segName='   B'
seq="""
GLY PRO LEU GLY SER MET ALA GLU VAL GLU 
GLU THR LEU LYS ARG LEU GLN SER GLN LYS 
GLY VAL GLN GLY ILE ILE VAL VAL ASN THR 
GLU GLY ILE PRO ILE LYS SER THR MET ASP 
ASN PRO THR THR THR GLN TYR ALA SER LEU 
MET HIS SER PHE ILE LEU LYS ALA ARG SER 
THR VAL ARG ASP ILE ASP PRO GLN ASN ASP 
LEU THR PHE LEU ARG ILE ARG SER LYS LYS 
ASN GLU ILE MET VAL ALA PRO ASP LYS ASP 
TYR PHE LEU ILE VAL ILE GLN ASN PRO THR 
GLU
"""
patch_list=[]
seqType='prot'
seqSplit = seq.split()
#print "finished reading ["+`len(seqSplit)`+"] residue(s) for a ["+seqType+"] type segi: ["+segName+"]"
