segName='   A'
seq="""
DG DG DG DA DA DG DG DG DC DG 
DC DG DA DA DG DC DA DT DT DC 
DG DC DG DA DG DG DT DA DG DG 
"""
patch_list=[]
seqType='dna'
seqSplit = seq.split()
#print "finished reading ["+`len(seqSplit)`+"] residue(s) for a ["+seqType+"] type segi: ["+segName+"]"
