segName='   A'
seq="""
MET ILE ILE ASN ASN LEU LYS LEU ILE ARG 
GLU LYS LYS LYS ILE SER GLN SER GLU LEU 
ALA ALA LEU LEU GLU VAL SER ARG GLN THR 
ILE ASN GLY ILE GLU LYS ASN LYS TYR ASN 
PRO SER LEU GLN LEU ALA LEU LYS ILE ALA 
TYR TYR LEU ASN THR PRO LEU GLU ASP ILE 
PHE GLN TRP GLN PRO GLU
"""
patch_list=[]
seqType='prot'
seqSplit = seq.split()
#print "finished reading ["+`len(seqSplit)`+"] residue(s) for a ["+seqType+"] type segi: ["+segName+"]"
