segName='   A'
seq="""
GLY SER SER GLY SER SER GLY GLN ALA ASP 
ALA GLY PRO ASP LYS GLU LEU THR LEU PRO 
VAL ASP SER THR THR LEU ASP GLY SER LYS 
SER SER ASP ASP GLN LYS ILE ILE SER TYR 
LEU TRP GLU LYS THR GLN GLY PRO ASP GLY 
VAL GLN LEU GLU ASN ALA ASN SER SER VAL 
ALA THR VAL THR GLY LEU GLN VAL GLY THR 
TYR VAL PHE THR LEU THR VAL LYS ASP GLU 
ARG ASN LEU GLN SER GLN SER SER VAL ASN 
VAL ILE VAL LYS GLU GLU SER GLY PRO SER 
SER GLY
"""
patch_list=[]
seqType='prot'
seqSplit = seq.split()
#print "finished reading ["+`len(seqSplit)`+"] residue(s) for a ["+seqType+"] type segi: ["+segName+"]"
