segName='   C'
seq="""
MET PRO GLY SER LEU SER GLY ILE ILE ILE 
TYR VAL THR VAL ALA ALA VAL VAL LEU ILE 
VAL ALA VAL PHE VAL CYS LYS SER LEU LEU 
TRP LYS LYS VAL LEU PRO
"""
patch_list=[]
seqType='prot'
seqSplit = seq.split()
#print "finished reading ["+`len(seqSplit)`+"] residue(s) for a ["+seqType+"] type segi: ["+segName+"]"
