segName='   A'
seq="""
GLY SER HIS LEU GLY ASP LEU LYS TYR SER 
LEU GLU ARG LEU ARG GLU ILE LEU GLU ARG 
LEU GLU GLU ASN PRO SER GLU LYS GLN ILE 
VAL GLU ALA ILE ARG ALA ILE VAL GLU ASN 
ASN ALA GLN ILE VAL GLU ALA ILE ARG ALA 
ILE VAL GLU ASN ASN ALA GLN ILE VAL GLU 
ASN ASN ARG ALA ILE ILE GLU ALA LEU GLU 
ALA ILE GLY VAL ASP GLN LYS ILE LEU GLU 
GLU MET LYS LYS GLN LEU LYS ASP LEU LYS 
ARG SER LEU GLU ARG GLY
"""
patch_list=[]
seqType='prot'
seqSplit = seq.split()
#print "finished reading ["+`len(seqSplit)`+"] residue(s) for a ["+seqType+"] type segi: ["+segName+"]"
