NMR Restraints Grid
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NMR Restraints Grid |
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Result table
| image | mrblock_id | pdb_id | bmrb_id | cing | stage | program | type | subtype | item_count |
|
|
618585 |
5t7c   |
18627 | cing | 2-parsed | STAR | entry | full | 1227 |
data_5t7c_MR_file_constraints
save_Conversion_project
_Study_list.Sf_category study_list
_Study_list.Entry_ID parsed_5t7c
_Study_list.ID 1
loop_
_Study.ID
_Study.Name
_Study.Type
_Study.Details
_Study.Entry_ID
_Study.Study_list_ID
1 "Conversion project" NMR . parsed_5t7c 1
stop_
save_
save_entry_information
_Entry.Sf_category entry_information
_Entry.ID parsed_5t7c
_Entry.Title "Original constraint list(s)"
_Entry.Version_type original
_Entry.Submission_date .
_Entry.Accession_date .
_Entry.Last_release_date .
_Entry.Original_release_date .
_Entry.Origination .
_Entry.NMR_STAR_version 3.1
_Entry.Original_NMR_STAR_version .
_Entry.Experimental_method NMR
_Entry.Experimental_method_subtype .
loop_
_Related_entries.Database_name
_Related_entries.Database_accession_code
_Related_entries.Relationship
_Related_entries.Entry_ID
PDB 5t7c "Master copy" parsed_5t7c
stop_
save_
save_global_Org_file_characteristics
_Constraint_stat_list.Sf_category constraint_statistics
_Constraint_stat_list.Entry_ID parsed_5t7c
_Constraint_stat_list.ID 1
loop_
_Constraint_file.ID
_Constraint_file.Constraint_filename
_Constraint_file.Software_ID
_Constraint_file.Software_label
_Constraint_file.Software_name
_Constraint_file.Block_ID
_Constraint_file.Constraint_type
_Constraint_file.Constraint_subtype
_Constraint_file.Constraint_subsubtype
_Constraint_file.Constraint_number
_Constraint_file.Entry_ID
_Constraint_file.Constraint_stat_list_ID
1 5t7c.mr . . "MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5t7c 1
1 5t7c.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 379 parsed_5t7c 1
1 5t7c.mr . . XPLOR/CNS 3 distance "hydrogen bond" simple 124 parsed_5t7c 1
1 5t7c.mr . . XPLOR/CNS 4 "dihedral angle" "Not applicable" "Not applicable" 215 parsed_5t7c 1
1 5t7c.mr . . XPLOR/CNS 5 distance NOE simple 509 parsed_5t7c 1
1 5t7c.mr . . "MR format" 6 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 parsed_5t7c 1
stop_
save_
save_MR_file_comment_1
_Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment
_Org_constr_file_comment.Entry_ID parsed_5t7c
_Org_constr_file_comment.ID 1
_Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1
_Org_constr_file_comment.Block_ID 1
_Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos"
_Org_constr_file_comment.Comment
;
*HEADER MEMBRANE PROTEIN 02-SEP-16 5T7C
*TITLE SOLUTION STRUCTURE OF CALCIUM FREE, MYRISTOYLATED VISININ-LIKE PROTEIN
*TITLE 2 3
*COMPND MOL_ID: 1;
*COMPND 2 MOLECULE: HIPPOCALCIN-LIKE PROTEIN 1;
*COMPND 3 CHAIN: A;
*COMPND 4 SYNONYM: CALCIUM-BINDING PROTEIN BDR-1,HLP2,VISININ-LIKE PROTEIN 3,
*COMPND 5 VILIP-3;
*COMPND 6 ENGINEERED: YES;
*COMPND 7 OTHER_DETAILS: MYRISTOYL GROUP IS COVALENTLY ATTACHED TO THE N-
*COMPND 8 TERMINAL
*SOURCE MOL_ID: 1;
*SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: HOMO SAPIENS;
*SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: HUMAN;
*SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 9606;
*SOURCE 5 GENE: HPCAL1, BDR1;
*SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI;
*SOURCE 7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562
*KEYWDS CALMODULIN, HIPPOCALCIN, NEURONAL CALCIUM SENSOR, MEMBRANE PROTEIN
*EXPDTA SOLUTION NMR
*NUMMDL 10
*AUTHOR S.LIM,J.B.AMES
*REVDAT 1 12-JUL-17 5T7C 0
;
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5t7c
_Distance_constraint_list.ID 1
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 2
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_5t7c 1
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121 1 . . . parsed_5t7c 1
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Restraints for secondary structures
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30
;
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#helix8:146-156
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;
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#helix9:166-175
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#helix10:178-183
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47 "dAN(i,i+3) 3.5A helix10:178-183" 488 1 488 33 parsed_5t7c 1
48 "dAN(i,i+4) 5.0A helix10:178-183" 493 1 493 33 parsed_5t7c 1
49 "dAB(i,i+3) 2.9A helix10:178-183" 497 1 497 33 parsed_5t7c 1
stop_
loop_
_Dist_constraint_parse_err.ID
_Dist_constraint_parse_err.Content
_Dist_constraint_parse_err.Begin_line
_Dist_constraint_parse_err.Begin_column
_Dist_constraint_parse_err.End_line
_Dist_constraint_parse_err.End_column
_Dist_constraint_parse_err.Entry_ID
_Dist_constraint_parse_err.Distance_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 1: DistanceRestraints-SecondaryStructures.tbl" 1 1 1 63 parsed_5t7c 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_3
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5t7c
_Distance_constraint_list.ID 2
_Distance_constraint_list.Constraint_type "hydrogen bond"
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 3
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
1 1 . . . parsed_5t7c 2
2 1 . . . parsed_5t7c 2
3 1 . . . parsed_5t7c 2
4 1 . . . parsed_5t7c 2
5 1 . . . parsed_5t7c 2
6 1 . . . parsed_5t7c 2
7 1 . . . parsed_5t7c 2
8 1 . . . parsed_5t7c 2
9 1 . . . parsed_5t7c 2
10 1 . . . parsed_5t7c 2
11 1 . . . parsed_5t7c 2
12 1 . . . parsed_5t7c 2
13 1 . . . parsed_5t7c 2
14 1 . . . parsed_5t7c 2
15 1 . . . parsed_5t7c 2
16 1 . . . parsed_5t7c 2
17 1 . . . parsed_5t7c 2
18 1 . . . parsed_5t7c 2
19 1 . . . parsed_5t7c 2
20 1 . . . parsed_5t7c 2
21 1 . . . parsed_5t7c 2
22 1 . . . parsed_5t7c 2
23 1 . . . parsed_5t7c 2
24 1 . . . parsed_5t7c 2
25 1 . . . parsed_5t7c 2
26 1 . . . parsed_5t7c 2
27 1 . . . parsed_5t7c 2
28 1 . . . parsed_5t7c 2
29 1 . . . parsed_5t7c 2
30 1 . . . parsed_5t7c 2
31 1 . . . parsed_5t7c 2
32 1 . . . parsed_5t7c 2
33 1 . . . parsed_5t7c 2
34 1 . . . parsed_5t7c 2
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41 1 . . . parsed_5t7c 2
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43 1 . . . parsed_5t7c 2
44 1 . . . parsed_5t7c 2
45 1 . . . parsed_5t7c 2
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47 1 . . . parsed_5t7c 2
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55 1 . . . parsed_5t7c 2
56 1 . . . parsed_5t7c 2
57 1 . . . parsed_5t7c 2
58 1 . . . parsed_5t7c 2
59 1 . . . parsed_5t7c 2
60 1 . . . parsed_5t7c 2
61 1 . . . parsed_5t7c 2
62 1 . . . parsed_5t7c 2
63 1 . . . parsed_5t7c 2
64 1 . . . parsed_5t7c 2
65 1 . . . parsed_5t7c 2
66 1 . . . parsed_5t7c 2
67 1 . . . parsed_5t7c 2
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86 1 . . . parsed_5t7c 2
87 1 . . . parsed_5t7c 2
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100 1 . . . parsed_5t7c 2
101 1 . . . parsed_5t7c 2
102 1 . . . parsed_5t7c 2
103 1 . . . parsed_5t7c 2
104 1 . . . parsed_5t7c 2
105 1 . . . parsed_5t7c 2
106 1 . . . parsed_5t7c 2
107 1 . . . parsed_5t7c 2
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109 1 . . . parsed_5t7c 2
110 1 . . . parsed_5t7c 2
111 1 . . . parsed_5t7c 2
112 1 . . . parsed_5t7c 2
113 1 . . . parsed_5t7c 2
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115 1 . . . parsed_5t7c 2
116 1 . . . parsed_5t7c 2
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119 1 . . . parsed_5t7c 2
120 1 . . . parsed_5t7c 2
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122 1 . . . parsed_5t7c 2
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124 1 . . . parsed_5t7c 2
stop_
loop_
_Dist_constraint.Tree_node_member_constraint_ID
_Dist_constraint.Tree_node_member_node_ID
_Dist_constraint.Constraint_tree_node_member_ID
_Dist_constraint.Assembly_atom_ID
_Dist_constraint.Entity_assembly_ID
_Dist_constraint.Entity_ID
_Dist_constraint.Comp_index_ID
_Dist_constraint.Seq_ID
_Dist_constraint.Comp_ID
_Dist_constraint.Atom_ID
_Dist_constraint.Resonance_ID
_Dist_constraint.Auth_asym_ID
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_Dist_constraint.Auth_comp_ID
_Dist_constraint.Auth_atom_ID
_Dist_constraint.Entry_ID
_Dist_constraint.Distance_constraint_list_ID
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3 1 2 . . . . . . . . . 29 . N parsed_5t7c 2
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8 1 2 . . . . . . . . . 31 . HN parsed_5t7c 2
9 1 1 . . . . . . . . . 28 . O parsed_5t7c 2
9 1 2 . . . . . . . . . 32 . N parsed_5t7c 2
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68 1 2 . . . . . . . . . 106 . HN parsed_5t7c 2
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70 1 2 . . . . . . . . . 122 . HN parsed_5t7c 2
71 1 1 . . . . . . . . . 119 . O parsed_5t7c 2
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72 1 1 . . . . . . . . . 119 . O parsed_5t7c 2
72 1 2 . . . . . . . . . 123 . HN parsed_5t7c 2
73 1 1 . . . . . . . . . 120 . O parsed_5t7c 2
73 1 2 . . . . . . . . . 124 . N parsed_5t7c 2
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74 1 2 . . . . . . . . . 124 . HN parsed_5t7c 2
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80 1 2 . . . . . . . . . 127 . HN parsed_5t7c 2
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!!!! phi !!!!!
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11 phi - helix
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18
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45 phi - helix
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39
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82 phi - helix
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57
;
118 phi - helix
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119 phi - helix
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83
;
166 phi - helix
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(resid 166 and name ca)(resid 166 and name c) 1 -60.0 30.0 2
167 phi - helix
;
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98
;
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21 phi - strand
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22 phi - strand
assign (resid 21 and name c) (resid 22 and name n)
(resid 22 and name ca)(resid 22 and name c) 1 -120.0 50.0 2
23 phi - strand
assign (resid 22 and name c) (resid 23 and name n)
(resid 23 and name ca)(resid 23 and name c) 1 -120.0 50.0 2
42 phi - strand
;
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100 "44 phi - strand" 339 1 339 22 parsed_5t7c 1
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102 "80 phi - strand" 345 1 345 22 parsed_5t7c 1
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110
;
!!!! psi !!!!!
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#helix4:61-72
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#helix6:97-106
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#helix8 146-156
#helix9:166-175
#helix10:178-183
11 !psi - helix
;
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119 "29 psi - helix" 410 1 410 21 parsed_5t7c 1
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126 "36 psi - helix" 431 1 431 21 parsed_5t7c 1
127
;
45 psi - helix
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46 psi - helix
;
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146 "71 psi - helix" 494 1 494 21 parsed_5t7c 1
147 "72 psi - helix" 497 1 497 21 parsed_5t7c 1
148
;
82 psi - helix
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(resid 81 and name c)(resid 82 and name n) 1 -40.0 30.0 2
83 psi - helix
;
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150 "85 psi - helix" 509 1 509 21 parsed_5t7c 1
151 "86 psi - helix" 512 1 512 21 parsed_5t7c 1
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166
;
118 psi - helix
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(resid 117 and name c)(resid 118 and name n) 1 -40.0 30.0 2
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192
;
166 psi - helix
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201
;
178 psi - helix
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(resid 177 and name c)(resid 178 and name n) 1 -40.0 30.0 2
179 psi - helix
;
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206
;
#strand1: 21-23
#strand2:42-44
#strand3:79-81
#strand4:115-117
#strand5: 163-165
21 psi - strand
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22 psi - strand
assign (resid 21 and name n) (resid 21 and name ca)
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23 psi - strand
assign (resid 22 and name n) (resid 22 and name ca)
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42 psi - strand
;
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207 "43 psi - strand" 705 1 705 22 parsed_5t7c 1
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210 "80 psi - strand" 714 1 714 22 parsed_5t7c 1
211 "81 psi - strand" 717 1 717 22 parsed_5t7c 1
212
;
115 psi - strand
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116 psi - strand
;
720 1 723 23 parsed_5t7c 1
213 "117 psi - strand" 726 1 726 23 parsed_5t7c 1
214
;
163 psi - strand
assign (resid 162 and name n) (resid 162 and name ca)
(resid 162 and name c)(resid 163 and name n) 1 130 30.0 2
164 psi - strand
;
729 1 732 23 parsed_5t7c 1
215 "165 psi - strand" 735 1 735 23 parsed_5t7c 1
stop_
loop_
_TA_constraint_parse_err.ID
_TA_constraint_parse_err.Content
_TA_constraint_parse_err.Begin_line
_TA_constraint_parse_err.Begin_column
_TA_constraint_parse_err.End_line
_TA_constraint_parse_err.End_column
_TA_constraint_parse_err.Entry_ID
_TA_constraint_parse_err.Torsion_angle_constraint_list_ID
1 "# Restraints file 3: PhiPsiAngles.tbl" 1 1 1 37 parsed_5t7c 1
stop_
save_
save_CNS/XPLOR_distance_constraints_5
_Distance_constraint_list.Sf_category distance_constraints
_Distance_constraint_list.Entry_ID parsed_5t7c
_Distance_constraint_list.ID 3
_Distance_constraint_list.Constraint_type NOE
_Distance_constraint_list.Constraint_file_ID 1
_Distance_constraint_list.Block_ID 5
_Distance_constraint_list.Details "Generated by Wattos"
loop_
_Dist_constraint_tree.Constraint_ID
_Dist_constraint_tree.Node_ID
_Dist_constraint_tree.Down_node_ID
_Dist_constraint_tree.Right_node_ID
_Dist_constraint_tree.Logic_operation
_Dist_constraint_tree.Entry_ID
_Dist_constraint_tree.Distance_constraint_list_ID
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2 1 . . . parsed_5t7c 3
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6 1 . . . parsed_5t7c 3
7 1 . . . parsed_5t7c 3
8 1 . . . parsed_5t7c 3
9 1 . . . parsed_5t7c 3
10 1 . . . parsed_5t7c 3
11 1 . . . parsed_5t7c 3
12 1 . . . parsed_5t7c 3
13 1 . . . parsed_5t7c 3
14 1 . . . parsed_5t7c 3
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20 1 . . . parsed_5t7c 3
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23 1 . . . parsed_5t7c 3
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55 1 . . . parsed_5t7c 3
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stop_
loop_
_Dist_constraint_value.Constraint_ID
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_Dist_constraint_value.Source_experiment_ID
_Dist_constraint_value.Spectral_peak_ID
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_Dist_constraint_value.Entry_ID
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Contact the webmaster for help, if required. Thursday, April 18, 2024 9:31:58 PM GMT (wattos1)