0.136 4 0 "[ . ]"
1 56 GLY 0.072 0.020 1 0 "[ . ]"
1 57 ASN 0.591 0.116 3 0 "[ . ]"
1 58 GLY 0.532 0.082 4 0 "[ . ]"
1 59 SER 0.240 0.074 5 0 "[ . ]"
1 60 TYR 0.339 0.053 4 0 "[ . ]"
1 61 PRO 0.202 0.046 6 0 "[ . ]"
1 62 CYS 0.161 0.042 2 0 "[ . ]"
1 63 CYS 0.330 0.042 5 0 "[ . ]"
1 64 ASN 0.750 0.066 4 0 "[ . ]"
1 65 THR 1.002 0.082 3 0 "[ . ]"
1 66 CYS 0.731 0.102 3 0 "[ . ]"
1 67 GLN 0.639 0.074 5 0 "[ . ]"
1 68 ALA 1.544 0.140 5 0 "[ . ]"
1 69 THR 1.886 0.165 6 0 "[ . ]"
1 70 TYR 0.958 0.074 3 0 "[ . ]"
1 71 THR 0.744 0.055 1 0 "[ . ]"
1 72 ASP 0.306 0.094 4 0 "[ . ]"
1 73 GLY 0.053 0.039 4 0 "[ . ]"
1 74 ASP 0.489 0.080 5 0 "[ . ]"
1 75 GLY 0.136 0.036 6 0 "[ . ]"
1 76 ASP 0.551 0.094 4 0 "[ . ]"
1 77 TRP 1.600 0.165 6 0 "[ . ]"
1 78 ALA 1.749 0.079 4 0 "[ . ]"
1 79 PHE 0.001 0.001 1 0 "[ . ]"
1 80 GLU 0.365 0.054 6 0 "[ . ]"
1 81 ASN 0.070 0.019 3 0 "[ . ]"
1 82 GLY 0.015 0.011 6 0 "[ . ]"
1 83 ASN 0.234 0.054 6 0 "[ . ]"
1 84 TRP 0.161 0.040 6 0 "[ . ]"
1 85 CYS 0.325 0.046 6 0 "[ . ]"
1 86 GLY 0.387 0.053 4 0 "[ . ]"
1 87 ILE 2.010 0.184 5 0 "[ . ]"
1 88 LYS 0.684 0.091 6 0 "[ . ]"
1 89 ASN 0.400 0.080 5 0 "[ . ]"
1 90 SER 0.554 0.085 4 0 "[ . ]"
1 91 CYS 0.761 0.091 4 0 "[ . ]"
1 92 LYS 2.042 0.184 5 0 "[ . ]"
1 93 GLN 0.586 0.086 2 0 "[ . ]"
1 94 GLN 0.707 0.176 6 0 "[ . ]"
1 95 PRO 0.640 0.176 6 0 "[ . ]"
1 96 GLN 0.478 0.128 4 0 "[ . ]"
1 97 ASN 0.000 0.000 . 0 "[ . ]"
stop_
loop_
_Distance_constraint_stats.Restraint_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_1_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_entity_assembly_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_index_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_comp_ID
_Distance_constraint_stats.Atom_2_ID
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val
_Distance_constraint_stats.Distance_average
_Distance_constraint_stats.Distance_minimum
_Distance_constraint_stats.Distance_maximum
_Distance_constraint_stats.Max_violation
_Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model
_Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID
1 1 2 MET HA 1 2 MET ME 5.000 . 5.000 3.411 3.055 4.013 . 0 0 "[ . ]" 1
2 1 2 MET HA 1 3 ALA MB 5.000 . 5.000 4.141 4.098 4.166 . 0 0 "[ . ]" 1
3 1 2 MET HA 1 3 ALA H 3.500 . 3.500 2.234 2.183 2.265 . 0 0 "[ . ]" 1
4 1 2 MET QB 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 3.868 3.660 4.017 . 0 0 "[ . ]" 1
5 1 2 MET ME 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 4.825 4.124 5.036 0.036 3 0 "[ . ]" 1
6 1 2 MET QG 1 3 ALA MB 5.000 . 5.000 4.767 4.153 5.027 0.027 5 0 "[ . ]" 1
7 1 2 MET QG 1 3 ALA H 5.000 . 5.000 3.958 3.582 4.875 . 0 0 "[ . ]" 1
8 1 2 MET HA 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 3.514 3.453 3.578 . 0 0 "[ . ]" 1
9 1 2 MET QB 1 7 GLN QE 5.000 . 5.000 4.709 4.128 5.016 0.016 4 0 "[ . ]" 1
10 1 2 MET QB 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 4.805 4.437 5.046 0.046 6 0 "[ . ]" 1
11 1 2 MET QB 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 4.072 3.330 4.460 . 0 0 "[ . ]" 1
12 1 2 MET ME 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 3.872 2.824 5.012 0.012 5 0 "[ . ]" 1
13 1 2 MET QG 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 4.046 3.294 4.793 . 0 0 "[ . ]" 1
14 1 2 MET H 1 47 GLN HA 5.000 . 5.000 4.945 4.588 5.034 0.034 3 0 "[ . ]" 1
15 1 2 MET H 1 47 GLN QG 5.000 . 5.000 5.028 5.006 5.054 0.054 3 0 "[ . ]" 1
16 1 3 ALA H 1 3 ALA MB 3.500 . 3.500 2.758 2.747 2.773 . 0 0 "[ . ]" 1
17 1 3 ALA HA 1 4 CYS HA 5.000 . 5.000 4.711 4.685 4.743 . 0 0 "[ . ]" 1
18 1 3 ALA HA 1 4 CYS H 3.500 . 3.500 2.898 2.881 2.925 . 0 0 "[ . ]" 1
19 1 3 ALA MB 1 4 CYS HA 5.000 . 5.000 4.164 4.147 4.195 . 0 0 "[ . ]" 1
20 1 3 ALA MB 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 3.626 3.616 3.635 . 0 0 "[ . ]" 1
21 1 3 ALA H 1 4 CYS H 5.000 . 5.000 2.067 2.037 2.111 . 0 0 "[ . ]" 1
22 1 3 ALA MB 1 7 GLN QE 5.000 . 5.000 4.973 4.898 5.016 0.016 4 0 "[ . ]" 1
23 1 3 ALA MB 1 7 GLN QG 5.000 . 5.000 5.023 4.982 5.043 0.043 5 0 "[ . ]" 1
24 1 3 ALA MB 1 44 SER QB 5.000 . 5.000 5.043 5.021 5.062 0.062 3 0 "[ . ]" 1
25 1 3 ALA MB 1 45 TYR QB 5.000 . 5.000 3.430 2.969 4.275 . 0 0 "[ . ]" 1
26 1 3 ALA MB 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 3.984 3.913 4.072 . 0 0 "[ . ]" 1
27 1 3 ALA MB 1 45 TYR QE 5.000 . 5.000 5.093 5.061 5.137 0.137 3 0 "[ . ]" 1
28 1 3 ALA H 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 2.407 1.796 2.710 0.004 3 0 "[ . ]" 1
29 1 4 CYS HA 1 5 TRP HD1 5.000 . 5.000 4.011 3.750 4.272 . 0 0 "[ . ]" 1
30 1 4 CYS HA 1 5 TRP H 5.000 . 5.000 2.250 2.145 2.376 . 0 0 "[ . ]" 1
31 1 4 CYS H 1 5 TRP H 5.000 . 5.000 4.587 4.505 4.628 . 0 0 "[ . ]" 1
32 1 4 CYS HA 1 6 ALA MB 5.000 . 5.000 4.882 4.645 5.021 0.021 3 0 "[ . ]" 1
33 1 4 CYS HA 1 7 GLN H 5.000 . 5.000 4.834 4.717 4.909 . 0 0 "[ . ]" 1
34 1 4 CYS QB 1 7 GLN QB 5.000 . 5.000 4.052 3.347 4.342 . 0 0 "[ . ]" 1
35 1 4 CYS QB 1 7 GLN H 5.000 . 5.000 3.176 2.493 3.419 . 0 0 "[ . ]" 1
36 1 4 CYS H 1 7 GLN QG 5.000 . 5.000 3.084 2.896 3.284 . 0 0 "[ . ]" 1
37 1 4 CYS H 1 7 GLN H 5.000 . 5.000 4.762 4.521 4.998 . 0 0 "[ . ]" 1
38 1 4 CYS H 1 42 ASP QB 5.000 . 5.000 4.873 4.389 5.018 0.018 3 0 "[ . ]" 1
39 1 4 CYS HA 1 45 TYR QB 5.000 . 5.000 2.257 2.080 2.393 . 0 0 "[ . ]" 1
40 1 4 CYS HA 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 3.776 3.481 4.152 . 0 0 "[ . ]" 1
41 1 4 CYS QB 1 45 TYR QB 5.000 . 5.000 2.538 2.200 2.926 . 0 0 "[ . ]" 1
42 1 4 CYS QB 1 45 TYR QD 5.000 . 5.000 2.437 1.994 2.948 . 0 0 "[ . ]" 1
43 1 5 TRP HA 1 5 TRP HD1 5.000 . 5.000 4.389 4.298 4.467 . 0 0 "[ . ]" 1
44 1 5 TRP HA 1 5 TRP HE3 5.000 . 5.000 4.257 4.155 4.365 . 0 0 "[ . ]" 1
45 1 5 TRP H 1 5 TRP HD1 5.000 . 5.000 2.650 2.285 2.970 . 0 0 "[ . ]" 1
46 1 5 TRP HA 1 6 ALA MB 5.000 . 5.000 4.954 4.940 4.964 . 0 0 "[ . ]" 1
47 1 5 TRP HA 1 6 ALA H 5.000 . 5.000 3.432 3.387 3.465 . 0 0 "[ . ]" 1
48 1 5 TRP QB 1 6 ALA MB 5.000 . 5.000 4.690 4.653 4.765 . 0 0 "[ . ]" 1
49 1 5 TRP HE3 1 6 ALA HA 3.500 . 3.500 2.568 2.347 2.854 . 0 0 "[ . ]" 1
50 1 5 TRP HE3 1 6 ALA MB 5.000 . 5.000 3.592 3.284 3.969 . 0 0 "[ . ]" 1
51 1 5 TRP HH2 1 6 ALA HA 5.000 . 5.000 5.008 4.967 5.026 0.026 3 0 "[ . ]" 1
52 1 5 TRP HH2 1 6 ALA MB 5.000 . 5.000 4.050 3.760 4.346 . 0 0 "[ . ]" 1
53 1 5 TRP HZ3 1 6 ALA HA 5.000 . 5.000 3.216 3.016 3.454 . 0 0 "[ . ]" 1
54 1 5 TRP HZ3 1 6 ALA MB 5.000 . 5.000 3.491 3.023 4.023 . 0 0 "[ . ]" 1
55 1 5 TRP HE3 1 9 GLN QE 5.000 . 5.000 3.366 2.322 4.343 . 0 0 "[ . ]" 1
56 1 5 TRP HE3 1 9 GLN QG 5.000 . 5.000 4.412 3.599 5.008 0.008 4 0 "[ . ]" 1
57 1 5 TRP HZ3 1 9 GLN QE 5.000 . 5.000 3.011 2.180 3.438 . 0 0 "[ . ]" 1
58 1 5 TRP HE3 1 28 SER QB 5.000 . 5.000 4.690 3.869 5.008 0.008 3 0 "[ . ]" 1
59 1 5 TRP HZ3 1 28 SER QB 5.000 . 5.000 3.103 2.731 3.526 . 0 0 "[ . ]" 1
60 1 5 TRP HZ3 1 28 SER HA 5.000 . 5.000 4.921 4.499 5.008 0.008 1 0 "[ . ]" 1
61 1 5 TRP HH2 1 29 GLY QA 5.000 . 5.000 2.856 2.504 3.245 . 0 0 "[ . ]" 1
62 1 5 TRP HZ2 1 29 GLY QA 5.000 . 5.000 3.030 2.596 3.277 . 0 0 "[ . ]" 1
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314 1 20 THR HB 1 41 ILE MD 5.000 . 5.000 3.287 3.250 3.358 . 0 0 "[ . ]" 1
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_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_lower_bound_val
_Distance_constraint_stats.Node_1_distance_upper_bound_val
_Distance_constraint_stats.Distance_average
_Distance_constraint_stats.Distance_minimum
_Distance_constraint_stats.Distance_maximum
_Distance_constraint_stats.Max_violation
_Distance_constraint_stats.Max_violation_model_number
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_violation_count
_Distance_constraint_stats.Over_cutoff_viol_per_model
_Distance_constraint_stats.Distance_constraint_stats_ID
1 1 6 ALA O 1 11 TYR H 2.300 . 2.500 2.397 2.107 2.510 0.010 1 0 "[ . ]" 2
2 1 6 ALA O 1 11 TYR N 3.300 2.500 3.500 3.107 2.888 3.221 . 0 0 "[ . ]" 2
3 1 34 GLN H 1 37 GLN O 2.300 . 2.500 2.295 1.981 2.508 0.008 6 0 "[ . ]" 2
4 1 34 GLN N 1 37 GLN O 3.300 2.500 3.500 3.081 2.844 3.300 . 0 0 "[ . ]" 2
5 1 32 GLY H 1 39 CYS O 2.300 . 2.500 2.087 1.845 2.399 . 0 0 "[ . ]" 2
6 1 32 GLY N 1 39 CYS O 3.300 2.500 3.500 2.982 2.788 3.215 . 0 0 "[ . ]" 2
7 1 32 GLY O 1 39 CYS H 2.300 . 2.500 2.392 2.147 2.516 0.016 4 0 "[ . ]" 2
8 1 32 GLY O 1 39 CYS N 3.300 2.500 3.500 3.152 2.898 3.362 . 0 0 "[ . ]" 2
9 1 24 TYR H 1 31 TRP O 2.300 . 2.500 2.367 2.083 2.508 0.008 5 0 "[ . ]" 2
10 1 24 TYR N 1 31 TRP O 3.300 2.500 3.500 3.250 3.001 3.382 . 0 0 "[ . ]" 2
11 1 26 ASP H 1 29 GLY O 2.300 . 2.500 2.506 2.503 2.509 0.009 3 0 "[ . ]" 2
12 1 26 ASP N 1 29 GLY O 3.300 2.500 3.500 3.302 3.119 3.447 . 0 0 "[ . ]" 2
13 1 70 TYR H 1 77 TRP O 2.300 . 2.500 2.037 1.970 2.092 . 0 0 "[ . ]" 2
14 1 70 TYR N 1 77 TRP O 3.300 2.500 3.500 3.006 2.936 3.059 . 0 0 "[ . ]" 2
15 1 70 TYR O 1 77 TRP H 2.300 . 2.500 1.998 1.856 2.180 . 0 0 "[ . ]" 2
16 1 70 TYR O 1 77 TRP N 3.300 2.500 3.500 2.507 2.492 2.521 0.008 6 0 "[ . ]" 2
17 1 72 ASP H 1 75 GLY O 2.300 . 2.500 1.882 1.790 2.077 0.010 1 0 "[ . ]" 2
18 1 72 ASP N 1 75 GLY O 3.300 2.500 3.500 2.716 2.618 2.894 . 0 0 "[ . ]" 2
19 1 78 ALA O 1 85 CYS H 2.300 . 2.500 2.410 2.127 2.526 0.026 5 0 "[ . ]" 2
20 1 78 ALA O 1 85 CYS N 3.300 2.500 3.500 3.119 2.962 3.249 . 0 0 "[ . ]" 2
21 1 78 ALA H 1 85 CYS O 2.300 . 2.500 2.050 1.813 2.176 . 0 0 "[ . ]" 2
22 1 78 ALA N 1 85 CYS O 3.300 2.500 3.500 2.988 2.760 3.115 . 0 0 "[ . ]" 2
23 1 80 GLU H 1 83 ASN O 2.300 . 2.500 2.439 2.277 2.508 0.008 5 0 "[ . ]" 2
24 1 80 GLU N 1 83 ASN O 3.300 2.500 3.500 3.298 3.136 3.404 . 0 0 "[ . ]" 2
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